Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPI8

FANCF, Fanconi anemia group F protein, humanhuman

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Length 374 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCFQ9NPI8 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
FANCFQ9NPI8 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
FANCFQ9NPI8 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
FANCFQ9NPI8 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
FANCFQ9NPI8 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
FANCFQ9NPI8 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
FANCFQ9NPI8 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC13.98□□□□□ -0.17
FANCFQ9NPI8 ZNF785-202ENST00000470110 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
FANCFQ9NPI8 SYNPO2L-202ENST00000394810 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
FANCFQ9NPI8 ITSN2-203ENST00000406921 4563 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
FANCFQ9NPI8 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
FANCFQ9NPI8 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
FANCFQ9NPI8 ALOX15-202ENST00000570836 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
FANCFQ9NPI8 SBF1-202ENST00000380817 8008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
FANCFQ9NPI8 SNX30-201ENST00000374232 7622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
FANCFQ9NPI8 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
FANCFQ9NPI8 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
FANCFQ9NPI8 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
FANCFQ9NPI8 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
FANCFQ9NPI8 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
FANCFQ9NPI8 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
FANCFQ9NPI8 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
FANCFQ9NPI8 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
FANCFQ9NPI8 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
FANCFQ9NPI8 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
FANCFQ9NPI8 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
FANCFQ9NPI8 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
FANCFQ9NPI8 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
FANCFQ9NPI8 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC13.98□□□□□ -0.17
FANCFQ9NPI8 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
FANCFQ9NPI8 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
FANCFQ9NPI8 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
FANCFQ9NPI8 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
FANCFQ9NPI8 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
FANCFQ9NPI8 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
FANCFQ9NPI8 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC13.98□□□□□ -0.17
FANCFQ9NPI8 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
FANCFQ9NPI8 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
FANCFQ9NPI8 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
FANCFQ9NPI8 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
FANCFQ9NPI8 CRYBG2-201ENST00000308182 5245 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
FANCFQ9NPI8 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
FANCFQ9NPI8 AC104836.1-202ENST00000636805 6041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
FANCFQ9NPI8 YTHDF3-216ENST00000623280 5193 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
FANCFQ9NPI8 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
FANCFQ9NPI8 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
FANCFQ9NPI8 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
FANCFQ9NPI8 TMPRSS6-204ENST00000406856 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
FANCFQ9NPI8 PTENP1-202ENST00000532280 3996 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
FANCFQ9NPI8 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
FANCFQ9NPI8 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
FANCFQ9NPI8 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
FANCFQ9NPI8 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
FANCFQ9NPI8 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
FANCFQ9NPI8 IKZF1-205ENST00000357364 5925 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
FANCFQ9NPI8 NEURL1-201ENST00000369780 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
FANCFQ9NPI8 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
FANCFQ9NPI8 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
FANCFQ9NPI8 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
FANCFQ9NPI8 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
FANCFQ9NPI8 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
FANCFQ9NPI8 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
FANCFQ9NPI8 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
FANCFQ9NPI8 AC139749.1-202ENST00000617529 3139 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
FANCFQ9NPI8 PPFIA3-203ENST00000602351 4341 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
FANCFQ9NPI8 NOP9-201ENST00000267425 6033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
FANCFQ9NPI8 RPP14-202ENST00000445193 7985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
FANCFQ9NPI8 SERINC2-206ENST00000536859 2072 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
FANCFQ9NPI8 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
FANCFQ9NPI8 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
FANCFQ9NPI8 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
FANCFQ9NPI8 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
FANCFQ9NPI8 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
FANCFQ9NPI8 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
FANCFQ9NPI8 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
FANCFQ9NPI8 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
FANCFQ9NPI8 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
FANCFQ9NPI8 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
FANCFQ9NPI8 USP19-203ENST00000398892 4622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
FANCFQ9NPI8 RAB18-207ENST00000535776 4811 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
FANCFQ9NPI8 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
FANCFQ9NPI8 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
FANCFQ9NPI8 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
FANCFQ9NPI8 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
FANCFQ9NPI8 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
FANCFQ9NPI8 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
FANCFQ9NPI8 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
FANCFQ9NPI8 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
FANCFQ9NPI8 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
FANCFQ9NPI8 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
FANCFQ9NPI8 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
FANCFQ9NPI8 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
FANCFQ9NPI8 WHRN-202ENST00000362057 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
FANCFQ9NPI8 NUP98-203ENST00000359171 7023 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
FANCFQ9NPI8 SCARA5-201ENST00000354914 4026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
FANCFQ9NPI8 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
FANCFQ9NPI8 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
FANCFQ9NPI8 SLC29A1-201ENST00000371708 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
FANCFQ9NPI8 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
FANCFQ9NPI8 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
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