Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX26

SYCP2, Synaptonemal complex protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP2Q9BX26 ATP6V1E1-202ENST00000399796 1208 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SYCP2Q9BX26 BX284668.5-201ENST00000422124 406 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SYCP2Q9BX26 AL807761.2-201ENST00000422849 729 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
SYCP2Q9BX26 AL589843.1-201ENST00000423924 425 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SYCP2Q9BX26 AC108199.1-201ENST00000504249 508 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SYCP2Q9BX26 ZNF350-AS1-202ENST00000600253 577 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SYCP2Q9BX26 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SYCP2Q9BX26 MANEAL-201ENST00000329006 1930 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SYCP2Q9BX26 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
SYCP2Q9BX26 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SYCP2Q9BX26 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SYCP2Q9BX26 CSRP1-201ENST00000340006 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SYCP2Q9BX26 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SYCP2Q9BX26 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SYCP2Q9BX26 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SYCP2Q9BX26 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SYCP2Q9BX26 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SYCP2Q9BX26 AMHR2-201ENST00000257863 1863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SYCP2Q9BX26 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SYCP2Q9BX26 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SYCP2Q9BX26 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
SYCP2Q9BX26 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SYCP2Q9BX26 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SYCP2Q9BX26 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SYCP2Q9BX26 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SYCP2Q9BX26 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SYCP2Q9BX26 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SYCP2Q9BX26 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SYCP2Q9BX26 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SYCP2Q9BX26 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SYCP2Q9BX26 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SYCP2Q9BX26 CRIP3-202ENST00000372569 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SYCP2Q9BX26 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SYCP2Q9BX26 OGFR-AS1-201ENST00000431361 668 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SYCP2Q9BX26 BX276092.5-201ENST00000439926 886 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SYCP2Q9BX26 AL139420.2-201ENST00000449439 410 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SYCP2Q9BX26 PIN4P1-201ENST00000451079 396 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
SYCP2Q9BX26 PGAP2-212ENST00000464906 1259 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SYCP2Q9BX26 NCK1-AS1-203ENST00000474250 827 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SYCP2Q9BX26 RN7SL818P-201ENST00000485099 259 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
SYCP2Q9BX26 PIN1-207ENST00000588695 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SYCP2Q9BX26 AC061992.1-201ENST00000592569 777 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SYCP2Q9BX26 RN7SL725P-201ENST00000606439 259 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
SYCP2Q9BX26 HIST1H2BE-201ENST00000614097 497 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SYCP2Q9BX26 AL161773.1-201ENST00000624845 863 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
SYCP2Q9BX26 KCTD1-207ENST00000580059 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SYCP2Q9BX26 MEIKIN-205ENST00000616644 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SYCP2Q9BX26 C12orf76-209ENST00000615315 1580 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SYCP2Q9BX26 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SYCP2Q9BX26 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SYCP2Q9BX26 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SYCP2Q9BX26 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SYCP2Q9BX26 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SYCP2Q9BX26 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SYCP2Q9BX26 IL1RAP-209ENST00000422940 1957 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SYCP2Q9BX26 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SYCP2Q9BX26 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SYCP2Q9BX26 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SYCP2Q9BX26 HNRNPA1P27-201ENST00000412087 955 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
SYCP2Q9BX26 AC254562.2-201ENST00000428786 667 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SYCP2Q9BX26 TREX1-202ENST00000444177 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SYCP2Q9BX26 AC018463.1-201ENST00000456674 917 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
SYCP2Q9BX26 AC026410.1-201ENST00000507366 1101 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
SYCP2Q9BX26 LINC01598-205ENST00000508763 719 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SYCP2Q9BX26 MPZL3-203ENST00000525386 973 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SYCP2Q9BX26 AC003686.1-201ENST00000550956 1034 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
SYCP2Q9BX26 AP005901.3-201ENST00000581666 415 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SYCP2Q9BX26 AC107464.3-201ENST00000609172 737 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
SYCP2Q9BX26 HIST1H4I-201ENST00000615353 1294 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SYCP2Q9BX26 RPS10-207ENST00000621356 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SYCP2Q9BX26 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SYCP2Q9BX26 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SYCP2Q9BX26 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SYCP2Q9BX26 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SYCP2Q9BX26 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SYCP2Q9BX26 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SYCP2Q9BX26 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SYCP2Q9BX26 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SYCP2Q9BX26 MAP2K6-205ENST00000589647 1512 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SYCP2Q9BX26 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SYCP2Q9BX26 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SYCP2Q9BX26 AP000552.1-203ENST00000416615 1930 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SYCP2Q9BX26 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SYCP2Q9BX26 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SYCP2Q9BX26 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SYCP2Q9BX26 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SYCP2Q9BX26 AC211486.1-201ENST00000275590 980 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SYCP2Q9BX26 CMTM5-201ENST00000339180 1173 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SYCP2Q9BX26 CMTM5-202ENST00000342473 725 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SYCP2Q9BX26 RAB25-201ENST00000361084 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SYCP2Q9BX26 CMTM5-205ENST00000397227 818 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SYCP2Q9BX26 AC012362.1-201ENST00000434906 739 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
SYCP2Q9BX26 NEU3-207ENST00000534628 746 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SYCP2Q9BX26 CMTM5-208ENST00000555731 831 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SYCP2Q9BX26 SMIM6-201ENST00000556126 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SYCP2Q9BX26 NPTN-204ENST00000562924 1094 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SYCP2Q9BX26 AC007326.1-201ENST00000604539 458 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
SYCP2Q9BX26 HIST1H4A-201ENST00000617569 312 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SYCP2Q9BX26 CYP1B1-AS1-221ENST00000627172 995 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SYCP2Q9BX26 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms