Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVL2

NUP58, Nucleoporin p58/p45, humanhuman

Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP58Q9BVL2 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NUP58Q9BVL2 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NUP58Q9BVL2 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
NUP58Q9BVL2 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NUP58Q9BVL2 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
NUP58Q9BVL2 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
NUP58Q9BVL2 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
NUP58Q9BVL2 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NUP58Q9BVL2 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NUP58Q9BVL2 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NUP58Q9BVL2 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NUP58Q9BVL2 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NUP58Q9BVL2 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
NUP58Q9BVL2 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NUP58Q9BVL2 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NUP58Q9BVL2 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NUP58Q9BVL2 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NUP58Q9BVL2 GTF2H2C-210ENST00000510979 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NUP58Q9BVL2 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NUP58Q9BVL2 PDZD4-201ENST00000164640 3689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NUP58Q9BVL2 S1PR2-201ENST00000590320 3582 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NUP58Q9BVL2 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NUP58Q9BVL2 NID1-201ENST00000264187 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NUP58Q9BVL2 NF2-205ENST00000361452 5884 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NUP58Q9BVL2 AUTS2-218ENST00000615871 4511 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NUP58Q9BVL2 LINC00667-206ENST00000582363 2935 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NUP58Q9BVL2 AC239800.3-201ENST00000424684 5243 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NUP58Q9BVL2 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NUP58Q9BVL2 ZFYVE28-201ENST00000290974 4131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NUP58Q9BVL2 RET-202ENST00000355710 5659 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NUP58Q9BVL2 ZPBP2-202ENST00000377940 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NUP58Q9BVL2 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NUP58Q9BVL2 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NUP58Q9BVL2 UNC13B-201ENST00000378495 6303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NUP58Q9BVL2 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NUP58Q9BVL2 AFF3-203ENST00000409579 4342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NUP58Q9BVL2 UCKL1-AS1-201ENST00000623569 3602 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
NUP58Q9BVL2 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NUP58Q9BVL2 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NUP58Q9BVL2 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NUP58Q9BVL2 SIGLEC9-202ENST00000440804 1960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NUP58Q9BVL2 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NUP58Q9BVL2 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NUP58Q9BVL2 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NUP58Q9BVL2 IRF2BP2-201ENST00000366609 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NUP58Q9BVL2 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NUP58Q9BVL2 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NUP58Q9BVL2 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NUP58Q9BVL2 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
NUP58Q9BVL2 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NUP58Q9BVL2 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NUP58Q9BVL2 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NUP58Q9BVL2 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NUP58Q9BVL2 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NUP58Q9BVL2 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
NUP58Q9BVL2 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NUP58Q9BVL2 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NUP58Q9BVL2 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
NUP58Q9BVL2 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NUP58Q9BVL2 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NUP58Q9BVL2 SLCO4C1-201ENST00000310954 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NUP58Q9BVL2 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NUP58Q9BVL2 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NUP58Q9BVL2 RNPS1-216ENST00000565678 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NUP58Q9BVL2 DDX50-206ENST00000610822 2510 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NUP58Q9BVL2 HPGD-202ENST00000296522 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NUP58Q9BVL2 POU5F1B-201ENST00000465342 5360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NUP58Q9BVL2 ALG1-204ENST00000588623 2671 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NUP58Q9BVL2 POLL-206ENST00000370172 2308 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NUP58Q9BVL2 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NUP58Q9BVL2 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NUP58Q9BVL2 NPHP4-201ENST00000378156 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NUP58Q9BVL2 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NUP58Q9BVL2 CHFR-204ENST00000443047 2990 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NUP58Q9BVL2 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NUP58Q9BVL2 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
NUP58Q9BVL2 GLG1-203ENST00000447066 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NUP58Q9BVL2 C1orf43-206ENST00000368521 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NUP58Q9BVL2 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NUP58Q9BVL2 TRIM45-201ENST00000256649 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NUP58Q9BVL2 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NUP58Q9BVL2 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NUP58Q9BVL2 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NUP58Q9BVL2 FER1L4-213ENST00000621044 2778 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NUP58Q9BVL2 MBD1-212ENST00000585672 2532 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NUP58Q9BVL2 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NUP58Q9BVL2 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
NUP58Q9BVL2 PSD2-201ENST00000274710 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NUP58Q9BVL2 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NUP58Q9BVL2 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NUP58Q9BVL2 ENDOD1-201ENST00000278505 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NUP58Q9BVL2 KIAA1468-202ENST00000398130 6178 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NUP58Q9BVL2 GLIS2-201ENST00000262366 4469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NUP58Q9BVL2 SLC22A12-203ENST00000377572 2887 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NUP58Q9BVL2 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NUP58Q9BVL2 COG8-206ENST00000306875 4247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NUP58Q9BVL2 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NUP58Q9BVL2 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NUP58Q9BVL2 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NUP58Q9BVL2 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms