Protein–RNA interactions for Protein: Q9BU64

CENPO, Centromere protein O, humanhuman

Predictions only

Length 300 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPOQ9BU64 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CENPOQ9BU64 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CENPOQ9BU64 LRRC20-201ENST00000355790 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CENPOQ9BU64 SLC4A7-214ENST00000455077 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CENPOQ9BU64 GPAT4-201ENST00000396987 6298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CENPOQ9BU64 FBXO42-201ENST00000375592 6202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CENPOQ9BU64 MAP2K7-203ENST00000397983 3396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CENPOQ9BU64 IL20RA-207ENST00000541547 3382 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CENPOQ9BU64 FAM120C-201ENST00000328235 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CENPOQ9BU64 CD99L2-208ENST00000613030 3742 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CENPOQ9BU64 SLC12A6-206ENST00000558589 3866 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CENPOQ9BU64 CGN-201ENST00000271636 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CENPOQ9BU64 TSPEAR-AS2-202ENST00000354333 2422 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CENPOQ9BU64 UHRF1BP1L-201ENST00000279907 5168 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CENPOQ9BU64 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CENPOQ9BU64 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CENPOQ9BU64 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CENPOQ9BU64 FZD5-201ENST00000295417 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CENPOQ9BU64 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CENPOQ9BU64 AL512306.2-201ENST00000444037 2219 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CENPOQ9BU64 PRCP-201ENST00000313010 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CENPOQ9BU64 GRIN1-203ENST00000371550 3940 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CENPOQ9BU64 RREB1-210ENST00000611109 3563 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CENPOQ9BU64 SLCO2B1-203ENST00000428359 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CENPOQ9BU64 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CENPOQ9BU64 MFNG-202ENST00000416983 2034 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CENPOQ9BU64 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CENPOQ9BU64 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CENPOQ9BU64 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CENPOQ9BU64 ASAP1-202ENST00000518721 5507 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CENPOQ9BU64 MAN2B1-203ENST00000456935 3184 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CENPOQ9BU64 P2RX3-201ENST00000263314 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CENPOQ9BU64 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CENPOQ9BU64 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CENPOQ9BU64 GTPBP1-201ENST00000216044 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CENPOQ9BU64 JARID2-201ENST00000341776 5755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CENPOQ9BU64 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CENPOQ9BU64 PGLYRP4-202ENST00000368739 2116 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CENPOQ9BU64 CAP2-209ENST00000616440 2776 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CENPOQ9BU64 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CENPOQ9BU64 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CENPOQ9BU64 MED22-209ENST00000610888 3867 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CENPOQ9BU64 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CENPOQ9BU64 SAMD15-201ENST00000216471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CENPOQ9BU64 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CENPOQ9BU64 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CENPOQ9BU64 HSPB7-201ENST00000311890 2892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CENPOQ9BU64 AC087386.2-201ENST00000623212 4637 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
CENPOQ9BU64 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CENPOQ9BU64 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CENPOQ9BU64 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CENPOQ9BU64 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CENPOQ9BU64 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CENPOQ9BU64 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CENPOQ9BU64 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CENPOQ9BU64 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
CENPOQ9BU64 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CENPOQ9BU64 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CENPOQ9BU64 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CENPOQ9BU64 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CENPOQ9BU64 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CENPOQ9BU64 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
CENPOQ9BU64 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
CENPOQ9BU64 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CENPOQ9BU64 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CENPOQ9BU64 ITSN1-212ENST00000399367 5722 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CENPOQ9BU64 DLL1-201ENST00000366756 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CENPOQ9BU64 SSTR1-201ENST00000267377 4295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CENPOQ9BU64 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CENPOQ9BU64 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CENPOQ9BU64 GLI2-203ENST00000361492 6768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CENPOQ9BU64 P2RX5-207ENST00000551178 1863 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CENPOQ9BU64 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CENPOQ9BU64 TBC1D1-201ENST00000261439 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CENPOQ9BU64 XPR1-201ENST00000367589 4126 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CENPOQ9BU64 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CENPOQ9BU64 LRP8-201ENST00000306052 7648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CENPOQ9BU64 FLNA-207ENST00000422373 8486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CENPOQ9BU64 USP49-201ENST00000373006 3177 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CENPOQ9BU64 NLRP2B-201ENST00000434992 3194 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CENPOQ9BU64 OSTM1-AS1-202ENST00000441184 3334 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CENPOQ9BU64 SDC2-201ENST00000302190 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CENPOQ9BU64 ZBED1-203ENST00000381223 4510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CENPOQ9BU64 FAM200B-201ENST00000422728 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CENPOQ9BU64 DBNDD1-203ENST00000392973 2689 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
CENPOQ9BU64 AL357054.3-201ENST00000607084 2055 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
CENPOQ9BU64 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
CENPOQ9BU64 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CENPOQ9BU64 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
CENPOQ9BU64 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
CENPOQ9BU64 AC106818.1-201ENST00000623223 3242 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
CENPOQ9BU64 NUTM2HP-201ENST00000442076 2498 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
CENPOQ9BU64 KRT75-201ENST00000252245 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CENPOQ9BU64 BEAN1-201ENST00000299694 2160 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CENPOQ9BU64 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
CENPOQ9BU64 SLC6A6P1-201ENST00000413933 1850 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
CENPOQ9BU64 RABGEF1-210ENST00000437078 4319 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
CENPOQ9BU64 CATSPERE-201ENST00000366531 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
CENPOQ9BU64 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
CENPOQ9BU64 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.1 ms