Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQD1

PMCHL2, Putative pro-MCH-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 86 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMCHL2Q9BQD1 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
PMCHL2Q9BQD1 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC11.07□□□□□ -0.64
PMCHL2Q9BQD1 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
PMCHL2Q9BQD1 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
PMCHL2Q9BQD1 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC11.07□□□□□ -0.64
PMCHL2Q9BQD1 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
PMCHL2Q9BQD1 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC11.07□□□□□ -0.64
PMCHL2Q9BQD1 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
PMCHL2Q9BQD1 SNX12-202ENST00000374274 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
PMCHL2Q9BQD1 CCNG1-202ENST00000393929 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
PMCHL2Q9BQD1 DLGAP1-213ENST00000534970 2365 ntTSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
PMCHL2Q9BQD1 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
PMCHL2Q9BQD1 FN1-201ENST00000323926 8708 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
PMCHL2Q9BQD1 TPR-201ENST00000367478 9708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
PMCHL2Q9BQD1 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
PMCHL2Q9BQD1 TCF23-201ENST00000296096 4882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
PMCHL2Q9BQD1 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
PMCHL2Q9BQD1 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
PMCHL2Q9BQD1 CC2D1A-201ENST00000318003 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
PMCHL2Q9BQD1 FNTB-201ENST00000246166 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
PMCHL2Q9BQD1 CCDC88C-204ENST00000389857 7474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
PMCHL2Q9BQD1 KRT17P5-203ENST00000445433 2333 ntTSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
PMCHL2Q9BQD1 UGP2-207ENST00000467648 2057 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
PMCHL2Q9BQD1 KRT8P24-201ENST00000560290 1559 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
PMCHL2Q9BQD1 TESMIN-204ENST00000443940 3495 ntTSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
PMCHL2Q9BQD1 MAN2B2-202ENST00000504248 2968 ntTSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
PMCHL2Q9BQD1 ZBED8-202ENST00000523213 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
PMCHL2Q9BQD1 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
PMCHL2Q9BQD1 GRIA4-201ENST00000282499 5508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
PMCHL2Q9BQD1 ACSL4-202ENST00000348502 5032 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
PMCHL2Q9BQD1 IFT81-201ENST00000242591 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
PMCHL2Q9BQD1 TBL1X-203ENST00000407597 5596 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
PMCHL2Q9BQD1 DGKD-202ENST00000409813 6228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
PMCHL2Q9BQD1 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
PMCHL2Q9BQD1 C19orf66-202ENST00000397881 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
PMCHL2Q9BQD1 UBE2F-223ENST00000612130 2135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
PMCHL2Q9BQD1 PDLIM2-201ENST00000265810 4592 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
PMCHL2Q9BQD1 CDH1-201ENST00000261769 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
PMCHL2Q9BQD1 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
PMCHL2Q9BQD1 KLHL13-209ENST00000545703 3322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
PMCHL2Q9BQD1 HOXA7-201ENST00000242159 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
PMCHL2Q9BQD1 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
PMCHL2Q9BQD1 CBLB-204ENST00000405772 3237 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
PMCHL2Q9BQD1 CAPN14-202ENST00000403897 2197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
PMCHL2Q9BQD1 C10orf105-202ENST00000441508 4836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
PMCHL2Q9BQD1 TRAF3-208ENST00000560371 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
PMCHL2Q9BQD1 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC11.06□□□□□ -0.64
PMCHL2Q9BQD1 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
PMCHL2Q9BQD1 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
PMCHL2Q9BQD1 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
PMCHL2Q9BQD1 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
PMCHL2Q9BQD1 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
PMCHL2Q9BQD1 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
PMCHL2Q9BQD1 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
PMCHL2Q9BQD1 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
PMCHL2Q9BQD1 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
PMCHL2Q9BQD1 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
PMCHL2Q9BQD1 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
PMCHL2Q9BQD1 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
PMCHL2Q9BQD1 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
PMCHL2Q9BQD1 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC11.06□□□□□ -0.64
PMCHL2Q9BQD1 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
PMCHL2Q9BQD1 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
PMCHL2Q9BQD1 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
PMCHL2Q9BQD1 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
PMCHL2Q9BQD1 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.06□□□□□ -0.64
PMCHL2Q9BQD1 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
PMCHL2Q9BQD1 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
PMCHL2Q9BQD1 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
PMCHL2Q9BQD1 USH1G-202ENST00000614341 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
PMCHL2Q9BQD1 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
PMCHL2Q9BQD1 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
PMCHL2Q9BQD1 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
PMCHL2Q9BQD1 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
PMCHL2Q9BQD1 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
PMCHL2Q9BQD1 ABCC6P1-201ENST00000546162 2943 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
PMCHL2Q9BQD1 TSEN2-202ENST00000402228 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
PMCHL2Q9BQD1 CACNA1G-209ENST00000502264 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
PMCHL2Q9BQD1 CACNA1G-221ENST00000510115 6912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
PMCHL2Q9BQD1 TTC14-202ENST00000382584 2274 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
PMCHL2Q9BQD1 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
PMCHL2Q9BQD1 SLC52A1-203ENST00000512825 2989 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
PMCHL2Q9BQD1 CACNA1G-222ENST00000510366 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
PMCHL2Q9BQD1 CACNA1G-227ENST00000513964 6735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
PMCHL2Q9BQD1 SPTSSB-201ENST00000359175 3103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
PMCHL2Q9BQD1 DYNC1I2-203ENST00000409197 2572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
PMCHL2Q9BQD1 DYNC1I2-206ENST00000409773 2583 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
PMCHL2Q9BQD1 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
PMCHL2Q9BQD1 DCAF8-201ENST00000326837 3972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
PMCHL2Q9BQD1 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
PMCHL2Q9BQD1 AC073957.3-201ENST00000609998 6758 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
PMCHL2Q9BQD1 PTH2R-201ENST00000272847 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
PMCHL2Q9BQD1 ZDHHC6-202ENST00000369405 2170 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
PMCHL2Q9BQD1 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
PMCHL2Q9BQD1 RHOH-220ENST00000615083 2156 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.06□□□□□ -0.64
PMCHL2Q9BQD1 GOSR2-235ENST00000640269 2190 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
PMCHL2Q9BQD1 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
PMCHL2Q9BQD1 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
PMCHL2Q9BQD1 PSEN2-202ENST00000366783 2306 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
PMCHL2Q9BQD1 SPATA7-217ENST00000556553 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 125.4 ms