Protein–RNA interactions for Protein: Q96ES7

SGF29, SAGA-associated factor 29, humanhuman

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Length 293 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGF29Q96ES7 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SGF29Q96ES7 PDE3B-202ENST00000455098 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SGF29Q96ES7 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SGF29Q96ES7 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SGF29Q96ES7 C9orf47-201ENST00000334490 4829 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SGF29Q96ES7 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SGF29Q96ES7 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SGF29Q96ES7 FAM122A-201ENST00000394264 4575 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SGF29Q96ES7 AUTS2-218ENST00000615871 4511 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SGF29Q96ES7 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SGF29Q96ES7 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SGF29Q96ES7 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SGF29Q96ES7 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SGF29Q96ES7 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SGF29Q96ES7 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SGF29Q96ES7 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SGF29Q96ES7 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SGF29Q96ES7 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SGF29Q96ES7 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SGF29Q96ES7 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SGF29Q96ES7 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SGF29Q96ES7 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SGF29Q96ES7 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SGF29Q96ES7 SARM1-208ENST00000585482 10309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SGF29Q96ES7 VLDLR-202ENST00000382099 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SGF29Q96ES7 ARPP19-202ENST00000561650 3245 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SGF29Q96ES7 TNFRSF11A-206ENST00000617039 3756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SGF29Q96ES7 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SGF29Q96ES7 CUL3-201ENST00000264414 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SGF29Q96ES7 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SGF29Q96ES7 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SGF29Q96ES7 SEPT8-206ENST00000378706 4168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SGF29Q96ES7 CAPN5-202ENST00000456580 2805 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SGF29Q96ES7 PCK2-203ENST00000545054 2505 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SGF29Q96ES7 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SGF29Q96ES7 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SGF29Q96ES7 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SGF29Q96ES7 KIAA1191-201ENST00000298569 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SGF29Q96ES7 CYB561-219ENST00000584031 3200 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SGF29Q96ES7 PITPNM3-201ENST00000262483 7086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SGF29Q96ES7 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SGF29Q96ES7 RLF-201ENST00000372771 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SGF29Q96ES7 AC245052.4-201ENST00000452097 4158 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SGF29Q96ES7 LARGE1-201ENST00000354992 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SGF29Q96ES7 DIAPH2-204ENST00000373054 3376 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SGF29Q96ES7 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SGF29Q96ES7 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SGF29Q96ES7 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SGF29Q96ES7 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SGF29Q96ES7 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SGF29Q96ES7 UNC13B-201ENST00000378495 6303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SGF29Q96ES7 CCDC6-201ENST00000263102 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SGF29Q96ES7 RALGDS-201ENST00000372047 3598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SGF29Q96ES7 PSD2-201ENST00000274710 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SGF29Q96ES7 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SGF29Q96ES7 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SGF29Q96ES7 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SGF29Q96ES7 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SGF29Q96ES7 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SGF29Q96ES7 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SGF29Q96ES7 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SGF29Q96ES7 SEMA4F-210ENST00000611975 6007 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SGF29Q96ES7 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SGF29Q96ES7 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SGF29Q96ES7 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SGF29Q96ES7 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SGF29Q96ES7 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SGF29Q96ES7 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SGF29Q96ES7 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SGF29Q96ES7 AL354710.2-201ENST00000468244 550 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SGF29Q96ES7 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SGF29Q96ES7 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SGF29Q96ES7 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SGF29Q96ES7 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SGF29Q96ES7 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SGF29Q96ES7 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SGF29Q96ES7 FAM46C-201ENST00000369448 5751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SGF29Q96ES7 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SGF29Q96ES7 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SGF29Q96ES7 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SGF29Q96ES7 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SGF29Q96ES7 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SGF29Q96ES7 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SGF29Q96ES7 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SGF29Q96ES7 FUK-201ENST00000288078 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SGF29Q96ES7 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SGF29Q96ES7 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SGF29Q96ES7 PCDHB13-201ENST00000341948 5061 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SGF29Q96ES7 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SGF29Q96ES7 SRRD-201ENST00000215917 4020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SGF29Q96ES7 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SGF29Q96ES7 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SGF29Q96ES7 GRK6P1-201ENST00000400595 1711 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SGF29Q96ES7 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SGF29Q96ES7 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SGF29Q96ES7 MOCS1-201ENST00000340692 2747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SGF29Q96ES7 NFATC4-206ENST00000539237 5686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SGF29Q96ES7 CYP1B1-205ENST00000610745 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SGF29Q96ES7 PUS1-202ENST00000376649 4094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SGF29Q96ES7 AGTRAP-202ENST00000376627 1055 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
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