Protein–RNA interactions for Protein: Q96CM4

NXNL1, Nucleoredoxin-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NXNL1Q96CM4 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NXNL1Q96CM4 PITPNM1-216ENST00000534749 4189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NXNL1Q96CM4 TFE3-201ENST00000315869 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NXNL1Q96CM4 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NXNL1Q96CM4 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NXNL1Q96CM4 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NXNL1Q96CM4 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NXNL1Q96CM4 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
NXNL1Q96CM4 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NXNL1Q96CM4 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
NXNL1Q96CM4 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NXNL1Q96CM4 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NXNL1Q96CM4 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
NXNL1Q96CM4 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
NXNL1Q96CM4 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NXNL1Q96CM4 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
NXNL1Q96CM4 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NXNL1Q96CM4 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
NXNL1Q96CM4 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NXNL1Q96CM4 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NXNL1Q96CM4 PAX8-AS1-204ENST00000436293 2687 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NXNL1Q96CM4 USP38-202ENST00000510377 4135 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NXNL1Q96CM4 MICAL1-201ENST00000358577 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NXNL1Q96CM4 PPP1R13L-202ENST00000418234 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NXNL1Q96CM4 HNF4G-201ENST00000354370 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NXNL1Q96CM4 SLC41A1-201ENST00000367137 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NXNL1Q96CM4 DTX3-202ENST00000548198 3199 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NXNL1Q96CM4 KCNT1-207ENST00000487664 3845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NXNL1Q96CM4 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NXNL1Q96CM4 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NXNL1Q96CM4 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NXNL1Q96CM4 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NXNL1Q96CM4 OR2I1P-209ENST00000641730 5365 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
NXNL1Q96CM4 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NXNL1Q96CM4 SARM1-208ENST00000585482 10309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NXNL1Q96CM4 ADAM15-204ENST00000359280 2874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NXNL1Q96CM4 SLC26A11-201ENST00000361193 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NXNL1Q96CM4 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NXNL1Q96CM4 RAB37-206ENST00000392615 2655 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NXNL1Q96CM4 SLC6A20-204ENST00000456124 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NXNL1Q96CM4 POU2F2-207ENST00000529067 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NXNL1Q96CM4 KIF17-201ENST00000247986 3969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NXNL1Q96CM4 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NXNL1Q96CM4 IMPACT-201ENST00000284202 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NXNL1Q96CM4 ARHGAP4-203ENST00000370028 3372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NXNL1Q96CM4 FGR-203ENST00000374005 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NXNL1Q96CM4 AP001267.2-201ENST00000532619 2086 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
NXNL1Q96CM4 ARHGAP6-204ENST00000380718 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NXNL1Q96CM4 PIDD1-201ENST00000347755 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NXNL1Q96CM4 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NXNL1Q96CM4 DNAJC21-202ENST00000382021 6208 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NXNL1Q96CM4 TMEM41B-204ENST00000528080 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NXNL1Q96CM4 RNF222-202ENST00000399398 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NXNL1Q96CM4 HTR3A-205ENST00000504030 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NXNL1Q96CM4 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NXNL1Q96CM4 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NXNL1Q96CM4 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NXNL1Q96CM4 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NXNL1Q96CM4 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NXNL1Q96CM4 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NXNL1Q96CM4 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NXNL1Q96CM4 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NXNL1Q96CM4 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
NXNL1Q96CM4 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
NXNL1Q96CM4 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NXNL1Q96CM4 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NXNL1Q96CM4 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NXNL1Q96CM4 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NXNL1Q96CM4 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NXNL1Q96CM4 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NXNL1Q96CM4 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NXNL1Q96CM4 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NXNL1Q96CM4 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
NXNL1Q96CM4 ABCB7-202ENST00000339447 2234 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NXNL1Q96CM4 C5orf66-206ENST00000624272 2479 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NXNL1Q96CM4 HNRNPUL1-201ENST00000263367 2952 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NXNL1Q96CM4 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NXNL1Q96CM4 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NXNL1Q96CM4 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
NXNL1Q96CM4 SH2D3C-206ENST00000429553 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NXNL1Q96CM4 BAG4-201ENST00000287322 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NXNL1Q96CM4 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NXNL1Q96CM4 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NXNL1Q96CM4 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NXNL1Q96CM4 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NXNL1Q96CM4 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NXNL1Q96CM4 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NXNL1Q96CM4 LINC01230-201ENST00000625222 3017 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
NXNL1Q96CM4 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NXNL1Q96CM4 MBOAT2-201ENST00000305997 7751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NXNL1Q96CM4 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NXNL1Q96CM4 CACTIN-203ENST00000429344 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NXNL1Q96CM4 CNOT10-201ENST00000328834 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NXNL1Q96CM4 GLUL-203ENST00000339526 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NXNL1Q96CM4 PAX6-202ENST00000379107 2579 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NXNL1Q96CM4 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NXNL1Q96CM4 GRIN3A-201ENST00000361820 7770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NXNL1Q96CM4 SLC7A4-202ENST00000403586 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NXNL1Q96CM4 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NXNL1Q96CM4 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms