Protein–RNA interactions for Protein: Q969G3

SMARCE1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily E member 1, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCE1Q969G3 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
SMARCE1Q969G3 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
SMARCE1Q969G3 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
SMARCE1Q969G3 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SMARCE1Q969G3 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SMARCE1Q969G3 DNAJC27-201ENST00000264711 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SMARCE1Q969G3 KHNYN-201ENST00000251343 6725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SMARCE1Q969G3 MAP3K12-201ENST00000267079 4319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SMARCE1Q969G3 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SMARCE1Q969G3 ASPG-206ENST00000551177 4851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SMARCE1Q969G3 EPHX2-207ENST00000521400 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SMARCE1Q969G3 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SMARCE1Q969G3 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SMARCE1Q969G3 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SMARCE1Q969G3 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SMARCE1Q969G3 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SMARCE1Q969G3 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SMARCE1Q969G3 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SMARCE1Q969G3 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SMARCE1Q969G3 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
SMARCE1Q969G3 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
SMARCE1Q969G3 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SMARCE1Q969G3 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
SMARCE1Q969G3 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
SMARCE1Q969G3 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SMARCE1Q969G3 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
SMARCE1Q969G3 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
SMARCE1Q969G3 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
SMARCE1Q969G3 FBXO42-201ENST00000375592 6202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SMARCE1Q969G3 FBXO41-201ENST00000295133 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SMARCE1Q969G3 TNFSF13-201ENST00000338784 1971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SMARCE1Q969G3 UBR2-201ENST00000372899 7857 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SMARCE1Q969G3 UBR2-202ENST00000372901 7857 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SMARCE1Q969G3 GTF2IRD1-205ENST00000476977 5868 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SMARCE1Q969G3 IGDCC3-201ENST00000327987 4479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SMARCE1Q969G3 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SMARCE1Q969G3 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SMARCE1Q969G3 EIF4G1-201ENST00000342981 5667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SMARCE1Q969G3 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SMARCE1Q969G3 HOXA-AS2-202ENST00000517635 2455 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SMARCE1Q969G3 SMARCA2-214ENST00000450198 5602 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SMARCE1Q969G3 SPIDR-201ENST00000297423 3988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SMARCE1Q969G3 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SMARCE1Q969G3 AUTS2-217ENST00000611706 4583 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SMARCE1Q969G3 STARD8-202ENST00000374597 4820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SMARCE1Q969G3 TJP3-207ENST00000589378 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SMARCE1Q969G3 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SMARCE1Q969G3 GPR137C-201ENST00000321662 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SMARCE1Q969G3 NCKIPSD-204ENST00000416649 2925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SMARCE1Q969G3 DDX59-206ENST00000447706 2900 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SMARCE1Q969G3 HTR3E-202ENST00000415389 2139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SMARCE1Q969G3 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SMARCE1Q969G3 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
SMARCE1Q969G3 CD93-201ENST00000246006 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SMARCE1Q969G3 RBM47-203ENST00000381795 4473 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SMARCE1Q969G3 INTS4P1-203ENST00000641008 3683 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
SMARCE1Q969G3 PCNX4-203ENST00000406854 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SMARCE1Q969G3 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SMARCE1Q969G3 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SMARCE1Q969G3 GLG1-203ENST00000447066 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SMARCE1Q969G3 SNX30-201ENST00000374232 7622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SMARCE1Q969G3 RTEL1-203ENST00000360203 4623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SMARCE1Q969G3 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SMARCE1Q969G3 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SMARCE1Q969G3 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SMARCE1Q969G3 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SMARCE1Q969G3 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SMARCE1Q969G3 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SMARCE1Q969G3 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SMARCE1Q969G3 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SMARCE1Q969G3 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SMARCE1Q969G3 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SMARCE1Q969G3 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SMARCE1Q969G3 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SMARCE1Q969G3 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SMARCE1Q969G3 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SMARCE1Q969G3 KIF7-201ENST00000394412 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SMARCE1Q969G3 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SMARCE1Q969G3 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SMARCE1Q969G3 PDE7A-203ENST00000401827 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SMARCE1Q969G3 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SMARCE1Q969G3 TNRC18-203ENST00000399537 10572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SMARCE1Q969G3 TNRC18-205ENST00000430969 10562 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SMARCE1Q969G3 GTPBP1-201ENST00000216044 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SMARCE1Q969G3 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SMARCE1Q969G3 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SMARCE1Q969G3 RNF222-202ENST00000399398 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SMARCE1Q969G3 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SMARCE1Q969G3 SLC35C1-201ENST00000314134 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SMARCE1Q969G3 SMAD2-202ENST00000356825 10445 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SMARCE1Q969G3 AC138969.2-201ENST00000532739 9932 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
SMARCE1Q969G3 PDPK1-202ENST00000342085 7241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SMARCE1Q969G3 FGD5-AS1-202ENST00000424349 3792 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SMARCE1Q969G3 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SMARCE1Q969G3 ANKEF1-201ENST00000378380 5303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SMARCE1Q969G3 MROH1-209ENST00000534366 5092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SMARCE1Q969G3 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SMARCE1Q969G3 DCUN1D2-201ENST00000332592 2626 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SMARCE1Q969G3 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SMARCE1Q969G3 SRSF8-201ENST00000587424 4028 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.2 ms