Protein–RNA interactions for Protein: Q92750

TAF4B, Transcription initiation factor TFIID subunit 4B, humanhuman

Predictions only

Length 862 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF4BQ92750 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TAF4BQ92750 TMEM189-202ENST00000371652 7714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TAF4BQ92750 SETD1B-203ENST00000604567 5969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TAF4BQ92750 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TAF4BQ92750 OTOF-202ENST00000338581 4954 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TAF4BQ92750 AC097374.1-201ENST00000568768 6624 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TAF4BQ92750 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TAF4BQ92750 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TAF4BQ92750 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
TAF4BQ92750 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TAF4BQ92750 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TAF4BQ92750 KCNT1-207ENST00000487664 3845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TAF4BQ92750 SORCS1-201ENST00000263054 7272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TAF4BQ92750 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TAF4BQ92750 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TAF4BQ92750 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TAF4BQ92750 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TAF4BQ92750 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TAF4BQ92750 GLUL-203ENST00000339526 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TAF4BQ92750 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TAF4BQ92750 KBTBD12-202ENST00000405109 5727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TAF4BQ92750 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TAF4BQ92750 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TAF4BQ92750 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TAF4BQ92750 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TAF4BQ92750 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TAF4BQ92750 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
TAF4BQ92750 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TAF4BQ92750 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TAF4BQ92750 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TAF4BQ92750 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
TAF4BQ92750 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TAF4BQ92750 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TAF4BQ92750 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TAF4BQ92750 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TAF4BQ92750 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TAF4BQ92750 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TAF4BQ92750 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
TAF4BQ92750 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TAF4BQ92750 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TAF4BQ92750 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TAF4BQ92750 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TAF4BQ92750 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TAF4BQ92750 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TAF4BQ92750 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TAF4BQ92750 FOXRED2-201ENST00000216187 3933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TAF4BQ92750 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TAF4BQ92750 FLI1-205ENST00000527786 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TAF4BQ92750 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TAF4BQ92750 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TAF4BQ92750 GTF2I-212ENST00000573035 4548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TAF4BQ92750 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TAF4BQ92750 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TAF4BQ92750 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TAF4BQ92750 HBP1-201ENST00000222574 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TAF4BQ92750 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TAF4BQ92750 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TAF4BQ92750 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
TAF4BQ92750 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TAF4BQ92750 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TAF4BQ92750 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TAF4BQ92750 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TAF4BQ92750 NUP50-201ENST00000347635 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TAF4BQ92750 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TAF4BQ92750 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TAF4BQ92750 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TAF4BQ92750 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TAF4BQ92750 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TAF4BQ92750 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TAF4BQ92750 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TAF4BQ92750 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TAF4BQ92750 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TAF4BQ92750 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TAF4BQ92750 TCOF1-201ENST00000323668 4832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TAF4BQ92750 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TAF4BQ92750 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TAF4BQ92750 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TAF4BQ92750 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TAF4BQ92750 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TAF4BQ92750 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TAF4BQ92750 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TAF4BQ92750 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TAF4BQ92750 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TAF4BQ92750 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
TAF4BQ92750 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TAF4BQ92750 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
TAF4BQ92750 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TAF4BQ92750 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TAF4BQ92750 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TAF4BQ92750 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TAF4BQ92750 BCAR1-204ENST00000418647 3387 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TAF4BQ92750 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TAF4BQ92750 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TAF4BQ92750 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
TAF4BQ92750 C15orf59-204ENST00000569673 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
TAF4BQ92750 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
TAF4BQ92750 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
TAF4BQ92750 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
TAF4BQ92750 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
TAF4BQ92750 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms