Protein–RNA interactions for Protein: Q8WW27

APOBEC4, Putative C->U-editing enzyme APOBEC-4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 367 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC4Q8WW27 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
APOBEC4Q8WW27 AC080129.2-201ENST00000418353 430 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
APOBEC4Q8WW27 AC007731.4-201ENST00000420225 652 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
APOBEC4Q8WW27 C1QTNF6-203ENST00000434784 975 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
APOBEC4Q8WW27 SELENOW-201ENST00000509570 881 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
APOBEC4Q8WW27 GTF2H2C-215ENST00000514162 610 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
APOBEC4Q8WW27 AC011365.2-201ENST00000520041 810 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
APOBEC4Q8WW27 AP002748.3-205ENST00000525142 567 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
APOBEC4Q8WW27 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
APOBEC4Q8WW27 AP002748.3-203ENST00000533502 581 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
APOBEC4Q8WW27 AC026495.1-203ENST00000557528 906 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
APOBEC4Q8WW27 TMEM219-203ENST00000561899 1249 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
APOBEC4Q8WW27 DBNDD1-206ENST00000568838 993 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
APOBEC4Q8WW27 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
APOBEC4Q8WW27 AL358473.2-201ENST00000610411 556 ntTSL 4 BASIC14.52□□□□□ -0.09
APOBEC4Q8WW27 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
APOBEC4Q8WW27 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
APOBEC4Q8WW27 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
APOBEC4Q8WW27 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
APOBEC4Q8WW27 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
APOBEC4Q8WW27 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
APOBEC4Q8WW27 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
APOBEC4Q8WW27 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
APOBEC4Q8WW27 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
APOBEC4Q8WW27 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
APOBEC4Q8WW27 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
APOBEC4Q8WW27 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
APOBEC4Q8WW27 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
APOBEC4Q8WW27 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
APOBEC4Q8WW27 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
APOBEC4Q8WW27 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
APOBEC4Q8WW27 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
APOBEC4Q8WW27 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
APOBEC4Q8WW27 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
APOBEC4Q8WW27 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
APOBEC4Q8WW27 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
APOBEC4Q8WW27 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
APOBEC4Q8WW27 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
APOBEC4Q8WW27 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
APOBEC4Q8WW27 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
APOBEC4Q8WW27 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
APOBEC4Q8WW27 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
APOBEC4Q8WW27 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
APOBEC4Q8WW27 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
APOBEC4Q8WW27 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
APOBEC4Q8WW27 EIF4EBP3-201ENST00000310331 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
APOBEC4Q8WW27 FCGR1B-203ENST00000369384 1044 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
APOBEC4Q8WW27 RPL13A-201ENST00000391857 1181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
APOBEC4Q8WW27 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
APOBEC4Q8WW27 AC092614.1-201ENST00000419640 909 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
APOBEC4Q8WW27 CNN2P8-201ENST00000421872 913 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
APOBEC4Q8WW27 GLYCTK-203ENST00000461183 889 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
APOBEC4Q8WW27 ZNF527-203ENST00000483919 1142 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
APOBEC4Q8WW27 AC080188.2-201ENST00000508985 552 ntTSL 4 BASIC14.51□□□□□ -0.09
APOBEC4Q8WW27 AC005833.2-201ENST00000527518 1249 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
APOBEC4Q8WW27 C1RL-212ENST00000545337 813 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
APOBEC4Q8WW27 C2orf69P2-201ENST00000562032 1123 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
APOBEC4Q8WW27 AL031600.1-201ENST00000563610 570 ntTSL 4 BASIC14.51□□□□□ -0.09
APOBEC4Q8WW27 AP005329.1-201ENST00000578800 1035 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
APOBEC4Q8WW27 AL121944.1-201ENST00000605945 686 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
APOBEC4Q8WW27 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
APOBEC4Q8WW27 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
APOBEC4Q8WW27 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
APOBEC4Q8WW27 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
APOBEC4Q8WW27 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
APOBEC4Q8WW27 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
APOBEC4Q8WW27 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
APOBEC4Q8WW27 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
APOBEC4Q8WW27 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
APOBEC4Q8WW27 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
APOBEC4Q8WW27 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
APOBEC4Q8WW27 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
APOBEC4Q8WW27 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
APOBEC4Q8WW27 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
APOBEC4Q8WW27 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
APOBEC4Q8WW27 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
APOBEC4Q8WW27 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
APOBEC4Q8WW27 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
APOBEC4Q8WW27 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
APOBEC4Q8WW27 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
APOBEC4Q8WW27 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
APOBEC4Q8WW27 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
APOBEC4Q8WW27 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
APOBEC4Q8WW27 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
APOBEC4Q8WW27 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
APOBEC4Q8WW27 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
APOBEC4Q8WW27 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
APOBEC4Q8WW27 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
APOBEC4Q8WW27 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
APOBEC4Q8WW27 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
APOBEC4Q8WW27 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
APOBEC4Q8WW27 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
APOBEC4Q8WW27 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
APOBEC4Q8WW27 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
APOBEC4Q8WW27 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
APOBEC4Q8WW27 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
APOBEC4Q8WW27 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
APOBEC4Q8WW27 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
APOBEC4Q8WW27 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
APOBEC4Q8WW27 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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