Protein–RNA interactions for Protein: Q8N205

SYNE4, Nesprin-4, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNE4Q8N205 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SYNE4Q8N205 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SYNE4Q8N205 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SYNE4Q8N205 ACOT7-203ENST00000377845 1432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SYNE4Q8N205 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SYNE4Q8N205 TUBA3D-201ENST00000321253 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SYNE4Q8N205 ATP6AP2-213ENST00000636251 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SYNE4Q8N205 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SYNE4Q8N205 NDUFB8-201ENST00000299166 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SYNE4Q8N205 MRPL43-206ENST00000370236 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SYNE4Q8N205 MRPL43-207ENST00000370241 824 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SYNE4Q8N205 CSH2-203ENST00000392886 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SYNE4Q8N205 SUMO1-204ENST00000409181 784 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SYNE4Q8N205 SUMO1-207ENST00000409498 779 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SYNE4Q8N205 NIF3L1-205ENST00000409588 1269 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SYNE4Q8N205 LINC01118-202ENST00000409912 1023 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SYNE4Q8N205 LINC01352-201ENST00000431347 962 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SYNE4Q8N205 AP000356.1-201ENST00000438893 364 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SYNE4Q8N205 AL139010.1-202ENST00000452528 1041 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SYNE4Q8N205 CD63-214ENST00000552692 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SYNE4Q8N205 CSH2-206ENST00000560142 749 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SYNE4Q8N205 PRKXP1-201ENST00000561423 1122 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
SYNE4Q8N205 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SYNE4Q8N205 AC005324.6-201ENST00000587972 613 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
SYNE4Q8N205 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SYNE4Q8N205 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SYNE4Q8N205 KAAG1-201ENST00000274766 1382 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SYNE4Q8N205 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SYNE4Q8N205 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
SYNE4Q8N205 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SYNE4Q8N205 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SYNE4Q8N205 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SYNE4Q8N205 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SYNE4Q8N205 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SYNE4Q8N205 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
SYNE4Q8N205 AL138725.1-201ENST00000407347 1314 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
SYNE4Q8N205 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SYNE4Q8N205 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SYNE4Q8N205 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SYNE4Q8N205 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SYNE4Q8N205 SHC1P1-201ENST00000425230 1745 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
SYNE4Q8N205 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SYNE4Q8N205 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SYNE4Q8N205 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SYNE4Q8N205 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SYNE4Q8N205 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SYNE4Q8N205 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SYNE4Q8N205 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SYNE4Q8N205 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SYNE4Q8N205 AC011450.1-202ENST00000358234 573 ntTSL 4 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SYNE4Q8N205 GATD1-203ENST00000397472 790 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SYNE4Q8N205 NUP210P1-202ENST00000504322 710 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
SYNE4Q8N205 AC024681.1-201ENST00000521917 487 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
SYNE4Q8N205 ADIG-204ENST00000537425 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SYNE4Q8N205 MRPL51-202ENST00000537701 601 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SYNE4Q8N205 C12orf73-211ENST00000553183 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SYNE4Q8N205 C14orf132-202ENST00000553782 536 ntTSL 4 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SYNE4Q8N205 C1QTNF1-AS1-202ENST00000581579 865 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SYNE4Q8N205 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
SYNE4Q8N205 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SYNE4Q8N205 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SYNE4Q8N205 BCL2L13-206ENST00000399782 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SYNE4Q8N205 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
SYNE4Q8N205 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SYNE4Q8N205 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SYNE4Q8N205 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SYNE4Q8N205 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SYNE4Q8N205 SMARCE1-205ENST00000431889 1569 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SYNE4Q8N205 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SYNE4Q8N205 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SYNE4Q8N205 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SYNE4Q8N205 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SYNE4Q8N205 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SYNE4Q8N205 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SYNE4Q8N205 CXorf40B-202ENST00000370404 1316 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SYNE4Q8N205 UBXN11-207ENST00000374223 1312 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SYNE4Q8N205 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SYNE4Q8N205 RCHY1-202ENST00000380840 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SYNE4Q8N205 ASB3-202ENST00000394717 1734 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SYNE4Q8N205 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SYNE4Q8N205 CERS3-202ENST00000394113 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SYNE4Q8N205 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SYNE4Q8N205 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SYNE4Q8N205 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SYNE4Q8N205 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SYNE4Q8N205 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SYNE4Q8N205 RDH5-201ENST00000257895 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SYNE4Q8N205 MRPS12-201ENST00000308018 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SYNE4Q8N205 TPRKB-202ENST00000318190 819 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SYNE4Q8N205 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SYNE4Q8N205 AL645608.5-201ENST00000398216 443 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SYNE4Q8N205 RPL17P11-201ENST00000417593 544 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
SYNE4Q8N205 AC060234.1-201ENST00000422966 474 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SYNE4Q8N205 ARMCX3-AS1-201ENST00000454228 490 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SYNE4Q8N205 RPL18P13-201ENST00000478088 569 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
SYNE4Q8N205 ORAOV1-211ENST00000542341 775 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SYNE4Q8N205 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SYNE4Q8N205 RDH5-204ENST00000548082 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SYNE4Q8N205 AC093525.1-201ENST00000569317 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SYNE4Q8N205 AC026740.1-201ENST00000607068 791 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
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