Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZUS6

CCDC149, Coiled-coil domain-containing protein 149, humanhuman

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Length 474 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC149Q6ZUS6 UCHL1-207ENST00000508768 827 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC149Q6ZUS6 NDUFC1-210ENST00000539387 725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC149Q6ZUS6 AC025259.3-202ENST00000564363 687 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC149Q6ZUS6 GLIS2-AS1-201ENST00000576080 340 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC149Q6ZUS6 MFSD11-218ENST00000591864 446 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC149Q6ZUS6 AP001002.3-201ENST00000623482 206 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC149Q6ZUS6 MEF2C-227ENST00000626391 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC149Q6ZUS6 MEF2C-231ENST00000628656 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC149Q6ZUS6 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC149Q6ZUS6 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC149Q6ZUS6 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC149Q6ZUS6 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC149Q6ZUS6 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC149Q6ZUS6 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC149Q6ZUS6 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC149Q6ZUS6 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC149Q6ZUS6 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC149Q6ZUS6 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC149Q6ZUS6 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC149Q6ZUS6 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC149Q6ZUS6 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC149Q6ZUS6 CLUHP2-201ENST00000426660 1303 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC149Q6ZUS6 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC149Q6ZUS6 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC149Q6ZUS6 CAP2-206ENST00000489374 1430 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC149Q6ZUS6 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC149Q6ZUS6 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC149Q6ZUS6 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC149Q6ZUS6 MAGEA4-205ENST00000393920 1721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC149Q6ZUS6 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC149Q6ZUS6 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC149Q6ZUS6 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC149Q6ZUS6 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC149Q6ZUS6 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC149Q6ZUS6 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC149Q6ZUS6 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC149Q6ZUS6 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC149Q6ZUS6 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC149Q6ZUS6 AKIP1-201ENST00000299576 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC149Q6ZUS6 TMEM256-201ENST00000302422 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC149Q6ZUS6 SDCCAG3P2-201ENST00000326105 1023 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC149Q6ZUS6 NFYC-202ENST00000372651 1202 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC149Q6ZUS6 SMS-201ENST00000379404 1174 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC149Q6ZUS6 PFDN6-204ENST00000395131 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC149Q6ZUS6 BUD31-202ENST00000403633 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC149Q6ZUS6 DLGAP4-AS1-202ENST00000433238 593 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC149Q6ZUS6 LINC02028-203ENST00000443776 453 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC149Q6ZUS6 HIST2H2BB-201ENST00000449108 381 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC149Q6ZUS6 RPS2P36-201ENST00000456516 831 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC149Q6ZUS6 AC005740.2-201ENST00000511085 419 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC149Q6ZUS6 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC149Q6ZUS6 TMBIM4-205ENST00000535812 766 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC149Q6ZUS6 MSRB3-209ENST00000540804 884 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC149Q6ZUS6 ZNF385A-213ENST00000551771 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC149Q6ZUS6 TMBIM4-212ENST00000556010 610 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC149Q6ZUS6 AC110285.3-201ENST00000574472 665 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC149Q6ZUS6 AC105105.3-201ENST00000585470 646 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC149Q6ZUS6 AC011447.3-201ENST00000590606 722 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC149Q6ZUS6 AC128714.1-201ENST00000637035 887 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC149Q6ZUS6 FGFR1OP-201ENST00000349556 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC149Q6ZUS6 GNAI2-207ENST00000451956 1486 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC149Q6ZUS6 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC149Q6ZUS6 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC149Q6ZUS6 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC149Q6ZUS6 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC149Q6ZUS6 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC149Q6ZUS6 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC149Q6ZUS6 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC149Q6ZUS6 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC149Q6ZUS6 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC149Q6ZUS6 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC149Q6ZUS6 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC149Q6ZUS6 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC149Q6ZUS6 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC149Q6ZUS6 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC149Q6ZUS6 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC149Q6ZUS6 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC149Q6ZUS6 AL365209.1-201ENST00000624418 6473 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC149Q6ZUS6 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC149Q6ZUS6 UGGT2-204ENST00000397618 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC149Q6ZUS6 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC149Q6ZUS6 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC149Q6ZUS6 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC149Q6ZUS6 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC149Q6ZUS6 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC149Q6ZUS6 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC149Q6ZUS6 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC149Q6ZUS6 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC149Q6ZUS6 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC149Q6ZUS6 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC149Q6ZUS6 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC149Q6ZUS6 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC149Q6ZUS6 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC149Q6ZUS6 B9D1-202ENST00000268841 755 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC149Q6ZUS6 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC149Q6ZUS6 C9orf24-201ENST00000297623 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC149Q6ZUS6 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC149Q6ZUS6 CSNK2B-201ENST00000375865 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC149Q6ZUS6 C9orf24-205ENST00000379133 712 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC149Q6ZUS6 TMEM243-202ENST00000423734 601 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
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