Protein–RNA interactions for Protein: Q6XPS3

TPTE2, Phosphatidylinositol 3,4,5-trisphosphate 3-phosphatase TPTE2, humanhuman

Predictions only

Length 522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPTE2Q6XPS3 NCR3-204ENST00000376073 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TPTE2Q6XPS3 VCPKMT-201ENST00000395859 795 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TPTE2Q6XPS3 AC026316.1-201ENST00000398900 414 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
TPTE2Q6XPS3 AL139412.1-202ENST00000452465 675 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TPTE2Q6XPS3 AC008406.1-201ENST00000509530 541 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TPTE2Q6XPS3 IGLV3-15-201ENST00000518356 244 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
TPTE2Q6XPS3 POU5F1P2-201ENST00000521750 823 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
TPTE2Q6XPS3 CCNC-217ENST00000523985 958 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TPTE2Q6XPS3 SAP25-201ENST00000538735 837 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TPTE2Q6XPS3 NR2C2AP-207ENST00000544883 899 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TPTE2Q6XPS3 LINC01475-201ENST00000548010 766 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TPTE2Q6XPS3 AC005901.1-201ENST00000592766 552 ntTSL 4 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TPTE2Q6XPS3 IRF3-215ENST00000596822 823 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TPTE2Q6XPS3 AC103691.2-201ENST00000618824 433 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
TPTE2Q6XPS3 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TPTE2Q6XPS3 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TPTE2Q6XPS3 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TPTE2Q6XPS3 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
TPTE2Q6XPS3 TMEM106A-202ENST00000541594 1330 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TPTE2Q6XPS3 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TPTE2Q6XPS3 ATP6AP2-213ENST00000636251 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TPTE2Q6XPS3 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TPTE2Q6XPS3 CTCFL-210ENST00000481655 1512 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TPTE2Q6XPS3 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TPTE2Q6XPS3 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TPTE2Q6XPS3 LINC02405-201ENST00000512624 1361 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TPTE2Q6XPS3 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
TPTE2Q6XPS3 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TPTE2Q6XPS3 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TPTE2Q6XPS3 MAGEB2-201ENST00000378988 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TPTE2Q6XPS3 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TPTE2Q6XPS3 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TPTE2Q6XPS3 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TPTE2Q6XPS3 MYL12B-201ENST00000237500 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TPTE2Q6XPS3 LYPLA2-202ENST00000374502 1072 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TPTE2Q6XPS3 FAM3B-203ENST00000398647 864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TPTE2Q6XPS3 FAM3B-204ENST00000398652 1125 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TPTE2Q6XPS3 AC093627.5-203ENST00000497320 746 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TPTE2Q6XPS3 SCARNA21-201ENST00000517026 139 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
TPTE2Q6XPS3 ERICH5-202ENST00000545282 596 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TPTE2Q6XPS3 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TPTE2Q6XPS3 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TPTE2Q6XPS3 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TPTE2Q6XPS3 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TPTE2Q6XPS3 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TPTE2Q6XPS3 BNIP1-201ENST00000231668 1339 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TPTE2Q6XPS3 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TPTE2Q6XPS3 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TPTE2Q6XPS3 AL022326.1-201ENST00000434516 1778 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TPTE2Q6XPS3 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TPTE2Q6XPS3 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TPTE2Q6XPS3 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TPTE2Q6XPS3 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TPTE2Q6XPS3 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TPTE2Q6XPS3 FOXO4-201ENST00000341558 1353 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TPTE2Q6XPS3 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TPTE2Q6XPS3 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TPTE2Q6XPS3 TAMM41-205ENST00000444133 1619 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TPTE2Q6XPS3 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TPTE2Q6XPS3 KIAA1614-AS1-201ENST00000415647 1440 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TPTE2Q6XPS3 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TPTE2Q6XPS3 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TPTE2Q6XPS3 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TPTE2Q6XPS3 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TPTE2Q6XPS3 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TPTE2Q6XPS3 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TPTE2Q6XPS3 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TPTE2Q6XPS3 ASB3-202ENST00000394717 1734 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TPTE2Q6XPS3 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TPTE2Q6XPS3 PDZK1IP1-201ENST00000294338 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TPTE2Q6XPS3 SPDYE4-201ENST00000328794 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TPTE2Q6XPS3 COX8C-201ENST00000342144 533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TPTE2Q6XPS3 AC073150.1-201ENST00000450406 1084 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
TPTE2Q6XPS3 MBP-227ENST00000526111 581 ntTSL 4 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TPTE2Q6XPS3 IQSEC3P1-201ENST00000538799 536 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
TPTE2Q6XPS3 MIR4754-201ENST00000582477 89 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
TPTE2Q6XPS3 AC011466.3-201ENST00000596563 852 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TPTE2Q6XPS3 DYRK1B-208ENST00000601972 772 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TPTE2Q6XPS3 TLDC2-203ENST00000602922 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TPTE2Q6XPS3 Z98259.2-201ENST00000641583 609 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
TPTE2Q6XPS3 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TPTE2Q6XPS3 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TPTE2Q6XPS3 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TPTE2Q6XPS3 NFIX-208ENST00000587260 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TPTE2Q6XPS3 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TPTE2Q6XPS3 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TPTE2Q6XPS3 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TPTE2Q6XPS3 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TPTE2Q6XPS3 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TPTE2Q6XPS3 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TPTE2Q6XPS3 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TPTE2Q6XPS3 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TPTE2Q6XPS3 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TPTE2Q6XPS3 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TPTE2Q6XPS3 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TPTE2Q6XPS3 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TPTE2Q6XPS3 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TPTE2Q6XPS3 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
TPTE2Q6XPS3 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
TPTE2Q6XPS3 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.3 ms