Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXF1

TMEM108, Transmembrane protein 108, humanhuman

Predictions only

Length 575 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM108Q6UXF1 MPV17-205ENST00000402310 906 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
TMEM108Q6UXF1 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
TMEM108Q6UXF1 U82695.1-202ENST00000428676 700 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
TMEM108Q6UXF1 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
TMEM108Q6UXF1 FDPS-203ENST00000447866 1256 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
TMEM108Q6UXF1 RPARP-AS1-201ENST00000473970 1297 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
TMEM108Q6UXF1 AC078819.1-201ENST00000547454 765 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
TMEM108Q6UXF1 AC012085.1-201ENST00000548270 765 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
TMEM108Q6UXF1 AC010491.1-202ENST00000567048 528 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
TMEM108Q6UXF1 RN7SL219P-201ENST00000582872 296 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
TMEM108Q6UXF1 AL354740.1-203ENST00000593917 424 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
TMEM108Q6UXF1 ETV2-208ENST00000621247 941 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
TMEM108Q6UXF1 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
TMEM108Q6UXF1 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
TMEM108Q6UXF1 ACP2-205ENST00000527256 1499 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
TMEM108Q6UXF1 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
TMEM108Q6UXF1 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
TMEM108Q6UXF1 CDS2-203ENST00000460006 9298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
TMEM108Q6UXF1 CCDC50-201ENST00000392455 8429 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
TMEM108Q6UXF1 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
TMEM108Q6UXF1 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
TMEM108Q6UXF1 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
TMEM108Q6UXF1 EEF1A1-202ENST00000316292 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
TMEM108Q6UXF1 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
TMEM108Q6UXF1 CAMSAP1-203ENST00000409386 5730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
TMEM108Q6UXF1 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
TMEM108Q6UXF1 IRF2BP2-201ENST00000366609 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
TMEM108Q6UXF1 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
TMEM108Q6UXF1 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
TMEM108Q6UXF1 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
TMEM108Q6UXF1 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
TMEM108Q6UXF1 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
TMEM108Q6UXF1 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
TMEM108Q6UXF1 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
TMEM108Q6UXF1 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
TMEM108Q6UXF1 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
TMEM108Q6UXF1 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
TMEM108Q6UXF1 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
TMEM108Q6UXF1 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
TMEM108Q6UXF1 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
TMEM108Q6UXF1 TTC28-AS1-207ENST00000428584 5859 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
TMEM108Q6UXF1 DENND5B-202ENST00000389082 9470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
TMEM108Q6UXF1 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
TMEM108Q6UXF1 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
TMEM108Q6UXF1 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
TMEM108Q6UXF1 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
TMEM108Q6UXF1 CTIF-202ENST00000382998 4407 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
TMEM108Q6UXF1 LINC00593-202ENST00000560853 1483 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
TMEM108Q6UXF1 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
TMEM108Q6UXF1 SEC16A-202ENST00000290037 8982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
TMEM108Q6UXF1 UPK3A-201ENST00000216211 1051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
TMEM108Q6UXF1 BST2-201ENST00000252593 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
TMEM108Q6UXF1 NPPC-201ENST00000295440 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
TMEM108Q6UXF1 CDK2-202ENST00000354056 1260 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
TMEM108Q6UXF1 SPAG11B-203ENST00000359758 612 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
TMEM108Q6UXF1 UBE2T-201ENST00000367274 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
TMEM108Q6UXF1 C9orf16-201ENST00000372994 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
TMEM108Q6UXF1 AC099552.2-201ENST00000418523 456 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
TMEM108Q6UXF1 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
TMEM108Q6UXF1 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
TMEM108Q6UXF1 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
TMEM108Q6UXF1 Z94721.1-201ENST00000444102 385 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
TMEM108Q6UXF1 H2AFV-207ENST00000446531 1041 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
TMEM108Q6UXF1 KLC4-205ENST00000458460 1251 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
TMEM108Q6UXF1 LYRM9-204ENST00000503642 432 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
TMEM108Q6UXF1 AC092658.1-201ENST00000505836 891 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
TMEM108Q6UXF1 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
TMEM108Q6UXF1 AL133153.2-201ENST00000557524 303 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
TMEM108Q6UXF1 AF111167.2-202ENST00000558267 599 ntTSL 4 BASIC13.19□□□□□ -0.3
TMEM108Q6UXF1 AC091891.1-201ENST00000560688 688 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
TMEM108Q6UXF1 DUX4L45-201ENST00000566406 1057 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
TMEM108Q6UXF1 AC005597.1-201ENST00000588092 420 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
TMEM108Q6UXF1 ENPP7P14-201ENST00000621765 1040 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
TMEM108Q6UXF1 AL391650.2-201ENST00000640097 941 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
TMEM108Q6UXF1 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
TMEM108Q6UXF1 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
TMEM108Q6UXF1 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
TMEM108Q6UXF1 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
TMEM108Q6UXF1 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
TMEM108Q6UXF1 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC13.19□□□□□ -0.3
TMEM108Q6UXF1 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
TMEM108Q6UXF1 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
TMEM108Q6UXF1 SYNPO2L-202ENST00000394810 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
TMEM108Q6UXF1 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
TMEM108Q6UXF1 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
TMEM108Q6UXF1 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
TMEM108Q6UXF1 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
TMEM108Q6UXF1 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
TMEM108Q6UXF1 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
TMEM108Q6UXF1 PRG2-202ENST00000525955 1367 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
TMEM108Q6UXF1 ACTN2-206ENST00000542672 4906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
TMEM108Q6UXF1 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
TMEM108Q6UXF1 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
TMEM108Q6UXF1 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
TMEM108Q6UXF1 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
TMEM108Q6UXF1 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
TMEM108Q6UXF1 ATXN7-201ENST00000295900 7224 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
TMEM108Q6UXF1 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
TMEM108Q6UXF1 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
TMEM108Q6UXF1 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.7 ms