Protein–RNA interactions for Protein: Q6AI12

ANKRD40, Ankyrin repeat domain-containing protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 368 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD40Q6AI12 LINC00839-202ENST00000429940 2253 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ANKRD40Q6AI12 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ANKRD40Q6AI12 MOCS1-205ENST00000373195 2852 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ANKRD40Q6AI12 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ANKRD40Q6AI12 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ANKRD40Q6AI12 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ANKRD40Q6AI12 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ANKRD40Q6AI12 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ANKRD40Q6AI12 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ANKRD40Q6AI12 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ANKRD40Q6AI12 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ANKRD40Q6AI12 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ANKRD40Q6AI12 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
ANKRD40Q6AI12 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ANKRD40Q6AI12 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ANKRD40Q6AI12 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ANKRD40Q6AI12 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ANKRD40Q6AI12 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
ANKRD40Q6AI12 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ANKRD40Q6AI12 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ANKRD40Q6AI12 SLC6A20-204ENST00000456124 2662 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ANKRD40Q6AI12 BCL10-201ENST00000370580 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ANKRD40Q6AI12 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ANKRD40Q6AI12 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ANKRD40Q6AI12 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ANKRD40Q6AI12 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ANKRD40Q6AI12 GPSM1-202ENST00000354753 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ANKRD40Q6AI12 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ANKRD40Q6AI12 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ANKRD40Q6AI12 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ANKRD40Q6AI12 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
ANKRD40Q6AI12 FGR-203ENST00000374005 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ANKRD40Q6AI12 SCAP-206ENST00000428413 3749 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ANKRD40Q6AI12 AP001267.2-201ENST00000532619 2086 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
ANKRD40Q6AI12 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ANKRD40Q6AI12 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ANKRD40Q6AI12 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ANKRD40Q6AI12 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ANKRD40Q6AI12 WDR20-202ENST00000322340 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ANKRD40Q6AI12 SV2A-201ENST00000369145 2903 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ANKRD40Q6AI12 C16orf52-202ENST00000542527 4360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ANKRD40Q6AI12 GGT1-201ENST00000248923 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ANKRD40Q6AI12 TELO2-201ENST00000262319 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ANKRD40Q6AI12 SLC1A7-206ENST00000620347 2873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ANKRD40Q6AI12 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ANKRD40Q6AI12 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
ANKRD40Q6AI12 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
ANKRD40Q6AI12 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
ANKRD40Q6AI12 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ANKRD40Q6AI12 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ANKRD40Q6AI12 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ANKRD40Q6AI12 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ANKRD40Q6AI12 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ANKRD40Q6AI12 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ANKRD40Q6AI12 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ANKRD40Q6AI12 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
ANKRD40Q6AI12 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ANKRD40Q6AI12 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ANKRD40Q6AI12 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ANKRD40Q6AI12 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ANKRD40Q6AI12 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ANKRD40Q6AI12 CA10-201ENST00000285273 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ANKRD40Q6AI12 LPAR5-201ENST00000329858 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ANKRD40Q6AI12 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ANKRD40Q6AI12 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ANKRD40Q6AI12 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ANKRD40Q6AI12 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
ANKRD40Q6AI12 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ANKRD40Q6AI12 GJD2-201ENST00000290374 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ANKRD40Q6AI12 AP001627.1-201ENST00000437426 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ANKRD40Q6AI12 PDE3B-202ENST00000455098 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ANKRD40Q6AI12 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ANKRD40Q6AI12 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ANKRD40Q6AI12 TPD52-201ENST00000379096 4041 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ANKRD40Q6AI12 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ANKRD40Q6AI12 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ANKRD40Q6AI12 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ANKRD40Q6AI12 SCFD2-201ENST00000388940 2221 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ANKRD40Q6AI12 IMPDH1-201ENST00000338791 2881 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ANKRD40Q6AI12 IMPDH1-217ENST00000626419 2862 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ANKRD40Q6AI12 TFAP2A-213ENST00000482890 2071 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ANKRD40Q6AI12 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ANKRD40Q6AI12 PNMA1-201ENST00000316836 2590 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ANKRD40Q6AI12 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ANKRD40Q6AI12 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ANKRD40Q6AI12 STIP1-207ENST00000538945 1900 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ANKRD40Q6AI12 PFKFB4-201ENST00000232375 3586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ANKRD40Q6AI12 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ANKRD40Q6AI12 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ANKRD40Q6AI12 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ANKRD40Q6AI12 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ANKRD40Q6AI12 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ANKRD40Q6AI12 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ANKRD40Q6AI12 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ANKRD40Q6AI12 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ANKRD40Q6AI12 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
ANKRD40Q6AI12 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
ANKRD40Q6AI12 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
ANKRD40Q6AI12 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ANKRD40Q6AI12 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms