Protein–RNA interactions for Protein: Q53G59

KLHL12, Kelch-like protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 568 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL12Q53G59 CD8A-203ENST00000409511 3048 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
KLHL12Q53G59 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
KLHL12Q53G59 RNF170-209ENST00000534961 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
KLHL12Q53G59 AC140479.7-201ENST00000636301 2332 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
KLHL12Q53G59 FBXL16-201ENST00000324361 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
KLHL12Q53G59 MCM9-202ENST00000316316 5101 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
KLHL12Q53G59 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
KLHL12Q53G59 NEDD4L-238ENST00000635997 4402 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
KLHL12Q53G59 TBC1D22A-201ENST00000337137 3787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
KLHL12Q53G59 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
KLHL12Q53G59 SEMA4D-204ENST00000420101 1837 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
KLHL12Q53G59 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
KLHL12Q53G59 LTB4R-203ENST00000396789 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
KLHL12Q53G59 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
KLHL12Q53G59 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
KLHL12Q53G59 ATP2A3-202ENST00000352011 3274 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
KLHL12Q53G59 PPP2R1A-201ENST00000322088 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
KLHL12Q53G59 GREM1-202ENST00000560830 2648 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
KLHL12Q53G59 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
KLHL12Q53G59 VWCE-202ENST00000335613 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
KLHL12Q53G59 GRM7-215ENST00000486284 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
KLHL12Q53G59 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
KLHL12Q53G59 FSTL4-201ENST00000265342 5419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
KLHL12Q53G59 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
KLHL12Q53G59 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
KLHL12Q53G59 MTMR9-201ENST00000221086 7481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
KLHL12Q53G59 CDH20-201ENST00000262717 3882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
KLHL12Q53G59 PTPN9-201ENST00000306726 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
KLHL12Q53G59 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
KLHL12Q53G59 MYRF-203ENST00000389602 2052 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
KLHL12Q53G59 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
KLHL12Q53G59 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
KLHL12Q53G59 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
KLHL12Q53G59 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
KLHL12Q53G59 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
KLHL12Q53G59 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
KLHL12Q53G59 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
KLHL12Q53G59 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
KLHL12Q53G59 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
KLHL12Q53G59 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
KLHL12Q53G59 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
KLHL12Q53G59 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
KLHL12Q53G59 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
KLHL12Q53G59 CHRNB4-201ENST00000261751 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
KLHL12Q53G59 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
KLHL12Q53G59 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
KLHL12Q53G59 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
KLHL12Q53G59 C22orf34-204ENST00000414287 2197 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
KLHL12Q53G59 TNFSF13-201ENST00000338784 1971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
KLHL12Q53G59 STAM2-201ENST00000263904 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
KLHL12Q53G59 JAKMIP3-201ENST00000298622 6626 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
KLHL12Q53G59 PCDHGA6-202ENST00000610583 5650 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.18
KLHL12Q53G59 IMPDH1-201ENST00000338791 2881 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
KLHL12Q53G59 ADAM15-202ENST00000355956 2877 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
KLHL12Q53G59 IMPDH1-217ENST00000626419 2862 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
KLHL12Q53G59 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
KLHL12Q53G59 SLC38A5-212ENST00000619100 2100 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
KLHL12Q53G59 SLC38A5-214ENST00000622196 2100 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
KLHL12Q53G59 WASHC2C-201ENST00000336378 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
KLHL12Q53G59 TMEM245-201ENST00000374586 7980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
KLHL12Q53G59 C15orf52-206ENST00000559313 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
KLHL12Q53G59 KRT20-201ENST00000167588 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
KLHL12Q53G59 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
KLHL12Q53G59 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
KLHL12Q53G59 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
KLHL12Q53G59 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
KLHL12Q53G59 AC107918.4-201ENST00000641966 3141 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
KLHL12Q53G59 DUSP28-202ENST00000405954 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
KLHL12Q53G59 TCOF1-202ENST00000377797 5095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
KLHL12Q53G59 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
KLHL12Q53G59 NKIRAS2-201ENST00000307641 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
KLHL12Q53G59 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
KLHL12Q53G59 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
KLHL12Q53G59 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
KLHL12Q53G59 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
KLHL12Q53G59 SPIN3-207ENST00000638386 4461 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
KLHL12Q53G59 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
KLHL12Q53G59 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
KLHL12Q53G59 KIAA0513-202ENST00000538274 7381 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
KLHL12Q53G59 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
KLHL12Q53G59 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
KLHL12Q53G59 LPAR5-201ENST00000329858 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
KLHL12Q53G59 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
KLHL12Q53G59 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
KLHL12Q53G59 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
KLHL12Q53G59 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
KLHL12Q53G59 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
KLHL12Q53G59 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
KLHL12Q53G59 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
KLHL12Q53G59 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
KLHL12Q53G59 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
KLHL12Q53G59 HTR3E-202ENST00000415389 2139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
KLHL12Q53G59 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
KLHL12Q53G59 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
KLHL12Q53G59 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
KLHL12Q53G59 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
KLHL12Q53G59 LINC01184-204ENST00000501702 2977 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
KLHL12Q53G59 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
KLHL12Q53G59 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
KLHL12Q53G59 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms