Protein–RNA interactions for Protein: Q4ZIN3

TMEM259, Membralin, humanhuman

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM259Q4ZIN3 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TMEM259Q4ZIN3 TERT-201ENST00000310581 4018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TMEM259Q4ZIN3 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TMEM259Q4ZIN3 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
TMEM259Q4ZIN3 NOP9-201ENST00000267425 6033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
TMEM259Q4ZIN3 ELP1-201ENST00000374647 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TMEM259Q4ZIN3 TRAPPC8-201ENST00000283351 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TMEM259Q4ZIN3 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TMEM259Q4ZIN3 ZNF607-201ENST00000355202 4364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TMEM259Q4ZIN3 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TMEM259Q4ZIN3 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TMEM259Q4ZIN3 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TMEM259Q4ZIN3 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TMEM259Q4ZIN3 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TMEM259Q4ZIN3 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TMEM259Q4ZIN3 ABCC10-201ENST00000244533 5088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TMEM259Q4ZIN3 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TMEM259Q4ZIN3 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TMEM259Q4ZIN3 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TMEM259Q4ZIN3 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TMEM259Q4ZIN3 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TMEM259Q4ZIN3 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TMEM259Q4ZIN3 ABCA7-203ENST00000435683 6211 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TMEM259Q4ZIN3 AC017116.1-201ENST00000445938 708 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TMEM259Q4ZIN3 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TMEM259Q4ZIN3 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
TMEM259Q4ZIN3 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TMEM259Q4ZIN3 DNAJC19-209ENST00000491873 769 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TMEM259Q4ZIN3 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TMEM259Q4ZIN3 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TMEM259Q4ZIN3 USP3-AS1-204ENST00000559861 620 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TMEM259Q4ZIN3 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
TMEM259Q4ZIN3 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TMEM259Q4ZIN3 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
TMEM259Q4ZIN3 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TMEM259Q4ZIN3 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TMEM259Q4ZIN3 DCUN1D3-201ENST00000324344 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TMEM259Q4ZIN3 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TMEM259Q4ZIN3 ITSN1-210ENST00000399353 3913 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TMEM259Q4ZIN3 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TMEM259Q4ZIN3 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TMEM259Q4ZIN3 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TMEM259Q4ZIN3 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TMEM259Q4ZIN3 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TMEM259Q4ZIN3 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TMEM259Q4ZIN3 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
TMEM259Q4ZIN3 MINDY2-203ENST00000559228 9238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TMEM259Q4ZIN3 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TMEM259Q4ZIN3 PCDH17-201ENST00000377918 8232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TMEM259Q4ZIN3 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TMEM259Q4ZIN3 ZFP30-201ENST00000351218 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TMEM259Q4ZIN3 KNSTRN-202ENST00000416151 1899 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TMEM259Q4ZIN3 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TMEM259Q4ZIN3 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TMEM259Q4ZIN3 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TMEM259Q4ZIN3 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TMEM259Q4ZIN3 MAPK7-202ENST00000308406 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TMEM259Q4ZIN3 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TMEM259Q4ZIN3 CDH23-202ENST00000299366 3954 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TMEM259Q4ZIN3 CHRNA7-201ENST00000306901 6181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TMEM259Q4ZIN3 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TMEM259Q4ZIN3 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TMEM259Q4ZIN3 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TMEM259Q4ZIN3 CLCN6-207ENST00000376497 814 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TMEM259Q4ZIN3 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TMEM259Q4ZIN3 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TMEM259Q4ZIN3 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
TMEM259Q4ZIN3 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TMEM259Q4ZIN3 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TMEM259Q4ZIN3 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
TMEM259Q4ZIN3 RAB43P1-201ENST00000561790 589 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
TMEM259Q4ZIN3 C17orf62-239ENST00000585080 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TMEM259Q4ZIN3 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TMEM259Q4ZIN3 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TMEM259Q4ZIN3 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TMEM259Q4ZIN3 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
TMEM259Q4ZIN3 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
TMEM259Q4ZIN3 AICDA-201ENST00000229335 2819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TMEM259Q4ZIN3 XRCC1-201ENST00000262887 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TMEM259Q4ZIN3 TSC22D1-211ENST00000501704 4026 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TMEM259Q4ZIN3 MXD1-206ENST00000540449 5580 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TMEM259Q4ZIN3 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TMEM259Q4ZIN3 TBCE-201ENST00000366601 1966 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TMEM259Q4ZIN3 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TMEM259Q4ZIN3 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TMEM259Q4ZIN3 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TMEM259Q4ZIN3 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TMEM259Q4ZIN3 ARHGEF16-203ENST00000378378 3061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TMEM259Q4ZIN3 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TMEM259Q4ZIN3 AC040160.2-201ENST00000623816 1675 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
TMEM259Q4ZIN3 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TMEM259Q4ZIN3 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TMEM259Q4ZIN3 DSE-202ENST00000359564 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TMEM259Q4ZIN3 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TMEM259Q4ZIN3 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TMEM259Q4ZIN3 TBC1D2-203ENST00000375064 3174 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TMEM259Q4ZIN3 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TMEM259Q4ZIN3 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMEM259Q4ZIN3 PHYHD1-202ENST00000353176 1374 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMEM259Q4ZIN3 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.8 ms