Protein–RNA interactions for Protein: Q16695

HIST3H3, Histone H3.1t, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIST3H3Q16695 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
HIST3H3Q16695 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
HIST3H3Q16695 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
HIST3H3Q16695 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
HIST3H3Q16695 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
HIST3H3Q16695 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
HIST3H3Q16695 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
HIST3H3Q16695 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
HIST3H3Q16695 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
HIST3H3Q16695 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
HIST3H3Q16695 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
HIST3H3Q16695 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
HIST3H3Q16695 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
HIST3H3Q16695 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
HIST3H3Q16695 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
HIST3H3Q16695 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
HIST3H3Q16695 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
HIST3H3Q16695 SERF1A-205ENST00000507348 663 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
HIST3H3Q16695 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
HIST3H3Q16695 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
HIST3H3Q16695 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
HIST3H3Q16695 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
HIST3H3Q16695 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
HIST3H3Q16695 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
HIST3H3Q16695 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
HIST3H3Q16695 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
HIST3H3Q16695 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
HIST3H3Q16695 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
HIST3H3Q16695 SPN-201ENST00000360121 6894 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
HIST3H3Q16695 SATB2-205ENST00000443023 6194 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
HIST3H3Q16695 PARD3B-204ENST00000406610 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
HIST3H3Q16695 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
HIST3H3Q16695 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
HIST3H3Q16695 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
HIST3H3Q16695 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
HIST3H3Q16695 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
HIST3H3Q16695 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
HIST3H3Q16695 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
HIST3H3Q16695 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
HIST3H3Q16695 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
HIST3H3Q16695 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
HIST3H3Q16695 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
HIST3H3Q16695 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
HIST3H3Q16695 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
HIST3H3Q16695 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
HIST3H3Q16695 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
HIST3H3Q16695 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
HIST3H3Q16695 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
HIST3H3Q16695 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
HIST3H3Q16695 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
HIST3H3Q16695 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
HIST3H3Q16695 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
HIST3H3Q16695 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
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HIST3H3Q16695 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
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HIST3H3Q16695 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
HIST3H3Q16695 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
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HIST3H3Q16695 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
HIST3H3Q16695 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
HIST3H3Q16695 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
HIST3H3Q16695 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
HIST3H3Q16695 NOS1AP-201ENST00000361897 4931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
HIST3H3Q16695 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
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HIST3H3Q16695 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
HIST3H3Q16695 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
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HIST3H3Q16695 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
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HIST3H3Q16695 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
HIST3H3Q16695 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
HIST3H3Q16695 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
HIST3H3Q16695 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
HIST3H3Q16695 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
HIST3H3Q16695 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
HIST3H3Q16695 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
HIST3H3Q16695 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
HIST3H3Q16695 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
HIST3H3Q16695 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
HIST3H3Q16695 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
HIST3H3Q16695 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
HIST3H3Q16695 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
HIST3H3Q16695 AC009053.1-204ENST00000429810 2355 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
HIST3H3Q16695 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
HIST3H3Q16695 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
HIST3H3Q16695 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
HIST3H3Q16695 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
HIST3H3Q16695 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
HIST3H3Q16695 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
HIST3H3Q16695 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
HIST3H3Q16695 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
HIST3H3Q16695 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
HIST3H3Q16695 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
HIST3H3Q16695 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
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