Protein–RNA interactions for Protein: Q16665

HIF1A, Hypoxia-inducible factor 1-alpha, humanhuman

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Length 826 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIF1AQ16665 CDH23-202ENST00000299366 3954 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
HIF1AQ16665 CACTIN-203ENST00000429344 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
HIF1AQ16665 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
HIF1AQ16665 ARHGEF26-AS1-204ENST00000491862 2598 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
HIF1AQ16665 SEC16A-202ENST00000290037 8982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
HIF1AQ16665 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
HIF1AQ16665 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
HIF1AQ16665 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
HIF1AQ16665 AC120057.1-201ENST00000483947 663 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
HIF1AQ16665 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
HIF1AQ16665 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
HIF1AQ16665 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
HIF1AQ16665 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
HIF1AQ16665 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
HIF1AQ16665 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
HIF1AQ16665 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
HIF1AQ16665 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
HIF1AQ16665 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
HIF1AQ16665 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
HIF1AQ16665 AC097359.2-201ENST00000604992 2389 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
HIF1AQ16665 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
HIF1AQ16665 ZKSCAN2-201ENST00000328086 7523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
HIF1AQ16665 PPP1R13L-202ENST00000418234 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
HIF1AQ16665 ZNF607-201ENST00000355202 4364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
HIF1AQ16665 ASTN2-206ENST00000361477 4001 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
HIF1AQ16665 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
HIF1AQ16665 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
HIF1AQ16665 JARID2-201ENST00000341776 5755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
HIF1AQ16665 AFAP1-201ENST00000358461 7516 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
HIF1AQ16665 TUSC3-201ENST00000382020 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
HIF1AQ16665 AP004608.1-203ENST00000528482 3679 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
HIF1AQ16665 FAM8A1-201ENST00000259963 4677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
HIF1AQ16665 IARS2-201ENST00000366922 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
HIF1AQ16665 RSPRY1-202ENST00000537866 3586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
HIF1AQ16665 TMEM230-202ENST00000342308 1562 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
HIF1AQ16665 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
HIF1AQ16665 RNF182-208ENST00000544682 3495 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.66■□□□□ 0.1
HIF1AQ16665 SPOCK3-201ENST00000357154 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
HIF1AQ16665 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
HIF1AQ16665 CGN-201ENST00000271636 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
HIF1AQ16665 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
HIF1AQ16665 PNPLA5-201ENST00000216177 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
HIF1AQ16665 MYH11-201ENST00000300036 6029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
HIF1AQ16665 ABR-228ENST00000574437 3196 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
HIF1AQ16665 ZNF683-201ENST00000349618 1610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
HIF1AQ16665 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
HIF1AQ16665 ARNT2-209ENST00000622346 2932 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
HIF1AQ16665 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
HIF1AQ16665 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
HIF1AQ16665 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
HIF1AQ16665 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
HIF1AQ16665 ZPBP2-202ENST00000377940 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
HIF1AQ16665 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
HIF1AQ16665 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
HIF1AQ16665 PPP1R16A-201ENST00000292539 2722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
HIF1AQ16665 ZNF664-204ENST00000538932 4321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
HIF1AQ16665 PPM1F-201ENST00000263212 5143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
HIF1AQ16665 DSEL-201ENST00000310045 9531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
HIF1AQ16665 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
HIF1AQ16665 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
HIF1AQ16665 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
HIF1AQ16665 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC15.65■□□□□ 0.1
HIF1AQ16665 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
HIF1AQ16665 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
HIF1AQ16665 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
HIF1AQ16665 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
HIF1AQ16665 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
HIF1AQ16665 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
HIF1AQ16665 FGD5-206ENST00000543601 5768 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
HIF1AQ16665 SRD5A3-201ENST00000264228 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
HIF1AQ16665 RASA3-201ENST00000334062 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
HIF1AQ16665 CAMSAP1-203ENST00000409386 5730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
HIF1AQ16665 CEP131-203ENST00000450824 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
HIF1AQ16665 PTPRU-205ENST00000460170 5337 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
HIF1AQ16665 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
HIF1AQ16665 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
HIF1AQ16665 UBQLN1-202ENST00000376395 4118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
HIF1AQ16665 CDK5RAP2-202ENST00000360190 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
HIF1AQ16665 USP10-201ENST00000219473 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
HIF1AQ16665 SERP1-201ENST00000239944 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
HIF1AQ16665 CUX1-215ENST00000556210 4044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
HIF1AQ16665 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
HIF1AQ16665 DMTN-203ENST00000381470 2601 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.1
HIF1AQ16665 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HIF1AQ16665 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HIF1AQ16665 CYP26A1-202ENST00000371531 2245 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HIF1AQ16665 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HIF1AQ16665 DNAJA1-201ENST00000330899 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HIF1AQ16665 GGT1-202ENST00000400380 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HIF1AQ16665 RAB37-206ENST00000392615 2655 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HIF1AQ16665 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HIF1AQ16665 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HIF1AQ16665 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HIF1AQ16665 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HIF1AQ16665 CASP2-207ENST00000619992 4006 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HIF1AQ16665 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HIF1AQ16665 AC067750.1-201ENST00000608826 6545 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
HIF1AQ16665 DFNA5-201ENST00000342947 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HIF1AQ16665 PATZ1-203ENST00000351933 3638 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HIF1AQ16665 SPAG9-201ENST00000262013 8273 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
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