Protein–RNA interactions for Protein: Q16576

RBBP7, Histone-binding protein RBBP7, humanhuman

Predictions only

Length 425 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP7Q16576 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RBBP7Q16576 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RBBP7Q16576 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RBBP7Q16576 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RBBP7Q16576 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RBBP7Q16576 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
RBBP7Q16576 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RBBP7Q16576 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
RBBP7Q16576 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RBBP7Q16576 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RBBP7Q16576 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RBBP7Q16576 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RBBP7Q16576 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
RBBP7Q16576 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
RBBP7Q16576 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
RBBP7Q16576 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RBBP7Q16576 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RBBP7Q16576 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RBBP7Q16576 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RBBP7Q16576 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RBBP7Q16576 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RBBP7Q16576 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RBBP7Q16576 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RBBP7Q16576 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RBBP7Q16576 GAD2-203ENST00000376261 5858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RBBP7Q16576 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RBBP7Q16576 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RBBP7Q16576 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RBBP7Q16576 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RBBP7Q16576 PNPLA6-202ENST00000414982 4522 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RBBP7Q16576 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RBBP7Q16576 KCTD3-201ENST00000259154 3931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RBBP7Q16576 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RBBP7Q16576 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RBBP7Q16576 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RBBP7Q16576 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RBBP7Q16576 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RBBP7Q16576 SLC35C2-213ENST00000543605 5740 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RBBP7Q16576 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RBBP7Q16576 JPH4-201ENST00000356300 4278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RBBP7Q16576 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RBBP7Q16576 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RBBP7Q16576 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RBBP7Q16576 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RBBP7Q16576 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RBBP7Q16576 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RBBP7Q16576 AMPD3-203ENST00000396554 3806 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RBBP7Q16576 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RBBP7Q16576 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RBBP7Q16576 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RBBP7Q16576 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RBBP7Q16576 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RBBP7Q16576 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RBBP7Q16576 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RBBP7Q16576 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RBBP7Q16576 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RBBP7Q16576 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
RBBP7Q16576 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RBBP7Q16576 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RBBP7Q16576 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RBBP7Q16576 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RBBP7Q16576 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RBBP7Q16576 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RBBP7Q16576 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RBBP7Q16576 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RBBP7Q16576 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RBBP7Q16576 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RBBP7Q16576 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
RBBP7Q16576 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RBBP7Q16576 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RBBP7Q16576 STARD8-202ENST00000374597 4820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RBBP7Q16576 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RBBP7Q16576 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RBBP7Q16576 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RBBP7Q16576 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RBBP7Q16576 KIAA0319-204ENST00000537886 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RBBP7Q16576 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RBBP7Q16576 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RBBP7Q16576 TMEM132E-203ENST00000631683 4379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RBBP7Q16576 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RBBP7Q16576 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RBBP7Q16576 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RBBP7Q16576 GTPBP1-201ENST00000216044 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RBBP7Q16576 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RBBP7Q16576 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RBBP7Q16576 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RBBP7Q16576 PLXNB1-204ENST00000456774 5859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RBBP7Q16576 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RBBP7Q16576 PEX26-205ENST00000610387 3924 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RBBP7Q16576 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RBBP7Q16576 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RBBP7Q16576 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RBBP7Q16576 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RBBP7Q16576 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RBBP7Q16576 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RBBP7Q16576 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RBBP7Q16576 SLIT1-201ENST00000266058 7925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RBBP7Q16576 OPA1-202ENST00000361510 6492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RBBP7Q16576 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RBBP7Q16576 MOCS1-201ENST00000340692 2747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.5 ms