Protein–RNA interactions for Protein: Q15853

USF2, Upstream stimulatory factor 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USF2Q15853 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
USF2Q15853 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
USF2Q15853 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
USF2Q15853 PDE1C-205ENST00000396191 2952 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
USF2Q15853 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
USF2Q15853 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC12.48□□□□□ -0.41
USF2Q15853 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC12.48□□□□□ -0.41
USF2Q15853 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC12.48□□□□□ -0.41
USF2Q15853 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
USF2Q15853 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
USF2Q15853 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
USF2Q15853 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
USF2Q15853 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
USF2Q15853 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC12.48□□□□□ -0.41
USF2Q15853 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
USF2Q15853 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC12.48□□□□□ -0.41
USF2Q15853 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
USF2Q15853 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
USF2Q15853 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
USF2Q15853 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
USF2Q15853 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
USF2Q15853 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
USF2Q15853 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
USF2Q15853 ZNF778-202ENST00000433976 3608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
USF2Q15853 ITSN1-208ENST00000399349 5191 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
USF2Q15853 AC113189.2-201ENST00000575310 1975 ntTSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
USF2Q15853 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
USF2Q15853 COCH-203ENST00000460581 2688 ntTSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
USF2Q15853 IL13RA1-202ENST00000371666 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
USF2Q15853 TNS2-203ENST00000379902 4737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
USF2Q15853 LCA5-202ENST00000392959 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
USF2Q15853 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
USF2Q15853 RER1-207ENST00000488353 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
USF2Q15853 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
USF2Q15853 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
USF2Q15853 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
USF2Q15853 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
USF2Q15853 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
USF2Q15853 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
USF2Q15853 RALGAPB-201ENST00000262879 8663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
USF2Q15853 RALGAPB-203ENST00000397042 8652 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
USF2Q15853 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
USF2Q15853 TPR-201ENST00000367478 9708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
USF2Q15853 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
USF2Q15853 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
USF2Q15853 CAVIN1-201ENST00000357037 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
USF2Q15853 SMTN-223ENST00000619644 3227 ntTSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
USF2Q15853 FBXO32-203ENST00000517956 6744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
USF2Q15853 MKNK1-203ENST00000371945 2618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
USF2Q15853 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
USF2Q15853 SH2D5-201ENST00000375031 3705 ntTSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
USF2Q15853 MANBA-202ENST00000505239 2577 ntTSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
USF2Q15853 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
USF2Q15853 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC12.47□□□□□ -0.41
USF2Q15853 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
USF2Q15853 SPATA13-203ENST00000382108 8463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
USF2Q15853 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
USF2Q15853 AC090114.2-201ENST00000608477 7054 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
USF2Q15853 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
USF2Q15853 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
USF2Q15853 E2F6-201ENST00000307236 3317 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
USF2Q15853 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
USF2Q15853 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
USF2Q15853 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
USF2Q15853 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
USF2Q15853 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
USF2Q15853 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
USF2Q15853 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
USF2Q15853 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC12.47□□□□□ -0.41
USF2Q15853 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
USF2Q15853 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
USF2Q15853 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC12.47□□□□□ -0.41
USF2Q15853 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC12.47□□□□□ -0.41
USF2Q15853 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
USF2Q15853 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC12.47□□□□□ -0.41
USF2Q15853 ZNF663P-201ENST00000400371 2722 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
USF2Q15853 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
USF2Q15853 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
USF2Q15853 ZNF570-201ENST00000330173 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
USF2Q15853 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
USF2Q15853 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
USF2Q15853 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
USF2Q15853 HYOU1-220ENST00000617285 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
USF2Q15853 COQ7-209ENST00000569127 2575 ntTSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
USF2Q15853 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
USF2Q15853 NUBPL-201ENST00000281081 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
USF2Q15853 NFATC1-204ENST00000397790 3453 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
USF2Q15853 TLE1-203ENST00000376499 3893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
USF2Q15853 RGS22-201ENST00000360863 4296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
USF2Q15853 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
USF2Q15853 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
USF2Q15853 TNFRSF11A-206ENST00000617039 3756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
USF2Q15853 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
USF2Q15853 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
USF2Q15853 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
USF2Q15853 ACSM2A-209ENST00000573854 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
USF2Q15853 TIPARP-201ENST00000295924 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
USF2Q15853 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
USF2Q15853 RPN2-202ENST00000373622 2348 ntTSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
USF2Q15853 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
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