Protein–RNA interactions for Protein: Q15642

TRIP10, Cdc42-interacting protein 4, humanhuman

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Length 601 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIP10Q15642 COL4A3-202ENST00000396578 8097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TRIP10Q15642 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TRIP10Q15642 PTGES3-207ENST00000614328 2077 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TRIP10Q15642 OPA1-205ENST00000361908 6439 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TRIP10Q15642 ABAT-203ENST00000425191 1923 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TRIP10Q15642 REV1-202ENST00000393445 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TRIP10Q15642 AC022028.2-201ENST00000474115 2619 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TRIP10Q15642 PLCD1-204ENST00000463876 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TRIP10Q15642 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TRIP10Q15642 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TRIP10Q15642 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TRIP10Q15642 TUBGCP3-201ENST00000261965 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TRIP10Q15642 CBX3-202ENST00000396386 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TRIP10Q15642 ZNF362-201ENST00000373428 2936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TRIP10Q15642 AL662899.1-201ENST00000461287 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TRIP10Q15642 FXR1-214ENST00000480918 1996 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TRIP10Q15642 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TRIP10Q15642 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
TRIP10Q15642 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
TRIP10Q15642 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
TRIP10Q15642 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
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TRIP10Q15642 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TRIP10Q15642 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TRIP10Q15642 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
TRIP10Q15642 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TRIP10Q15642 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
TRIP10Q15642 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TRIP10Q15642 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TRIP10Q15642 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TRIP10Q15642 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TRIP10Q15642 MAPKAP1-204ENST00000373498 3131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TRIP10Q15642 CALML3-201ENST00000315238 2763 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TRIP10Q15642 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TRIP10Q15642 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TRIP10Q15642 PRF1-202ENST00000441259 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TRIP10Q15642 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TRIP10Q15642 PNPLA5-204ENST00000593866 2197 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TRIP10Q15642 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TRIP10Q15642 CDCA3-207ENST00000538862 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TRIP10Q15642 DMBT1P1-203ENST00000636837 4628 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
TRIP10Q15642 SNPH-201ENST00000381867 5533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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TRIP10Q15642 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TRIP10Q15642 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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TRIP10Q15642 WNT7A-201ENST00000285018 4041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TRIP10Q15642 CSF1-201ENST00000329608 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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TRIP10Q15642 RCAN2-203ENST00000371374 3327 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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TRIP10Q15642 MYD88-201ENST00000396334 2850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TRIP10Q15642 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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TRIP10Q15642 WIZ-203ENST00000545156 4466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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TRIP10Q15642 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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TRIP10Q15642 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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TRIP10Q15642 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
TRIP10Q15642 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
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TRIP10Q15642 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
TRIP10Q15642 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
TRIP10Q15642 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
TRIP10Q15642 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
TRIP10Q15642 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC14.67□□□□□ -0.06
TRIP10Q15642 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
TRIP10Q15642 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
TRIP10Q15642 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
TRIP10Q15642 AC004754.1-201ENST00000600536 2242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
TRIP10Q15642 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TRIP10Q15642 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
TRIP10Q15642 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TRIP10Q15642 USP4-203ENST00000415188 1454 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
TRIP10Q15642 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
TRIP10Q15642 EHD4-201ENST00000220325 6416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TRIP10Q15642 COG5-202ENST00000347053 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TRIP10Q15642 MARK4-201ENST00000262891 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TRIP10Q15642 GTF2IRD1-205ENST00000476977 5868 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TRIP10Q15642 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
TRIP10Q15642 MAPT-IT1-201ENST00000624111 3016 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
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