Protein–RNA interactions for Protein: Q15256

PTPRR, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase R, humanhuman

Predictions only

Length 657 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRRQ15256 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PTPRRQ15256 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PTPRRQ15256 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PTPRRQ15256 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PTPRRQ15256 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PTPRRQ15256 BIRC2-214ENST00000621637 3331 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PTPRRQ15256 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PTPRRQ15256 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PTPRRQ15256 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PTPRRQ15256 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PTPRRQ15256 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PTPRRQ15256 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PTPRRQ15256 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PTPRRQ15256 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PTPRRQ15256 MAOB-201ENST00000378069 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PTPRRQ15256 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PTPRRQ15256 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PTPRRQ15256 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PTPRRQ15256 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PTPRRQ15256 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PTPRRQ15256 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PTPRRQ15256 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PTPRRQ15256 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PTPRRQ15256 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PTPRRQ15256 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PTPRRQ15256 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PTPRRQ15256 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PTPRRQ15256 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PTPRRQ15256 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PTPRRQ15256 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PTPRRQ15256 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PTPRRQ15256 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
PTPRRQ15256 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PTPRRQ15256 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PTPRRQ15256 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PTPRRQ15256 SUMF2-205ENST00000413756 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PTPRRQ15256 ECSIT-203ENST00000417981 970 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PTPRRQ15256 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PTPRRQ15256 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
PTPRRQ15256 CACNA2D4-208ENST00000538027 952 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PTPRRQ15256 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PTPRRQ15256 MIR4259-201ENST00000584466 101 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
PTPRRQ15256 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PTPRRQ15256 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
PTPRRQ15256 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PTPRRQ15256 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PTPRRQ15256 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PTPRRQ15256 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PTPRRQ15256 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PTPRRQ15256 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
PTPRRQ15256 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
PTPRRQ15256 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
PTPRRQ15256 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
PTPRRQ15256 COCH-203ENST00000460581 2688 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
PTPRRQ15256 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
PTPRRQ15256 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
PTPRRQ15256 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PTPRRQ15256 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PTPRRQ15256 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PTPRRQ15256 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PTPRRQ15256 ZNF219-203ENST00000451119 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
PTPRRQ15256 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
PTPRRQ15256 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PTPRRQ15256 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
PTPRRQ15256 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PTPRRQ15256 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PTPRRQ15256 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PTPRRQ15256 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PTPRRQ15256 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PTPRRQ15256 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PTPRRQ15256 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
PTPRRQ15256 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PTPRRQ15256 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PTPRRQ15256 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PTPRRQ15256 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PTPRRQ15256 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PTPRRQ15256 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PTPRRQ15256 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PTPRRQ15256 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PTPRRQ15256 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PTPRRQ15256 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PTPRRQ15256 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PTPRRQ15256 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PTPRRQ15256 AC005229.1-201ENST00000392885 409 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
PTPRRQ15256 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
PTPRRQ15256 HIST1H2BPS3-201ENST00000419683 341 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
PTPRRQ15256 SVIL-AS1-208ENST00000446807 1007 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PTPRRQ15256 AL590640.2-201ENST00000457038 527 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
PTPRRQ15256 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PTPRRQ15256 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PTPRRQ15256 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PTPRRQ15256 TPD52L1-214ENST00000534199 811 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PTPRRQ15256 EEF1AKMT3-204ENST00000551420 836 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PTPRRQ15256 ORC6-206ENST00000568364 888 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PTPRRQ15256 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PTPRRQ15256 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PTPRRQ15256 LINC02351-201ENST00000614728 289 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PTPRRQ15256 AL162274.1-201ENST00000617191 1098 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
PTPRRQ15256 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PTPRRQ15256 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
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