Protein–RNA interactions for Protein: Q15034

HERC3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3Q15034 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
HERC3Q15034 WARS2-202ENST00000369426 2811 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
HERC3Q15034 NOS1AP-201ENST00000361897 4931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
HERC3Q15034 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
HERC3Q15034 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
HERC3Q15034 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
HERC3Q15034 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
HERC3Q15034 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC15.01□□□□□ -0.01
HERC3Q15034 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
HERC3Q15034 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
HERC3Q15034 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
HERC3Q15034 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
HERC3Q15034 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
HERC3Q15034 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
HERC3Q15034 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
HERC3Q15034 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
HERC3Q15034 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
HERC3Q15034 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC15.01□□□□□ -0.01
HERC3Q15034 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
HERC3Q15034 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
HERC3Q15034 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
HERC3Q15034 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC15.01□□□□□ -0.01
HERC3Q15034 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
HERC3Q15034 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
HERC3Q15034 SLC13A5-203ENST00000433363 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
HERC3Q15034 ZNF587-203ENST00000423137 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
HERC3Q15034 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
HERC3Q15034 KIAA0930-203ENST00000391627 2623 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
HERC3Q15034 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
HERC3Q15034 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
HERC3Q15034 OPCML-IT1-201ENST00000533859 2936 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
HERC3Q15034 COQ7-209ENST00000569127 2575 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
HERC3Q15034 SLC1A7-206ENST00000620347 2873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
HERC3Q15034 FADS1-201ENST00000350997 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
HERC3Q15034 ZPBP2-202ENST00000377940 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
HERC3Q15034 CLCN1-201ENST00000343257 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
HERC3Q15034 GPANK1-205ENST00000375906 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
HERC3Q15034 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
HERC3Q15034 AL365205.1-204ENST00000359201 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
HERC3Q15034 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
HERC3Q15034 GSG1L-203ENST00000447459 4916 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
HERC3Q15034 COG8-206ENST00000306875 4247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
HERC3Q15034 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
HERC3Q15034 MFRP-201ENST00000360167 1663 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
HERC3Q15034 SATB2-205ENST00000443023 6194 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
HERC3Q15034 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC15□□□□□ -0.01
HERC3Q15034 MEOX2-201ENST00000262041 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
HERC3Q15034 CYP1A1-210ENST00000617691 2521 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
HERC3Q15034 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
HERC3Q15034 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
HERC3Q15034 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
HERC3Q15034 AC027601.5-201ENST00000624065 2482 ntBASIC15□□□□□ -0.01
HERC3Q15034 TRMT1-201ENST00000221504 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
HERC3Q15034 PWWP2A-201ENST00000307063 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
HERC3Q15034 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
HERC3Q15034 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
HERC3Q15034 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
HERC3Q15034 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
HERC3Q15034 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
HERC3Q15034 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
HERC3Q15034 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC15□□□□□ -0.01
HERC3Q15034 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC15□□□□□ -0.01
HERC3Q15034 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC15□□□□□ -0.01
HERC3Q15034 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
HERC3Q15034 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
HERC3Q15034 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC15□□□□□ -0.01
HERC3Q15034 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC15□□□□□ -0.01
HERC3Q15034 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC15□□□□□ -0.01
HERC3Q15034 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
HERC3Q15034 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC15□□□□□ -0.01
HERC3Q15034 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
HERC3Q15034 SLC7A8-212ENST00000529705 1819 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
HERC3Q15034 PCDHA7-201ENST00000356878 2922 ntAPPRIS ALT2 BASIC15□□□□□ -0.01
HERC3Q15034 SV2A-201ENST00000369145 2903 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
HERC3Q15034 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
HERC3Q15034 TMEM38A-201ENST00000187762 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
HERC3Q15034 DFNA5-201ENST00000342947 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
HERC3Q15034 C1orf43-206ENST00000368521 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
HERC3Q15034 ACER2-201ENST00000340967 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
HERC3Q15034 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
HERC3Q15034 RBPMS-201ENST00000287771 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
HERC3Q15034 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
HERC3Q15034 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
HERC3Q15034 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
HERC3Q15034 UMODL1-AS1-201ENST00000329015 2141 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
HERC3Q15034 MTHFR-210ENST00000641407 2387 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
HERC3Q15034 SFI1-209ENST00000443011 3579 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
HERC3Q15034 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
HERC3Q15034 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
HERC3Q15034 NUP54-217ENST00000514987 1563 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
HERC3Q15034 PAK6-202ENST00000455577 4215 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
HERC3Q15034 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
HERC3Q15034 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
HERC3Q15034 HNRNPUL1-205ENST00000593587 2725 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
HERC3Q15034 PLEKHN1-202ENST00000379409 2455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
HERC3Q15034 LPAR5-201ENST00000329858 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
HERC3Q15034 DENND5B-202ENST00000389082 9470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
HERC3Q15034 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
HERC3Q15034 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
HERC3Q15034 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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