Protein–RNA interactions for Protein: Q15032

R3HDM1, R3H domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,099 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
R3HDM1Q15032 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
R3HDM1Q15032 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
R3HDM1Q15032 LETMD1-206ENST00000547008 1665 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
R3HDM1Q15032 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
R3HDM1Q15032 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
R3HDM1Q15032 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
R3HDM1Q15032 VAMP2-202ENST00000404970 1479 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
R3HDM1Q15032 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
R3HDM1Q15032 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
R3HDM1Q15032 MED7-202ENST00000420343 1382 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
R3HDM1Q15032 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
R3HDM1Q15032 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
R3HDM1Q15032 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
R3HDM1Q15032 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
R3HDM1Q15032 TMEM95-201ENST00000330767 1169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
R3HDM1Q15032 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
R3HDM1Q15032 DKKL1P1-201ENST00000400550 698 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
R3HDM1Q15032 KRT18P36-201ENST00000411618 1276 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
R3HDM1Q15032 GRAMD1A-203ENST00000424536 808 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
R3HDM1Q15032 TXNL4B-203ENST00000426362 965 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
R3HDM1Q15032 CSTF3-202ENST00000431742 715 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
R3HDM1Q15032 MAGEA7P-201ENST00000436482 942 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
R3HDM1Q15032 BX276092.5-201ENST00000439926 886 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
R3HDM1Q15032 GLIS3-AS1-201ENST00000451340 734 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
R3HDM1Q15032 AL355803.1-201ENST00000455524 188 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
R3HDM1Q15032 BPIFB5P-201ENST00000457066 1099 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
R3HDM1Q15032 RN7SL288P-201ENST00000490496 291 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
R3HDM1Q15032 IKBKB-223ENST00000522147 954 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
R3HDM1Q15032 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC18.72■□□□□ 0.59
R3HDM1Q15032 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC18.72■□□□□ 0.59
R3HDM1Q15032 NPLOC4-209ENST00000572760 946 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
R3HDM1Q15032 AC104961.2-201ENST00000578129 663 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
R3HDM1Q15032 TRMT112P3-201ENST00000580149 358 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
R3HDM1Q15032 AL160191.2-201ENST00000603975 601 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
R3HDM1Q15032 AC024941.2-201ENST00000625763 493 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
R3HDM1Q15032 ASB15-207ENST00000540573 1651 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
R3HDM1Q15032 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
R3HDM1Q15032 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
R3HDM1Q15032 AC007491.1-201ENST00000637560 1306 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
R3HDM1Q15032 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
R3HDM1Q15032 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
R3HDM1Q15032 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
R3HDM1Q15032 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
R3HDM1Q15032 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
R3HDM1Q15032 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
R3HDM1Q15032 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
R3HDM1Q15032 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
R3HDM1Q15032 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
R3HDM1Q15032 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
R3HDM1Q15032 LIMS1-201ENST00000332345 1235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
R3HDM1Q15032 PRTFDC1-202ENST00000376376 741 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
R3HDM1Q15032 COLEC11-204ENST00000402794 1134 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
R3HDM1Q15032 AC092570.1-201ENST00000414446 469 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
R3HDM1Q15032 LINC00483-202ENST00000419688 558 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
R3HDM1Q15032 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
R3HDM1Q15032 AL157392.3-204ENST00000440878 397 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
R3HDM1Q15032 MRPL43-211ENST00000477279 903 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
R3HDM1Q15032 AC090152.1-203ENST00000517898 1106 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
R3HDM1Q15032 GPX3-202ENST00000517973 612 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
R3HDM1Q15032 YPEL4-209ENST00000534711 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
R3HDM1Q15032 AC093510.1-202ENST00000546238 442 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
R3HDM1Q15032 AC016266.1-201ENST00000557558 729 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
R3HDM1Q15032 ZNF677-204ENST00000594681 935 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
R3HDM1Q15032 HCG18-241ENST00000602290 821 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
R3HDM1Q15032 AL022334.2-201ENST00000610000 484 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
R3HDM1Q15032 PAX4-207ENST00000611453 1235 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
R3HDM1Q15032 APOBEC3H-207ENST00000613996 465 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
R3HDM1Q15032 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
R3HDM1Q15032 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
R3HDM1Q15032 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
R3HDM1Q15032 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
R3HDM1Q15032 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
R3HDM1Q15032 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
R3HDM1Q15032 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
R3HDM1Q15032 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
R3HDM1Q15032 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
R3HDM1Q15032 AL137077.2-201ENST00000635124 1608 ntBASIC18.71■□□□□ 0.58
R3HDM1Q15032 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
R3HDM1Q15032 HLF-202ENST00000430986 1385 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
R3HDM1Q15032 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
R3HDM1Q15032 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
R3HDM1Q15032 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
R3HDM1Q15032 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
R3HDM1Q15032 FIS1-201ENST00000223136 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
R3HDM1Q15032 LST1-204ENST00000376086 554 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
R3HDM1Q15032 AL121949.3-201ENST00000406684 385 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
R3HDM1Q15032 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
R3HDM1Q15032 GULP1-204ENST00000409637 1242 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
R3HDM1Q15032 SERF2-209ENST00000409646 559 ntTSL 4 BASIC18.7■□□□□ 0.58
R3HDM1Q15032 AC019205.2-201ENST00000442007 1083 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
R3HDM1Q15032 LINC00892-203ENST00000454385 686 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
R3HDM1Q15032 RN7SL530P-201ENST00000485097 298 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
R3HDM1Q15032 RPL18AP8-201ENST00000486071 528 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
R3HDM1Q15032 AC097381.2-201ENST00000510640 859 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
R3HDM1Q15032 CTB-178M22.2-201ENST00000519795 503 ntTSL 4 BASIC18.7■□□□□ 0.58
R3HDM1Q15032 HNRNPA1P16-201ENST00000575692 955 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
R3HDM1Q15032 APOC1-209ENST00000592885 562 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
R3HDM1Q15032 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
R3HDM1Q15032 AC020922.4-201ENST00000621389 339 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
R3HDM1Q15032 ST5-261ENST00000626808 1071 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
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