Protein–RNA interactions for Protein: Q15003

NCAPH, Condensin complex subunit 2, humanhuman

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Length 741 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCAPHQ15003 AC013271.1-201ENST00000640669 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
NCAPHQ15003 TDP2-201ENST00000341060 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NCAPHQ15003 TTC8-203ENST00000346301 2058 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NCAPHQ15003 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NCAPHQ15003 TFR2-201ENST00000223051 2888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NCAPHQ15003 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
NCAPHQ15003 CHPF2-204ENST00000495645 2709 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
NCAPHQ15003 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
NCAPHQ15003 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
NCAPHQ15003 LAT2-205ENST00000460943 2527 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NCAPHQ15003 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
NCAPHQ15003 LMAN2L-201ENST00000264963 2397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NCAPHQ15003 AC109583.3-201ENST00000641183 3128 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
NCAPHQ15003 IMPACT-201ENST00000284202 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NCAPHQ15003 CCNDBP1-201ENST00000300213 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NCAPHQ15003 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NCAPHQ15003 ZNF79-202ENST00000543471 2194 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
NCAPHQ15003 ZNF79-203ENST00000612342 2192 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
NCAPHQ15003 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
NCAPHQ15003 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NCAPHQ15003 PLCXD2-201ENST00000393934 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NCAPHQ15003 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
NCAPHQ15003 WDR77-201ENST00000235090 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NCAPHQ15003 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
NCAPHQ15003 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NCAPHQ15003 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
NCAPHQ15003 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
NCAPHQ15003 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NCAPHQ15003 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
NCAPHQ15003 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
NCAPHQ15003 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
NCAPHQ15003 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
NCAPHQ15003 AC022447.6-201ENST00000515522 438 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
NCAPHQ15003 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
NCAPHQ15003 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NCAPHQ15003 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
NCAPHQ15003 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NCAPHQ15003 SMTN-202ENST00000347557 3130 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NCAPHQ15003 ITGB2-203ENST00000355153 2913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
NCAPHQ15003 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NCAPHQ15003 UPB1-201ENST00000326010 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NCAPHQ15003 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NCAPHQ15003 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NCAPHQ15003 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NCAPHQ15003 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
NCAPHQ15003 ALDOA-209ENST00000563060 1550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NCAPHQ15003 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
NCAPHQ15003 AGGF1P1-201ENST00000509500 2073 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
NCAPHQ15003 GNAO1-201ENST00000262493 3337 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NCAPHQ15003 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NCAPHQ15003 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NCAPHQ15003 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NCAPHQ15003 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
NCAPHQ15003 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NCAPHQ15003 DNASE1L1-206ENST00000393638 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
NCAPHQ15003 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NCAPHQ15003 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
NCAPHQ15003 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
NCAPHQ15003 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
NCAPHQ15003 SAPCD2-201ENST00000409687 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NCAPHQ15003 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NCAPHQ15003 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
NCAPHQ15003 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NCAPHQ15003 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
NCAPHQ15003 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
NCAPHQ15003 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NCAPHQ15003 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
NCAPHQ15003 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
NCAPHQ15003 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
NCAPHQ15003 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NCAPHQ15003 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
NCAPHQ15003 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
NCAPHQ15003 PLA2G15-209ENST00000566188 1203 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
NCAPHQ15003 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
NCAPHQ15003 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NCAPHQ15003 DKKL1-202ENST00000594268 524 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
NCAPHQ15003 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
NCAPHQ15003 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
NCAPHQ15003 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
NCAPHQ15003 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NCAPHQ15003 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
NCAPHQ15003 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NCAPHQ15003 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
NCAPHQ15003 UGT3A2-201ENST00000282507 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NCAPHQ15003 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
NCAPHQ15003 CSAD-203ENST00000379846 1962 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
NCAPHQ15003 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NCAPHQ15003 DYRK1A-203ENST00000398956 1590 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NCAPHQ15003 PDE4A-209ENST00000592685 2707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NCAPHQ15003 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
NCAPHQ15003 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NCAPHQ15003 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NCAPHQ15003 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NCAPHQ15003 LRRFIP1-203ENST00000308482 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NCAPHQ15003 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NCAPHQ15003 CCDC32-201ENST00000358005 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NCAPHQ15003 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NCAPHQ15003 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NCAPHQ15003 AMMECR1-203ENST00000372059 3052 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NCAPHQ15003 ZNF239-203ENST00000426961 2027 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
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