Protein–RNA interactions for Protein: Q14995

NR1D2, Nuclear receptor subfamily 1 group D member 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR1D2Q14995 SLC11A2-204ENST00000541174 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NR1D2Q14995 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NR1D2Q14995 AC005899.8-201ENST00000625127 3153 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NR1D2Q14995 TMEM41B-204ENST00000528080 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NR1D2Q14995 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NR1D2Q14995 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
NR1D2Q14995 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NR1D2Q14995 XRCC1-201ENST00000262887 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NR1D2Q14995 DNM1-203ENST00000393594 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NR1D2Q14995 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NR1D2Q14995 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NR1D2Q14995 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NR1D2Q14995 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NR1D2Q14995 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NR1D2Q14995 PRPSAP2-216ENST00000536323 1872 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NR1D2Q14995 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NR1D2Q14995 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NR1D2Q14995 LGALS2-201ENST00000215886 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NR1D2Q14995 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NR1D2Q14995 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NR1D2Q14995 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NR1D2Q14995 AC005229.1-201ENST00000392885 409 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
NR1D2Q14995 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
NR1D2Q14995 DSCR3-202ENST00000398998 988 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NR1D2Q14995 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NR1D2Q14995 AL645941.1-201ENST00000415875 338 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NR1D2Q14995 RALY-AS1-203ENST00000440595 660 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NR1D2Q14995 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NR1D2Q14995 H2AFV-207ENST00000446531 1041 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NR1D2Q14995 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NR1D2Q14995 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NR1D2Q14995 SNX29P1-201ENST00000548357 1007 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
NR1D2Q14995 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
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NR1D2Q14995 MIR4259-201ENST00000584466 101 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
NR1D2Q14995 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NR1D2Q14995 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NR1D2Q14995 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NR1D2Q14995 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NR1D2Q14995 ZDHHC3-201ENST00000296127 3101 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NR1D2Q14995 SLC4A8-204ENST00000514353 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NR1D2Q14995 OPCML-IT1-201ENST00000533859 2936 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NR1D2Q14995 MED20-201ENST00000265350 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NR1D2Q14995 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NR1D2Q14995 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NR1D2Q14995 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NR1D2Q14995 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NR1D2Q14995 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NR1D2Q14995 AL353803.2-201ENST00000436510 1846 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NR1D2Q14995 VWA7-201ENST00000375688 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NR1D2Q14995 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NR1D2Q14995 MPP6-201ENST00000222644 8452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NR1D2Q14995 USP19-205ENST00000398898 4474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NR1D2Q14995 AC007326.2-201ENST00000624224 7579 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
NR1D2Q14995 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NR1D2Q14995 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NR1D2Q14995 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NR1D2Q14995 MGAT1-202ENST00000333055 8863 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NR1D2Q14995 PLEKHA4-201ENST00000263265 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NR1D2Q14995 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NR1D2Q14995 PLXDC1-201ENST00000315392 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NR1D2Q14995 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NR1D2Q14995 EFCAB2-202ENST00000366522 6167 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NR1D2Q14995 PRPH-201ENST00000257860 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NR1D2Q14995 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NR1D2Q14995 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NR1D2Q14995 IFNAR1-201ENST00000270139 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NR1D2Q14995 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NR1D2Q14995 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NR1D2Q14995 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
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NR1D2Q14995 HIST2H2BA-202ENST00000430394 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NR1D2Q14995 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NR1D2Q14995 KRT223P-202ENST00000449164 1292 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
NR1D2Q14995 AL353747.3-201ENST00000454185 579 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NR1D2Q14995 CROCCP4-201ENST00000457096 498 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
NR1D2Q14995 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
NR1D2Q14995 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NR1D2Q14995 MPZL1-209ENST00000474859 630 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NR1D2Q14995 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NR1D2Q14995 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NR1D2Q14995 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
NR1D2Q14995 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
NR1D2Q14995 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NR1D2Q14995 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NR1D2Q14995 AC012615.4-201ENST00000586694 607 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NR1D2Q14995 AL022328.1-201ENST00000610050 478 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
NR1D2Q14995 MIR6775-201ENST00000617557 69 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
NR1D2Q14995 PFAS-212ENST00000625942 396 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NR1D2Q14995 GRB2-203ENST00000392562 3729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NR1D2Q14995 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
NR1D2Q14995 C12orf49-201ENST00000261318 8404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NR1D2Q14995 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NR1D2Q14995 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NR1D2Q14995 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NR1D2Q14995 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NR1D2Q14995 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NR1D2Q14995 UBAP1-202ENST00000359544 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NR1D2Q14995 TGIF2-202ENST00000373874 3432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
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