Protein–RNA interactions for Protein: Q14839

CHD4, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 4, humanhuman

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Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD4Q14839 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CHD4Q14839 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CHD4Q14839 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CHD4Q14839 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CHD4Q14839 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
CHD4Q14839 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CHD4Q14839 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
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CHD4Q14839 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
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CHD4Q14839 MEF2C-AS1-210ENST00000514011 1754 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CHD4Q14839 TMEM208-201ENST00000304800 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
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CHD4Q14839 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
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CHD4Q14839 BCL2L12-204ENST00000594157 620 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
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CHD4Q14839 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CHD4Q14839 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
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CHD4Q14839 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CHD4Q14839 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
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CHD4Q14839 AC109460.1-201ENST00000567209 1478 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CHD4Q14839 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CHD4Q14839 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CHD4Q14839 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CHD4Q14839 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
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CHD4Q14839 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CHD4Q14839 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CHD4Q14839 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
CHD4Q14839 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CHD4Q14839 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
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CHD4Q14839 NDUFS7-203ENST00000414651 841 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CHD4Q14839 RPL14-203ENST00000416518 812 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CHD4Q14839 DCST1-AS1-201ENST00000452962 822 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CHD4Q14839 PGAM1P12-201ENST00000505622 748 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
CHD4Q14839 MSRB3-206ENST00000535664 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CHD4Q14839 AC005865.1-202ENST00000543036 641 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CHD4Q14839 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CHD4Q14839 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CHD4Q14839 HERPUD1-202ENST00000344114 1388 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CHD4Q14839 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CHD4Q14839 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CHD4Q14839 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CHD4Q14839 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CHD4Q14839 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CHD4Q14839 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CHD4Q14839 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CHD4Q14839 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CHD4Q14839 PDCD5-202ENST00000379316 154 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CHD4Q14839 IGLC1-201ENST00000390321 460 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CHD4Q14839 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
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