Protein–RNA interactions for Protein: Q14683

SMC1A, Structural maintenance of chromosomes protein 1A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMC1AQ14683 PTK7-210ENST00000471863 2412 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SMC1AQ14683 AC015656.1-201ENST00000624209 3578 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
SMC1AQ14683 ELN-208ENST00000380575 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SMC1AQ14683 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SMC1AQ14683 ZNF280D-207ENST00000559237 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SMC1AQ14683 RTEL1-205ENST00000370018 4955 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SMC1AQ14683 PRSS30P-203ENST00000476276 2855 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SMC1AQ14683 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SMC1AQ14683 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
SMC1AQ14683 IFNAR1-201ENST00000270139 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SMC1AQ14683 SLC18A1-203ENST00000381608 1419 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SMC1AQ14683 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SMC1AQ14683 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SMC1AQ14683 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
SMC1AQ14683 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SMC1AQ14683 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SMC1AQ14683 GOPC-203ENST00000535237 4460 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SMC1AQ14683 CLEC16A-203ENST00000409790 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SMC1AQ14683 SPAG9-222ENST00000618113 8246 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SMC1AQ14683 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SMC1AQ14683 UBE3B-202ENST00000342494 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SMC1AQ14683 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SMC1AQ14683 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SMC1AQ14683 SPOCK3-201ENST00000357154 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SMC1AQ14683 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SMC1AQ14683 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SMC1AQ14683 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
SMC1AQ14683 RAB37-206ENST00000392615 2655 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SMC1AQ14683 VPS9D1-201ENST00000389386 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SMC1AQ14683 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SMC1AQ14683 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SMC1AQ14683 PRAF2-201ENST00000376386 801 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SMC1AQ14683 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SMC1AQ14683 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SMC1AQ14683 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SMC1AQ14683 RALY-AS1-203ENST00000440595 660 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SMC1AQ14683 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SMC1AQ14683 AP005482.1-201ENST00000563722 1273 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
SMC1AQ14683 ORC6-206ENST00000568364 888 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SMC1AQ14683 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SMC1AQ14683 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SMC1AQ14683 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
SMC1AQ14683 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
SMC1AQ14683 FAM171B-202ENST00000612606 940 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SMC1AQ14683 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SMC1AQ14683 EXT1-201ENST00000378204 8270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SMC1AQ14683 ABCA7-201ENST00000263094 6816 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SMC1AQ14683 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SMC1AQ14683 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SMC1AQ14683 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SMC1AQ14683 TOR2A-202ENST00000373281 2477 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SMC1AQ14683 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SMC1AQ14683 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SMC1AQ14683 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SMC1AQ14683 PAK6-202ENST00000455577 4215 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SMC1AQ14683 RAB2A-201ENST00000262646 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SMC1AQ14683 SAFB-202ENST00000454510 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SMC1AQ14683 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SMC1AQ14683 COL11A2-203ENST00000374708 6209 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SMC1AQ14683 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SMC1AQ14683 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SMC1AQ14683 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SMC1AQ14683 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SMC1AQ14683 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SMC1AQ14683 RNF222-202ENST00000399398 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SMC1AQ14683 INO80-201ENST00000361937 6439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SMC1AQ14683 WBP4-201ENST00000379487 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SMC1AQ14683 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SMC1AQ14683 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SMC1AQ14683 SERP1-201ENST00000239944 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SMC1AQ14683 AMPD2-218ENST00000528454 2728 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SMC1AQ14683 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SMC1AQ14683 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SMC1AQ14683 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SMC1AQ14683 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SMC1AQ14683 RHCE-206ENST00000413854 1198 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SMC1AQ14683 ECSIT-203ENST00000417981 970 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SMC1AQ14683 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SMC1AQ14683 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SMC1AQ14683 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SMC1AQ14683 AC008735.3-201ENST00000596646 500 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
SMC1AQ14683 AC133552.6-201ENST00000613406 534 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
SMC1AQ14683 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SMC1AQ14683 WASH2P-202ENST00000538033 2800 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SMC1AQ14683 ZNF365-207ENST00000410046 3379 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SMC1AQ14683 TMEM41B-204ENST00000528080 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SMC1AQ14683 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SMC1AQ14683 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SMC1AQ14683 TMEM200C-202ENST00000581347 10638 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SMC1AQ14683 FAM84A-201ENST00000295092 6355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SMC1AQ14683 TPO-201ENST00000329066 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SMC1AQ14683 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SMC1AQ14683 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SMC1AQ14683 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SMC1AQ14683 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SMC1AQ14683 ASTN2-206ENST00000361477 4001 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SMC1AQ14683 AC041040.2-201ENST00000622926 2899 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
SMC1AQ14683 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SMC1AQ14683 OSGIN1-201ENST00000343939 2391 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SMC1AQ14683 TRIM67-201ENST00000366653 3936 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
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