Protein–RNA interactions for Protein: Q13619

CUL4A, Cullin-4A, humanhuman

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Length 759 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4AQ13619 CEP135-202ENST00000422247 2092 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CUL4AQ13619 AC011474.4-201ENST00000623523 2076 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
CUL4AQ13619 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CUL4AQ13619 SH3KBP1-201ENST00000379697 1944 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CUL4AQ13619 RNF166-210ENST00000568683 1768 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CUL4AQ13619 UBE2D4-201ENST00000222402 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CUL4AQ13619 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CUL4AQ13619 AC090099.1-203ENST00000527059 2945 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CUL4AQ13619 SGK2-201ENST00000341458 2498 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CUL4AQ13619 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CUL4AQ13619 HNRNPH3-201ENST00000265866 2339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CUL4AQ13619 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CUL4AQ13619 ATP6AP2-213ENST00000636251 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CUL4AQ13619 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CUL4AQ13619 HNRNPUL1-205ENST00000593587 2725 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CUL4AQ13619 SLCO2B1-217ENST00000532236 2593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CUL4AQ13619 KIAA1257-204ENST00000511438 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CUL4AQ13619 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CUL4AQ13619 HNRNPH1-201ENST00000329433 2114 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CUL4AQ13619 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CUL4AQ13619 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
CUL4AQ13619 LILRP2-201ENST00000413439 2127 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CUL4AQ13619 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CUL4AQ13619 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
CUL4AQ13619 AC125603.3-201ENST00000550742 486 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CUL4AQ13619 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
CUL4AQ13619 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CUL4AQ13619 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CUL4AQ13619 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
CUL4AQ13619 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CUL4AQ13619 NAXD-201ENST00000309957 2659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CUL4AQ13619 RFTN1-203ENST00000432519 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CUL4AQ13619 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CUL4AQ13619 CUL1-201ENST00000325222 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CUL4AQ13619 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CUL4AQ13619 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CUL4AQ13619 METTL13-202ENST00000362019 3022 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CUL4AQ13619 ARHGAP23P1-201ENST00000562773 1937 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
CUL4AQ13619 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CUL4AQ13619 FBRS-201ENST00000287468 2811 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CUL4AQ13619 CDH16-202ENST00000394055 2821 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CUL4AQ13619 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CUL4AQ13619 TSPAN18-207ENST00000520358 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CUL4AQ13619 ALDH8A1-204ENST00000367847 1587 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CUL4AQ13619 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CUL4AQ13619 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CUL4AQ13619 PATZ1-203ENST00000351933 3638 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CUL4AQ13619 KIF19-202ENST00000389916 3643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CUL4AQ13619 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CUL4AQ13619 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CUL4AQ13619 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CUL4AQ13619 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CUL4AQ13619 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
CUL4AQ13619 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CUL4AQ13619 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CUL4AQ13619 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CUL4AQ13619 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
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CUL4AQ13619 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CUL4AQ13619 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CUL4AQ13619 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
CUL4AQ13619 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CUL4AQ13619 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CUL4AQ13619 ZNF239-203ENST00000426961 2027 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CUL4AQ13619 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CUL4AQ13619 CDC37-201ENST00000222005 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CUL4AQ13619 ATP6V1H-201ENST00000355221 2365 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CUL4AQ13619 PHYHD1-203ENST00000372592 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CUL4AQ13619 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CUL4AQ13619 FBXO5-202ENST00000367241 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CUL4AQ13619 IL17RD-203ENST00000463523 2348 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CUL4AQ13619 TPD52-201ENST00000379096 4041 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CUL4AQ13619 SPATS2-203ENST00000547865 1810 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CUL4AQ13619 TAF5-201ENST00000369839 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CUL4AQ13619 ATP6V0A1-203ENST00000393829 3028 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CUL4AQ13619 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CUL4AQ13619 ARHGEF1-202ENST00000347545 3091 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CUL4AQ13619 COL6A2-202ENST00000310645 3446 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CUL4AQ13619 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CUL4AQ13619 RUNX3-201ENST00000308873 3861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CUL4AQ13619 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CUL4AQ13619 SLC25A18-201ENST00000327451 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CUL4AQ13619 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CUL4AQ13619 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CUL4AQ13619 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CUL4AQ13619 ZNF74-209ENST00000611540 3714 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CUL4AQ13619 SLC41A3-204ENST00000383598 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CUL4AQ13619 CSAD-203ENST00000379846 1962 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CUL4AQ13619 AC016397.2-201ENST00000624848 1985 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
CUL4AQ13619 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CUL4AQ13619 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CUL4AQ13619 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CUL4AQ13619 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CUL4AQ13619 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CUL4AQ13619 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CUL4AQ13619 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CUL4AQ13619 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CUL4AQ13619 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CUL4AQ13619 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
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