Protein–RNA interactions for Protein: Q13618

CUL3, Cullin-3, humanhuman

Predictions only

Length 768 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL3Q13618 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CUL3Q13618 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CUL3Q13618 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CUL3Q13618 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
CUL3Q13618 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
CUL3Q13618 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CUL3Q13618 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CUL3Q13618 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
CUL3Q13618 GALC-206ENST00000544807 2528 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CUL3Q13618 IRAK4-212ENST00000551736 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CUL3Q13618 SPOCK3-218ENST00000511531 2908 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CUL3Q13618 AC099521.3-201ENST00000624251 2938 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
CUL3Q13618 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CUL3Q13618 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CUL3Q13618 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CUL3Q13618 IMPDH1-201ENST00000338791 2881 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CUL3Q13618 SLC22A12-203ENST00000377572 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CUL3Q13618 IMPDH1-217ENST00000626419 2862 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CUL3Q13618 ZBTB20-215ENST00000481632 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CUL3Q13618 STARD8-202ENST00000374597 4820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CUL3Q13618 TIE1-201ENST00000372476 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CUL3Q13618 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CUL3Q13618 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CUL3Q13618 DDX17-202ENST00000396821 4791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CUL3Q13618 SLC29A1-201ENST00000371708 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CUL3Q13618 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CUL3Q13618 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CUL3Q13618 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CUL3Q13618 CNOT10-201ENST00000328834 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CUL3Q13618 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CUL3Q13618 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CUL3Q13618 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CUL3Q13618 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CUL3Q13618 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
CUL3Q13618 DBN1-203ENST00000393565 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CUL3Q13618 UNC13A-202ENST00000519716 9838 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CUL3Q13618 CDCA2-201ENST00000330560 3731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CUL3Q13618 ERC1-219ENST00000546231 4390 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CUL3Q13618 PLA2G3-201ENST00000215885 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CUL3Q13618 PAPOLA-201ENST00000216277 4519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CUL3Q13618 SIPA1-203ENST00000527525 3235 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CUL3Q13618 MGRN1-202ENST00000399577 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CUL3Q13618 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CUL3Q13618 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CUL3Q13618 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CUL3Q13618 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
CUL3Q13618 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CUL3Q13618 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CUL3Q13618 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CUL3Q13618 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CUL3Q13618 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CUL3Q13618 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CUL3Q13618 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
CUL3Q13618 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
CUL3Q13618 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CUL3Q13618 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CUL3Q13618 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CUL3Q13618 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CUL3Q13618 MEOX2-201ENST00000262041 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CUL3Q13618 SDC1-201ENST00000254351 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CUL3Q13618 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CUL3Q13618 PPIL6-202ENST00000424445 4031 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CUL3Q13618 PROSER3-202ENST00000396908 2149 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CUL3Q13618 ATE1-202ENST00000369040 4803 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CUL3Q13618 PPP6R2-204ENST00000395744 3293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CUL3Q13618 ABLIM2-213ENST00000514025 2974 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CUL3Q13618 POLM-203ENST00000395831 2380 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CUL3Q13618 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CUL3Q13618 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CUL3Q13618 LMNA-213ENST00000473598 2015 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CUL3Q13618 PRF1-202ENST00000441259 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CUL3Q13618 TDRD5-204ENST00000444136 3946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CUL3Q13618 MFSD11-211ENST00000588460 3612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CUL3Q13618 PI4K2A-201ENST00000370631 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CUL3Q13618 TCAF1P1-201ENST00000414990 2232 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
CUL3Q13618 PRMT7-202ENST00000441236 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CUL3Q13618 ANO6-202ENST00000423947 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CUL3Q13618 RREB1-202ENST00000349384 7440 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CUL3Q13618 CYP20A1-201ENST00000356079 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CUL3Q13618 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
CUL3Q13618 RNF216-202ENST00000389902 3293 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CUL3Q13618 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CUL3Q13618 MCC-202ENST00000408903 3476 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CUL3Q13618 SFMBT1-201ENST00000394752 4548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CUL3Q13618 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CUL3Q13618 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CUL3Q13618 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CUL3Q13618 ARHGAP4-203ENST00000370028 3372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CUL3Q13618 IL17RD-201ENST00000296318 8720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CUL3Q13618 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CUL3Q13618 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CUL3Q13618 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CUL3Q13618 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CUL3Q13618 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CUL3Q13618 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
CUL3Q13618 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CUL3Q13618 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CUL3Q13618 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
CUL3Q13618 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
CUL3Q13618 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.9 ms