Protein–RNA interactions for Protein: Q13370

PDE3B, cGMP-inhibited 3',5'-cyclic phosphodiesterase B, humanhuman

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Length 1,112 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE3BQ13370 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PDE3BQ13370 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PDE3BQ13370 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PDE3BQ13370 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PDE3BQ13370 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PDE3BQ13370 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PDE3BQ13370 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PDE3BQ13370 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PDE3BQ13370 PSMC3-209ENST00000530912 1390 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PDE3BQ13370 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PDE3BQ13370 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PDE3BQ13370 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PDE3BQ13370 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
PDE3BQ13370 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
PDE3BQ13370 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
PDE3BQ13370 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
PDE3BQ13370 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
PDE3BQ13370 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PDE3BQ13370 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PDE3BQ13370 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PDE3BQ13370 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
PDE3BQ13370 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
PDE3BQ13370 C17orf51-202ENST00000412778 877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
PDE3BQ13370 SNHG17-201ENST00000413755 648 ntTSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
PDE3BQ13370 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
PDE3BQ13370 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
PDE3BQ13370 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PDE3BQ13370 AC090502.1-202ENST00000515416 966 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PDE3BQ13370 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
PDE3BQ13370 AC105105.3-201ENST00000585470 646 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
PDE3BQ13370 YIF1B-215ENST00000592246 936 ntTSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
PDE3BQ13370 KLK3-207ENST00000595952 969 ntTSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
PDE3BQ13370 AL451050.2-201ENST00000606967 682 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
PDE3BQ13370 AC145423.3-201ENST00000615987 467 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
PDE3BQ13370 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PDE3BQ13370 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
PDE3BQ13370 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
PDE3BQ13370 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PDE3BQ13370 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PDE3BQ13370 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
PDE3BQ13370 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PDE3BQ13370 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PDE3BQ13370 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PDE3BQ13370 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PDE3BQ13370 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PDE3BQ13370 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
PDE3BQ13370 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PDE3BQ13370 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PDE3BQ13370 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PDE3BQ13370 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC20.7■□□□□ 0.91
PDE3BQ13370 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.91
PDE3BQ13370 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC20.7■□□□□ 0.9
PDE3BQ13370 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PDE3BQ13370 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
PDE3BQ13370 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
PDE3BQ13370 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
PDE3BQ13370 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
PDE3BQ13370 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PDE3BQ13370 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PDE3BQ13370 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
PDE3BQ13370 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PDE3BQ13370 ARL16-201ENST00000397498 1227 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PDE3BQ13370 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
PDE3BQ13370 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
PDE3BQ13370 PTPA-217ENST00000434095 870 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
PDE3BQ13370 AL136361.1-201ENST00000435429 506 ntTSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
PDE3BQ13370 PENK-202ENST00000451791 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PDE3BQ13370 LY6G6C-202ENST00000495859 937 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PDE3BQ13370 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
PDE3BQ13370 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
PDE3BQ13370 CYGB-203ENST00000589145 788 ntTSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
PDE3BQ13370 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
PDE3BQ13370 AC097724.1-201ENST00000609581 426 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
PDE3BQ13370 Metazoa_SRP.69-201ENST00000615730 281 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
PDE3BQ13370 ARL16-214ENST00000621051 1181 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PDE3BQ13370 AL137026.1-201ENST00000624407 503 ntTSL 4 BASIC20.7■□□□□ 0.9
PDE3BQ13370 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC20.7■□□□□ 0.9
PDE3BQ13370 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
PDE3BQ13370 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PDE3BQ13370 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PDE3BQ13370 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PDE3BQ13370 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PDE3BQ13370 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PDE3BQ13370 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
PDE3BQ13370 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
PDE3BQ13370 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
PDE3BQ13370 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
PDE3BQ13370 ZNRD1ASP-217ENST00000437417 1497 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PDE3BQ13370 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
PDE3BQ13370 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
PDE3BQ13370 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PDE3BQ13370 AC018735.1-201ENST00000437208 1502 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
PDE3BQ13370 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
PDE3BQ13370 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
PDE3BQ13370 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
PDE3BQ13370 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PDE3BQ13370 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
PDE3BQ13370 CBY1-201ENST00000216029 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PDE3BQ13370 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
PDE3BQ13370 B9D1-202ENST00000268841 755 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
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