Protein–RNA interactions for Protein: Q13131

PRKAA1, 5'-AMP-activated protein kinase catalytic subunit alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKAA1Q13131 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PRKAA1Q13131 CYP1B1-205ENST00000610745 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PRKAA1Q13131 CPEB2-205ENST00000442003 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PRKAA1Q13131 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PRKAA1Q13131 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PRKAA1Q13131 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PRKAA1Q13131 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PRKAA1Q13131 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PRKAA1Q13131 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PRKAA1Q13131 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PRKAA1Q13131 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PRKAA1Q13131 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PRKAA1Q13131 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PRKAA1Q13131 ELF2-202ENST00000379549 3005 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PRKAA1Q13131 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PRKAA1Q13131 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PRKAA1Q13131 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PRKAA1Q13131 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PRKAA1Q13131 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PRKAA1Q13131 HTR3E-202ENST00000415389 2139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PRKAA1Q13131 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PRKAA1Q13131 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PRKAA1Q13131 AC009053.1-204ENST00000429810 2355 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PRKAA1Q13131 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PRKAA1Q13131 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PRKAA1Q13131 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PRKAA1Q13131 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PRKAA1Q13131 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PRKAA1Q13131 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PRKAA1Q13131 FAM114A2-215ENST00000522858 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PRKAA1Q13131 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PRKAA1Q13131 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PRKAA1Q13131 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PRKAA1Q13131 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PRKAA1Q13131 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PRKAA1Q13131 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PRKAA1Q13131 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PRKAA1Q13131 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PRKAA1Q13131 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PRKAA1Q13131 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
PRKAA1Q13131 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PRKAA1Q13131 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PRKAA1Q13131 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PRKAA1Q13131 POU5F1B-201ENST00000465342 5360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PRKAA1Q13131 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PRKAA1Q13131 UBC-205ENST00000536769 3745 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PRKAA1Q13131 ARHGEF16-203ENST00000378378 3061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PRKAA1Q13131 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PRKAA1Q13131 NRP2-203ENST00000357785 2926 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PRKAA1Q13131 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PRKAA1Q13131 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
PRKAA1Q13131 SLCO4C1-201ENST00000310954 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PRKAA1Q13131 NYNRIN-201ENST00000382554 7857 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PRKAA1Q13131 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PRKAA1Q13131 DMTN-205ENST00000432128 2508 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PRKAA1Q13131 KDM3A-203ENST00000409556 4928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PRKAA1Q13131 SLC22A15-202ENST00000369503 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PRKAA1Q13131 SEPT7-201ENST00000350320 4350 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PRKAA1Q13131 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PRKAA1Q13131 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PRKAA1Q13131 TSC22D1-211ENST00000501704 4026 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PRKAA1Q13131 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PRKAA1Q13131 PRSS8-201ENST00000317508 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PRKAA1Q13131 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PRKAA1Q13131 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PRKAA1Q13131 C3-201ENST00000245907 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PRKAA1Q13131 POU5F1-204ENST00000471529 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PRKAA1Q13131 PCDHB13-201ENST00000341948 5061 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PRKAA1Q13131 BCAR1-204ENST00000418647 3387 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PRKAA1Q13131 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PRKAA1Q13131 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PRKAA1Q13131 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PRKAA1Q13131 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PRKAA1Q13131 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PRKAA1Q13131 KDM2B-201ENST00000377069 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PRKAA1Q13131 CHD4-201ENST00000357008 6496 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PRKAA1Q13131 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PRKAA1Q13131 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PRKAA1Q13131 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PRKAA1Q13131 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PRKAA1Q13131 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PRKAA1Q13131 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PRKAA1Q13131 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PRKAA1Q13131 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PRKAA1Q13131 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PRKAA1Q13131 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PRKAA1Q13131 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PRKAA1Q13131 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PRKAA1Q13131 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PRKAA1Q13131 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PRKAA1Q13131 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PRKAA1Q13131 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
PRKAA1Q13131 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PRKAA1Q13131 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
PRKAA1Q13131 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PRKAA1Q13131 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PRKAA1Q13131 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PRKAA1Q13131 CACNA1I-203ENST00000404898 9892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PRKAA1Q13131 TBC1D16-209ENST00000576768 6342 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PRKAA1Q13131 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.8 ms