Protein–RNA interactions for Protein: Q12816

TRO, Trophinin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,431 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TROQ12816 CNR1-201ENST00000362094 1252 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TROQ12816 CXCL12-202ENST00000374426 470 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TROQ12816 SMIM29-202ENST00000394990 792 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TROQ12816 HNRNPA1P27-201ENST00000412087 955 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
TROQ12816 DUTP3-201ENST00000450025 415 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
TROQ12816 AP000842.2-201ENST00000533033 517 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TROQ12816 PRKAB1-210ENST00000630317 258 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TROQ12816 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TROQ12816 LRP10-203ENST00000546834 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TROQ12816 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TROQ12816 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TROQ12816 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TROQ12816 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TROQ12816 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TROQ12816 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TROQ12816 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TROQ12816 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
TROQ12816 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TROQ12816 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TROQ12816 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TROQ12816 CSRP1-201ENST00000340006 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TROQ12816 IL1RAP-209ENST00000422940 1957 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TROQ12816 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TROQ12816 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TROQ12816 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TROQ12816 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TROQ12816 S100A2-203ENST00000368709 457 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TROQ12816 AL137856.1-201ENST00000429398 773 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TROQ12816 LAMA4-208ENST00000431543 1080 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TROQ12816 RPL13AP19-201ENST00000434320 584 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
TROQ12816 FKBP11-202ENST00000444214 630 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TROQ12816 SOX9-AS1-207ENST00000446332 443 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TROQ12816 SIAH2-AS1-201ENST00000461943 441 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TROQ12816 AL049833.2-202ENST00000556773 626 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TROQ12816 AC005696.1-201ENST00000572876 443 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TROQ12816 AC093330.1-206ENST00000582546 812 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TROQ12816 TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 181 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
TROQ12816 AP001065.2-201ENST00000617205 644 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
TROQ12816 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TROQ12816 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TROQ12816 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TROQ12816 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TROQ12816 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TROQ12816 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TROQ12816 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TROQ12816 YWHAE-208ENST00000571732 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TROQ12816 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TROQ12816 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TROQ12816 AAMP-202ENST00000420660 1761 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TROQ12816 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
TROQ12816 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TROQ12816 AHCYP4-201ENST00000419201 1315 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
TROQ12816 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TROQ12816 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TROQ12816 OGFOD1-209ENST00000568397 1681 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TROQ12816 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TROQ12816 PRIMA1-201ENST00000316227 1080 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TROQ12816 PCBP3-201ENST00000400304 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TROQ12816 ZFAND2B-205ENST00000409319 771 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TROQ12816 PCBP3-208ENST00000449640 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TROQ12816 MYLK-AS1-202ENST00000470449 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TROQ12816 UPK1B-205ENST00000497685 981 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TROQ12816 EIF3K-202ENST00000538434 966 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TROQ12816 NPLOC4-209ENST00000572760 946 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TROQ12816 PRMT5-AS1-206ENST00000599580 847 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TROQ12816 AL022334.2-201ENST00000610000 484 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
TROQ12816 PRSS45-202ENST00000620911 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TROQ12816 HLA-C-210ENST00000640219 976 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
TROQ12816 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TROQ12816 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TROQ12816 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
TROQ12816 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TROQ12816 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TROQ12816 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TROQ12816 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TROQ12816 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TROQ12816 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TROQ12816 SPACA3-201ENST00000269053 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TROQ12816 CELA2B-201ENST00000375910 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TROQ12816 IGHV3-48-201ENST00000390624 432 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TROQ12816 AC068134.1-201ENST00000441266 481 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TROQ12816 AC097103.2-201ENST00000504670 602 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TROQ12816 SPACA3-205ENST00000580599 949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TROQ12816 AC084781.1-201ENST00000613737 656 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
TROQ12816 AC025262.2-201ENST00000623975 1056 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
TROQ12816 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TROQ12816 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TROQ12816 CCDC197-206ENST00000640978 1429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TROQ12816 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TROQ12816 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
TROQ12816 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TROQ12816 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TROQ12816 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TROQ12816 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TROQ12816 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TROQ12816 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TROQ12816 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TROQ12816 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TROQ12816 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TROQ12816 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
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