Protein–RNA interactions for Protein: Q03181

PPARD, Peroxisome proliferator-activated receptor delta, humanhuman

Predictions only

Length 441 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPARDQ03181 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PPARDQ03181 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PPARDQ03181 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PPARDQ03181 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PPARDQ03181 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PPARDQ03181 TRIM10-204ENST00000449742 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PPARDQ03181 TNK2-202ENST00000381916 4223 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PPARDQ03181 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PPARDQ03181 TBC1D24-207ENST00000627285 4382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PPARDQ03181 PROM2-203ENST00000403131 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PPARDQ03181 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PPARDQ03181 MYADM-203ENST00000391769 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PPARDQ03181 ERN2-202ENST00000457008 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PPARDQ03181 UHRF1BP1L-201ENST00000279907 5168 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PPARDQ03181 RAD51D-203ENST00000394589 2287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PPARDQ03181 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PPARDQ03181 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PPARDQ03181 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PPARDQ03181 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PPARDQ03181 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PPARDQ03181 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PPARDQ03181 NPR1-202ENST00000368680 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PPARDQ03181 NKIRAS2-201ENST00000307641 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PPARDQ03181 PELP1-202ENST00000436683 3524 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PPARDQ03181 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
PPARDQ03181 CORO7-222ENST00000574025 2826 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PPARDQ03181 TRAF3-202ENST00000351691 2239 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PPARDQ03181 SREBF1-202ENST00000355815 4253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PPARDQ03181 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PPARDQ03181 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PPARDQ03181 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PPARDQ03181 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
PPARDQ03181 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PPARDQ03181 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PPARDQ03181 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PPARDQ03181 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
PPARDQ03181 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PPARDQ03181 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PPARDQ03181 SMARCA4-214ENST00000589677 5181 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PPARDQ03181 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PPARDQ03181 MAP7-204ENST00000454590 3119 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PPARDQ03181 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PPARDQ03181 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PPARDQ03181 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PPARDQ03181 USP10-201ENST00000219473 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PPARDQ03181 TCHH-201ENST00000368804 6900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PPARDQ03181 GRIN1-206ENST00000371559 3577 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PPARDQ03181 AL121992.1-201ENST00000428945 2845 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PPARDQ03181 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PPARDQ03181 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PPARDQ03181 GPR17-201ENST00000272644 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PPARDQ03181 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PPARDQ03181 IL13RA1-202ENST00000371666 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PPARDQ03181 CHRNB4-201ENST00000261751 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PPARDQ03181 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PPARDQ03181 AC097374.1-201ENST00000568768 6624 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PPARDQ03181 MEOX2-201ENST00000262041 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PPARDQ03181 MIRLET7BHG-203ENST00000435439 2264 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PPARDQ03181 PRCP-201ENST00000313010 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PPARDQ03181 IKBKB-217ENST00000520810 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PPARDQ03181 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
PPARDQ03181 TBC1D1-214ENST00000508802 4119 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PPARDQ03181 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PPARDQ03181 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PPARDQ03181 MINDY4-201ENST00000265299 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PPARDQ03181 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PPARDQ03181 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PPARDQ03181 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PPARDQ03181 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PPARDQ03181 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PPARDQ03181 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PPARDQ03181 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PPARDQ03181 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PPARDQ03181 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
PPARDQ03181 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PPARDQ03181 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PPARDQ03181 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PPARDQ03181 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PPARDQ03181 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PPARDQ03181 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PPARDQ03181 BLK-201ENST00000259089 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PPARDQ03181 SEPT6-204ENST00000360156 2609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PPARDQ03181 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PPARDQ03181 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PPARDQ03181 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
PPARDQ03181 CUL1-201ENST00000325222 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PPARDQ03181 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PPARDQ03181 LINC00476-204ENST00000429781 2825 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PPARDQ03181 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PPARDQ03181 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PPARDQ03181 ARHGAP27-203ENST00000428638 4242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PPARDQ03181 OXTR-201ENST00000316793 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PPARDQ03181 PLA2G16-201ENST00000323646 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PPARDQ03181 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PPARDQ03181 BAIAP3-202ENST00000397488 4583 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PPARDQ03181 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PPARDQ03181 MED22-209ENST00000610888 3867 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PPARDQ03181 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PPARDQ03181 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PPARDQ03181 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms