Protein–RNA interactions for Protein: Q02413

DSG1, Desmoglein-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,049 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSG1Q02413 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
DSG1Q02413 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
DSG1Q02413 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
DSG1Q02413 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
DSG1Q02413 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
DSG1Q02413 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
DSG1Q02413 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
DSG1Q02413 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
DSG1Q02413 BEX5-201ENST00000333643 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
DSG1Q02413 SPIN2A-201ENST00000374906 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
DSG1Q02413 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
DSG1Q02413 SNRPN-202ENST00000390687 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
DSG1Q02413 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
DSG1Q02413 C15orf48-202ENST00000396650 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
DSG1Q02413 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
DSG1Q02413 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
DSG1Q02413 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
DSG1Q02413 AC233976.1-201ENST00000425150 451 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
DSG1Q02413 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
DSG1Q02413 AL354989.2-201ENST00000435838 1540 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
DSG1Q02413 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
DSG1Q02413 CHIA-209ENST00000483391 1188 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
DSG1Q02413 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
DSG1Q02413 SELENOW-201ENST00000509570 881 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
DSG1Q02413 AP001258.2-201ENST00000529891 490 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
DSG1Q02413 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
DSG1Q02413 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
DSG1Q02413 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
DSG1Q02413 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
DSG1Q02413 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
DSG1Q02413 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
DSG1Q02413 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
DSG1Q02413 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
DSG1Q02413 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
DSG1Q02413 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
DSG1Q02413 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
DSG1Q02413 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
DSG1Q02413 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
DSG1Q02413 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
DSG1Q02413 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
DSG1Q02413 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
DSG1Q02413 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
DSG1Q02413 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
DSG1Q02413 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
DSG1Q02413 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
DSG1Q02413 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
DSG1Q02413 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
DSG1Q02413 KATNA1-201ENST00000335643 1564 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
DSG1Q02413 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
DSG1Q02413 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
DSG1Q02413 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
DSG1Q02413 AC099552.1-201ENST00000431083 744 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
DSG1Q02413 AP000350.4-201ENST00000433835 788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
DSG1Q02413 MTX1P1-201ENST00000440904 838 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
DSG1Q02413 AC004471.1-201ENST00000456035 582 ntTSL 4 BASIC16.31■□□□□ 0.2
DSG1Q02413 RPSAP36-202ENST00000494591 1261 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
DSG1Q02413 AC104596.1-201ENST00000507826 579 ntTSL 4 BASIC16.31■□□□□ 0.2
DSG1Q02413 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC16.31■□□□□ 0.2
DSG1Q02413 AC120498.1-201ENST00000563593 476 ntTSL 4 BASIC16.31■□□□□ 0.2
DSG1Q02413 CYGB-203ENST00000589145 788 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
DSG1Q02413 AL358473.2-201ENST00000610411 556 ntTSL 4 BASIC16.31■□□□□ 0.2
DSG1Q02413 AC005695.3-201ENST00000614522 232 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
DSG1Q02413 ENPP7P14-201ENST00000621765 1040 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
DSG1Q02413 AL008638.5-201ENST00000623814 1298 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
DSG1Q02413 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
DSG1Q02413 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
DSG1Q02413 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
DSG1Q02413 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
DSG1Q02413 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
DSG1Q02413 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
DSG1Q02413 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
DSG1Q02413 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
DSG1Q02413 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
DSG1Q02413 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
DSG1Q02413 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
DSG1Q02413 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
DSG1Q02413 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
DSG1Q02413 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
DSG1Q02413 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
DSG1Q02413 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
DSG1Q02413 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
DSG1Q02413 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
DSG1Q02413 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
DSG1Q02413 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
DSG1Q02413 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
DSG1Q02413 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
DSG1Q02413 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
DSG1Q02413 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
DSG1Q02413 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
DSG1Q02413 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
DSG1Q02413 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
DSG1Q02413 FXYD3-202ENST00000346446 1320 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
DSG1Q02413 EIF4EBP3-201ENST00000310331 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
DSG1Q02413 CSH1-201ENST00000316193 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
DSG1Q02413 HIST1H2AJ-201ENST00000333151 387 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
DSG1Q02413 EMC3-AS1-202ENST00000366264 559 ntTSL 4 BASIC16.3■□□□□ 0.2
DSG1Q02413 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
DSG1Q02413 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
DSG1Q02413 CNN2P10-201ENST00000443067 918 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
DSG1Q02413 AL160290.2-201ENST00000448347 831 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms