Protein–RNA interactions for Protein: P53609

PGGT1B, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, humanhuman

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1BP53609 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
PGGT1BP53609 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PGGT1BP53609 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PGGT1BP53609 SLC40A1-201ENST00000261024 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PGGT1BP53609 NOC2L-201ENST00000327044 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PGGT1BP53609 GPANK1-205ENST00000375906 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PGGT1BP53609 CNTNAP3P2-201ENST00000617175 3861 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
PGGT1BP53609 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PGGT1BP53609 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PGGT1BP53609 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PGGT1BP53609 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PGGT1BP53609 UBQLN1-202ENST00000376395 4118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PGGT1BP53609 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PGGT1BP53609 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
PGGT1BP53609 FLI1-205ENST00000527786 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PGGT1BP53609 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PGGT1BP53609 AMACR-203ENST00000382072 2919 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PGGT1BP53609 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PGGT1BP53609 WARS2-202ENST00000369426 2811 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PGGT1BP53609 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PGGT1BP53609 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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PGGT1BP53609 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PGGT1BP53609 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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PGGT1BP53609 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PGGT1BP53609 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
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PGGT1BP53609 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PGGT1BP53609 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
PGGT1BP53609 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
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PGGT1BP53609 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PGGT1BP53609 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PGGT1BP53609 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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PGGT1BP53609 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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PGGT1BP53609 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PGGT1BP53609 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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PGGT1BP53609 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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PGGT1BP53609 AP004608.1-203ENST00000528482 3679 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PGGT1BP53609 AC005840.4-201ENST00000541242 2494 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
PGGT1BP53609 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PGGT1BP53609 FAM120A-202ENST00000375389 3585 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PGGT1BP53609 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PGGT1BP53609 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PGGT1BP53609 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PGGT1BP53609 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PGGT1BP53609 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PGGT1BP53609 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PGGT1BP53609 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PGGT1BP53609 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PGGT1BP53609 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PGGT1BP53609 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PGGT1BP53609 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PGGT1BP53609 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PGGT1BP53609 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PGGT1BP53609 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PGGT1BP53609 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
PGGT1BP53609 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PGGT1BP53609 MLXIPL-203ENST00000354613 3215 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PGGT1BP53609 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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