Protein–RNA interactions for Protein: P49023

PXN, Paxillin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 591 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PXNP49023 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PXNP49023 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PXNP49023 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
PXNP49023 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PXNP49023 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PXNP49023 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PXNP49023 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PXNP49023 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PXNP49023 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PXNP49023 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PXNP49023 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PXNP49023 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PXNP49023 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PXNP49023 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
PXNP49023 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PXNP49023 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PXNP49023 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PXNP49023 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PXNP49023 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PXNP49023 CABP1-203ENST00000351200 770 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PXNP49023 SPAG11A-203ENST00000351436 534 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PXNP49023 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PXNP49023 BCAS4-201ENST00000358791 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PXNP49023 SPAG11B-204ENST00000361111 534 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PXNP49023 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PXNP49023 FAM24B-202ENST00000368898 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PXNP49023 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PXNP49023 PSME1-202ENST00000382708 1136 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PXNP49023 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PXNP49023 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PXNP49023 GATD1-203ENST00000397472 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PXNP49023 MPV17-204ENST00000399052 749 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PXNP49023 LINC01006-204ENST00000435354 545 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PXNP49023 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PXNP49023 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PXNP49023 EEF1DP6-201ENST00000449232 372 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
PXNP49023 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PXNP49023 GUSBP1-202ENST00000508260 1012 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PXNP49023 AC022217.1-201ENST00000521069 738 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
PXNP49023 RCE1-204ENST00000525356 1270 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PXNP49023 NDUFC1-210ENST00000539387 725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PXNP49023 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PXNP49023 MRPL48-210ENST00000542303 661 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PXNP49023 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PXNP49023 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PXNP49023 TCL1A-208ENST00000556450 872 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PXNP49023 TMEM208-207ENST00000563953 887 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PXNP49023 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PXNP49023 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PXNP49023 ZACNP1-201ENST00000612259 710 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
PXNP49023 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PXNP49023 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PXNP49023 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PXNP49023 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PXNP49023 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PXNP49023 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PXNP49023 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PXNP49023 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PXNP49023 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PXNP49023 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PXNP49023 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PXNP49023 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PXNP49023 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
PXNP49023 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PXNP49023 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PXNP49023 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PXNP49023 FGF1-201ENST00000337706 1469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PXNP49023 METTL6-201ENST00000383789 1413 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PXNP49023 CAP2-206ENST00000489374 1430 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PXNP49023 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PXNP49023 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PXNP49023 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PXNP49023 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PXNP49023 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PXNP49023 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PXNP49023 CLRN1-203ENST00000328863 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PXNP49023 NFYC-202ENST00000372651 1202 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PXNP49023 FAM27C-201ENST00000377542 616 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PXNP49023 AC253536.4-201ENST00000440539 267 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
PXNP49023 MSRA-203ENST00000441698 788 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PXNP49023 AC012618.1-201ENST00000461223 412 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
PXNP49023 AC025165.3-201ENST00000471530 679 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PXNP49023 ZNF385A-213ENST00000551771 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PXNP49023 C14orf132-202ENST00000553782 536 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PXNP49023 SLIRP-210ENST00000557431 725 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PXNP49023 EID1-202ENST00000560490 584 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PXNP49023 AP007216.2-201ENST00000562094 299 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PXNP49023 AL645939.5-201ENST00000606834 243 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
PXNP49023 AL353726.2-201ENST00000623259 884 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
PXNP49023 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PXNP49023 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PXNP49023 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PXNP49023 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PXNP49023 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PXNP49023 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PXNP49023 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PXNP49023 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PXNP49023 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PXNP49023 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PXNP49023 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.3 ms