Protein–RNA interactions for Protein: P48742

LHX1, LIM/homeobox protein Lhx1, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX1P48742 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LHX1P48742 FBXO8-202ENST00000503293 1546 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LHX1P48742 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LHX1P48742 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LHX1P48742 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
LHX1P48742 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LHX1P48742 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LHX1P48742 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LHX1P48742 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LHX1P48742 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LHX1P48742 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LHX1P48742 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LHX1P48742 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LHX1P48742 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LHX1P48742 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LHX1P48742 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LHX1P48742 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LHX1P48742 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LHX1P48742 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LHX1P48742 ANGPTL8-201ENST00000252453 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LHX1P48742 SPAG11B-203ENST00000359758 612 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LHX1P48742 SNX21-203ENST00000372541 771 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LHX1P48742 DBI-203ENST00000393103 599 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LHX1P48742 ADAMTSL1-210ENST00000431052 824 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LHX1P48742 LYRM9-204ENST00000503642 432 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LHX1P48742 AC106772.2-201ENST00000515085 442 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LHX1P48742 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LHX1P48742 DIO3OS-203ENST00000554441 1068 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LHX1P48742 ANGPTL8-203ENST00000591200 504 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LHX1P48742 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
LHX1P48742 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LHX1P48742 SYNE2-228ENST00000639659 1290 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LHX1P48742 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LHX1P48742 CENPBD1P1-204ENST00000487264 1308 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LHX1P48742 B9D1-209ENST00000477478 1353 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LHX1P48742 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LHX1P48742 AL365199.1-201ENST00000421320 1714 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LHX1P48742 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LHX1P48742 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LHX1P48742 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LHX1P48742 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LHX1P48742 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LHX1P48742 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LHX1P48742 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LHX1P48742 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LHX1P48742 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LHX1P48742 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LHX1P48742 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LHX1P48742 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LHX1P48742 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LHX1P48742 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LHX1P48742 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LHX1P48742 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LHX1P48742 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LHX1P48742 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LHX1P48742 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LHX1P48742 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LHX1P48742 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LHX1P48742 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LHX1P48742 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LHX1P48742 NOS2P2-202ENST00000639528 1659 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LHX1P48742 FGF1-201ENST00000337706 1469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LHX1P48742 HARS2-202ENST00000448069 1426 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LHX1P48742 PSMD8-209ENST00000602911 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LHX1P48742 NPPC-201ENST00000295440 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LHX1P48742 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LHX1P48742 TCEAL1-203ENST00000372626 721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LHX1P48742 IFITM3-201ENST00000399808 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LHX1P48742 AL450469.1-201ENST00000418953 461 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LHX1P48742 LINC00116-202ENST00000426713 461 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LHX1P48742 AL355994.2-201ENST00000447882 704 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
LHX1P48742 FAM162A-202ENST00000469967 1015 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LHX1P48742 MUTYH-237ENST00000531105 501 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LHX1P48742 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LHX1P48742 MAX-211ENST00000555667 574 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LHX1P48742 C2orf69P2-201ENST00000562032 1123 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
LHX1P48742 YIF1B-215ENST00000592246 936 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LHX1P48742 COPS9-205ENST00000607357 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LHX1P48742 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LHX1P48742 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LHX1P48742 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LHX1P48742 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LHX1P48742 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LHX1P48742 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LHX1P48742 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LHX1P48742 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LHX1P48742 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LHX1P48742 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LHX1P48742 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LHX1P48742 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LHX1P48742 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LHX1P48742 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LHX1P48742 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LHX1P48742 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LHX1P48742 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LHX1P48742 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LHX1P48742 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LHX1P48742 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LHX1P48742 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LHX1P48742 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47 ms