Protein–RNA interactions for Protein: P48507

GCLM, Glutamate--cysteine ligase regulatory subunit, humanhuman

Predictions only

Length 274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCLMP48507 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GCLMP48507 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GCLMP48507 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GCLMP48507 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GCLMP48507 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GCLMP48507 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GCLMP48507 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GCLMP48507 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GCLMP48507 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GCLMP48507 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GCLMP48507 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GCLMP48507 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
GCLMP48507 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GCLMP48507 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GCLMP48507 SUCO-210ENST00000616058 5495 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GCLMP48507 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GCLMP48507 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GCLMP48507 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GCLMP48507 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GCLMP48507 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GCLMP48507 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GCLMP48507 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GCLMP48507 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
GCLMP48507 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GCLMP48507 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GCLMP48507 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GCLMP48507 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GCLMP48507 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GCLMP48507 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GCLMP48507 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GCLMP48507 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GCLMP48507 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GCLMP48507 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GCLMP48507 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GCLMP48507 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GCLMP48507 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
GCLMP48507 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GCLMP48507 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
GCLMP48507 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
GCLMP48507 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
GCLMP48507 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
GCLMP48507 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
GCLMP48507 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
GCLMP48507 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
GCLMP48507 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
GCLMP48507 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
GCLMP48507 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
GCLMP48507 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
GCLMP48507 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
GCLMP48507 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
GCLMP48507 UBC-205ENST00000536769 3745 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.23
GCLMP48507 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GCLMP48507 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GCLMP48507 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GCLMP48507 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GCLMP48507 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GCLMP48507 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GCLMP48507 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GCLMP48507 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GCLMP48507 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GCLMP48507 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GCLMP48507 STAT1-203ENST00000392323 2723 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GCLMP48507 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GCLMP48507 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GCLMP48507 COCH-203ENST00000460581 2688 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GCLMP48507 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GCLMP48507 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GCLMP48507 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GCLMP48507 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GCLMP48507 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
GCLMP48507 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GCLMP48507 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GCLMP48507 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GCLMP48507 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GCLMP48507 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GCLMP48507 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GCLMP48507 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GCLMP48507 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GCLMP48507 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
GCLMP48507 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GCLMP48507 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
GCLMP48507 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GCLMP48507 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GCLMP48507 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GCLMP48507 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GCLMP48507 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GCLMP48507 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GCLMP48507 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GCLMP48507 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GCLMP48507 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GCLMP48507 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GCLMP48507 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GCLMP48507 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GCLMP48507 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GCLMP48507 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GCLMP48507 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GCLMP48507 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GCLMP48507 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GCLMP48507 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GCLMP48507 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.8 ms