Protein–RNA interactions for Protein: P46940

IQGAP1, Ras GTPase-activating-like protein IQGAP1, humanhuman

Predictions only

Length 1,657 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IQGAP1P46940 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
IQGAP1P46940 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC21.3■■□□□ 1
IQGAP1P46940 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
IQGAP1P46940 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
IQGAP1P46940 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
IQGAP1P46940 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
IQGAP1P46940 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
IQGAP1P46940 IGHV3-48-201ENST00000390624 432 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
IQGAP1P46940 AC026320.2-201ENST00000434379 478 ntBASIC21.3■■□□□ 1
IQGAP1P46940 HLA-DQB2-232ENST00000437316 1214 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
IQGAP1P46940 FTH1P22-201ENST00000456305 520 ntBASIC21.3■■□□□ 1
IQGAP1P46940 C3orf38-204ENST00000486971 1259 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
IQGAP1P46940 AL049833.2-202ENST00000556773 626 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
IQGAP1P46940 AP005264.3-201ENST00000592370 485 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
IQGAP1P46940 AL606763.1-201ENST00000629535 462 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
IQGAP1P46940 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
IQGAP1P46940 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
IQGAP1P46940 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
IQGAP1P46940 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
IQGAP1P46940 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
IQGAP1P46940 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
IQGAP1P46940 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
IQGAP1P46940 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
IQGAP1P46940 CRHR2-202ENST00000348438 1600 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
IQGAP1P46940 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
IQGAP1P46940 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
IQGAP1P46940 TMEM208-201ENST00000304800 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
IQGAP1P46940 HIST2H2BA-201ENST00000412169 381 ntBASIC21.29■■□□□ 1
IQGAP1P46940 AC061961.1-201ENST00000443901 432 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
IQGAP1P46940 Z99943.1-201ENST00000451545 718 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
IQGAP1P46940 AL512330.1-201ENST00000456701 349 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
IQGAP1P46940 LINC02380-201ENST00000510956 1038 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
IQGAP1P46940 AC091564.6-201ENST00000526633 487 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
IQGAP1P46940 NDUFC1-209ENST00000539002 1198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
IQGAP1P46940 NDUFC1-211ENST00000544855 1257 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
IQGAP1P46940 ANAPC15-217ENST00000545944 704 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
IQGAP1P46940 HTR4-213ENST00000631296 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
IQGAP1P46940 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
IQGAP1P46940 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
IQGAP1P46940 TMCO5B-204ENST00000529696 1568 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
IQGAP1P46940 AC010547.4-201ENST00000561754 1378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
IQGAP1P46940 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
IQGAP1P46940 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
IQGAP1P46940 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
IQGAP1P46940 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
IQGAP1P46940 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
IQGAP1P46940 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC21.29■■□□□ 1
IQGAP1P46940 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
IQGAP1P46940 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC21.28■■□□□ 1
IQGAP1P46940 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
IQGAP1P46940 AC020910.5-201ENST00000623668 1865 ntBASIC21.28■■□□□ 1
IQGAP1P46940 IL3RA-201ENST00000331035 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
IQGAP1P46940 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
IQGAP1P46940 PPP1R1B-202ENST00000394265 1419 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
IQGAP1P46940 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
IQGAP1P46940 CGB1-201ENST00000301407 573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
IQGAP1P46940 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
IQGAP1P46940 AL157788.1-201ENST00000437838 229 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
IQGAP1P46940 APOPT1-209ENST00000492189 513 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
IQGAP1P46940 AL355916.2-201ENST00000556543 593 ntTSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
IQGAP1P46940 HIST1H3F-201ENST00000618052 411 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
IQGAP1P46940 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
IQGAP1P46940 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
IQGAP1P46940 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
IQGAP1P46940 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
IQGAP1P46940 ASGR1-201ENST00000269299 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
IQGAP1P46940 TMEM51-204ENST00000428417 1942 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
IQGAP1P46940 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
IQGAP1P46940 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
IQGAP1P46940 MSR1-201ENST00000262101 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
IQGAP1P46940 TMPRSS3-202ENST00000398397 1342 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
IQGAP1P46940 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
IQGAP1P46940 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
IQGAP1P46940 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
IQGAP1P46940 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
IQGAP1P46940 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
IQGAP1P46940 NHP2-202ENST00000314397 599 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
IQGAP1P46940 RNA5SP359-201ENST00000364838 113 ntBASIC21.28■■□□□ 1
IQGAP1P46940 PMF1-202ENST00000368277 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
IQGAP1P46940 CNRIP1-202ENST00000409559 644 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
IQGAP1P46940 SLC13A3-205ENST00000417157 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
IQGAP1P46940 AC004837.1-201ENST00000446267 564 ntBASIC21.28■■□□□ 1
IQGAP1P46940 SNHG14-206ENST00000450809 677 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
IQGAP1P46940 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
IQGAP1P46940 AC012158.2-201ENST00000536546 354 ntBASIC21.28■■□□□ 1
IQGAP1P46940 HKR1-225ENST00000592168 566 ntTSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
IQGAP1P46940 AC011247.3-201ENST00000603297 438 ntBASIC21.28■■□□□ 1
IQGAP1P46940 AC004706.3-207ENST00000634823 977 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
IQGAP1P46940 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
IQGAP1P46940 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
IQGAP1P46940 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
IQGAP1P46940 PEF1-201ENST00000373703 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
IQGAP1P46940 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
IQGAP1P46940 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
IQGAP1P46940 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
IQGAP1P46940 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
IQGAP1P46940 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
IQGAP1P46940 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
IQGAP1P46940 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
IQGAP1P46940 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.7 ms