Protein–RNA interactions for Protein: P43119

PTGIR, Prostacyclin receptor, humanhuman

Predictions only

Length 386 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGIRP43119 MFNG-202ENST00000416983 2034 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PTGIRP43119 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PTGIRP43119 KIFC3-207ENST00000543930 3018 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PTGIRP43119 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PTGIRP43119 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PTGIRP43119 IL17RD-208ENST00000640796 2345 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PTGIRP43119 DSE-202ENST00000359564 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PTGIRP43119 HCG27-201ENST00000383331 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PTGIRP43119 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PTGIRP43119 WDR27-201ENST00000423258 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PTGIRP43119 ZMYND15-202ENST00000433935 2411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PTGIRP43119 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PTGIRP43119 GAP43-201ENST00000305124 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PTGIRP43119 USP4-203ENST00000415188 1454 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PTGIRP43119 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PTGIRP43119 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PTGIRP43119 XRCC3-211ENST00000555055 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PTGIRP43119 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PTGIRP43119 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PTGIRP43119 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PTGIRP43119 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PTGIRP43119 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PTGIRP43119 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PTGIRP43119 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
PTGIRP43119 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PTGIRP43119 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PTGIRP43119 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PTGIRP43119 HNRNPH3-201ENST00000265866 2339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PTGIRP43119 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PTGIRP43119 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PTGIRP43119 KCNT1-208ENST00000488444 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PTGIRP43119 APBB1IP-202ENST00000376236 2771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PTGIRP43119 SPOCK3-210ENST00000506886 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PTGIRP43119 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PTGIRP43119 EYA4-205ENST00000430974 2364 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PTGIRP43119 ABCG1-203ENST00000361802 3034 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PTGIRP43119 TFCP2-201ENST00000257915 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PTGIRP43119 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PTGIRP43119 AICDA-201ENST00000229335 2819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PTGIRP43119 IMPACT-201ENST00000284202 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PTGIRP43119 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PTGIRP43119 TSPAN12-201ENST00000222747 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PTGIRP43119 ADRB2-201ENST00000305988 3443 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PTGIRP43119 GPD1L-201ENST00000282541 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PTGIRP43119 NCKIPSD-204ENST00000416649 2925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PTGIRP43119 AC010327.5-201ENST00000586923 3061 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
PTGIRP43119 ANKMY1-204ENST00000391987 3221 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PTGIRP43119 PRRT2-202ENST00000358758 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PTGIRP43119 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PTGIRP43119 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PTGIRP43119 TSFM-207ENST00000540550 1935 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PTGIRP43119 KIAA0895L-202ENST00000561621 3500 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PTGIRP43119 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PTGIRP43119 PRMT7-203ENST00000449359 2091 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PTGIRP43119 GSTCD-206ENST00000507281 2091 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PTGIRP43119 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PTGIRP43119 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PTGIRP43119 SAPCD2-201ENST00000409687 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PTGIRP43119 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PTGIRP43119 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
PTGIRP43119 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
PTGIRP43119 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PTGIRP43119 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PTGIRP43119 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PTGIRP43119 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
PTGIRP43119 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PTGIRP43119 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PTGIRP43119 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
PTGIRP43119 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PTGIRP43119 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
PTGIRP43119 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
PTGIRP43119 Z99916.3-201ENST00000623422 1080 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
PTGIRP43119 ATP6V0A1-203ENST00000393829 3028 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PTGIRP43119 TATDN3-202ENST00000366974 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PTGIRP43119 PRKN-204ENST00000366896 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PTGIRP43119 AC004890.2-205ENST00000416232 2804 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PTGIRP43119 NEK2-201ENST00000366998 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PTGIRP43119 PSMD9-207ENST00000541212 2784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PTGIRP43119 NDRG4-217ENST00000562999 2931 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PTGIRP43119 KCNT1-207ENST00000487664 3845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PTGIRP43119 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PTGIRP43119 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PTGIRP43119 SDCBP2-AS1-201ENST00000446423 1811 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PTGIRP43119 PLA2G16-201ENST00000323646 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PTGIRP43119 TOP3B-201ENST00000357179 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PTGIRP43119 ITSN1-210ENST00000399353 3913 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PTGIRP43119 FBRS-201ENST00000287468 2811 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PTGIRP43119 MPHOSPH10-205ENST00000498451 2068 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PTGIRP43119 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PTGIRP43119 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PTGIRP43119 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PTGIRP43119 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PTGIRP43119 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PTGIRP43119 CHRNB4-201ENST00000261751 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PTGIRP43119 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PTGIRP43119 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PTGIRP43119 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PTGIRP43119 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PTGIRP43119 SLC35C2-201ENST00000243896 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PTGIRP43119 MSTO1-201ENST00000245564 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms