Protein–RNA interactions for Protein: P36383

GJC1, Gap junction gamma-1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 396 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJC1P36383 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GJC1P36383 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GJC1P36383 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GJC1P36383 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GJC1P36383 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GJC1P36383 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
GJC1P36383 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
GJC1P36383 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GJC1P36383 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GJC1P36383 CGN-201ENST00000271636 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GJC1P36383 WDR20-202ENST00000322340 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GJC1P36383 ARHGEF16-203ENST00000378378 3061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GJC1P36383 STARD8-201ENST00000252336 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GJC1P36383 PCDHA11-201ENST00000398640 6115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GJC1P36383 MOCS3-201ENST00000244051 5106 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GJC1P36383 CYP4F11-202ENST00000326742 2877 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GJC1P36383 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GJC1P36383 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GJC1P36383 SNPH-203ENST00000614659 5354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GJC1P36383 PRR23C-201ENST00000413199 2791 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GJC1P36383 HTR7-203ENST00000371719 3033 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GJC1P36383 NDFIP2-205ENST00000612570 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GJC1P36383 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GJC1P36383 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GJC1P36383 PLIN4-201ENST00000301286 6353 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GJC1P36383 APC2-201ENST00000233607 10151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GJC1P36383 TBC1D8-202ENST00000409318 3803 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GJC1P36383 SLC35C2-213ENST00000543605 5740 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GJC1P36383 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GJC1P36383 VSIR-201ENST00000394957 4689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GJC1P36383 SLC35A2-204ENST00000376521 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GJC1P36383 PCDH10-203ENST00000618019 4574 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GJC1P36383 PLXNB3-209ENST00000538966 6377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GJC1P36383 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GJC1P36383 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GJC1P36383 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
GJC1P36383 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GJC1P36383 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GJC1P36383 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GJC1P36383 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GJC1P36383 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GJC1P36383 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GJC1P36383 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GJC1P36383 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GJC1P36383 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GJC1P36383 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
GJC1P36383 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
GJC1P36383 DPY19L2P2-201ENST00000312132 4078 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GJC1P36383 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GJC1P36383 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GJC1P36383 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GJC1P36383 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
GJC1P36383 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GJC1P36383 PLXNB1-204ENST00000456774 5859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GJC1P36383 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GJC1P36383 UMODL1-203ENST00000400424 5516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GJC1P36383 NRP2-203ENST00000357785 2926 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GJC1P36383 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GJC1P36383 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GJC1P36383 SH3KBP1-205ENST00000397821 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GJC1P36383 GPSM2-202ENST00000406462 7433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GJC1P36383 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GJC1P36383 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
GJC1P36383 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GJC1P36383 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GJC1P36383 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GJC1P36383 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
GJC1P36383 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
GJC1P36383 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GJC1P36383 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GJC1P36383 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GJC1P36383 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GJC1P36383 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GJC1P36383 GRID2IP-203ENST00000457091 3636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GJC1P36383 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GJC1P36383 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GJC1P36383 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GJC1P36383 GCK-204ENST00000403799 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GJC1P36383 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GJC1P36383 IL17RA-201ENST00000319363 8607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GJC1P36383 ZNF385A-205ENST00000546970 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GJC1P36383 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GJC1P36383 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GJC1P36383 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GJC1P36383 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GJC1P36383 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GJC1P36383 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GJC1P36383 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GJC1P36383 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GJC1P36383 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
GJC1P36383 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
GJC1P36383 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GJC1P36383 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
GJC1P36383 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GJC1P36383 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
GJC1P36383 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GJC1P36383 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GJC1P36383 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
GJC1P36383 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GJC1P36383 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms