Protein–RNA interactions for Protein: P22415

USF1, Upstream stimulatory factor 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 310 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USF1P22415 EDIL3-201ENST00000296591 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
USF1P22415 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
USF1P22415 PDPK1-202ENST00000342085 7241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
USF1P22415 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
USF1P22415 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
USF1P22415 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
USF1P22415 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
USF1P22415 NF2-205ENST00000361452 5884 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
USF1P22415 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
USF1P22415 PDE4D-203ENST00000340635 8232 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
USF1P22415 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
USF1P22415 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
USF1P22415 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
USF1P22415 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
USF1P22415 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
USF1P22415 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
USF1P22415 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
USF1P22415 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
USF1P22415 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
USF1P22415 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
USF1P22415 KHNYN-201ENST00000251343 6725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
USF1P22415 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
USF1P22415 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
USF1P22415 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
USF1P22415 BAG4-201ENST00000287322 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
USF1P22415 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
USF1P22415 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
USF1P22415 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
USF1P22415 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
USF1P22415 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
USF1P22415 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
USF1P22415 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
USF1P22415 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
USF1P22415 RALGPS2-204ENST00000367635 5834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
USF1P22415 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
USF1P22415 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
USF1P22415 NPPC-201ENST00000295440 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
USF1P22415 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
USF1P22415 HIST1H2AD-201ENST00000341023 393 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
USF1P22415 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
USF1P22415 PEMT-203ENST00000395782 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
USF1P22415 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
USF1P22415 BCYRN1-201ENST00000418539 200 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
USF1P22415 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
USF1P22415 LINC01248-201ENST00000458264 468 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
USF1P22415 AC108725.1-201ENST00000495472 409 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
USF1P22415 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
USF1P22415 RN7SL560P-201ENST00000577943 264 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
USF1P22415 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC12.99□□□□□ -0.33
USF1P22415 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
USF1P22415 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
USF1P22415 AC244093.1-201ENST00000610837 814 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
USF1P22415 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
USF1P22415 AC244669.2-201ENST00000612320 853 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
USF1P22415 AC008687.7-202ENST00000637404 953 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
USF1P22415 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
USF1P22415 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
USF1P22415 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
USF1P22415 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
USF1P22415 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
USF1P22415 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
USF1P22415 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
USF1P22415 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
USF1P22415 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
USF1P22415 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
USF1P22415 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
USF1P22415 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
USF1P22415 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
USF1P22415 CACNA1I-202ENST00000402142 10004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
USF1P22415 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
USF1P22415 SLC4A7-210ENST00000440156 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
USF1P22415 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
USF1P22415 FUNDC2-201ENST00000369498 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
USF1P22415 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
USF1P22415 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
USF1P22415 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
USF1P22415 ITSN1-212ENST00000399367 5722 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
USF1P22415 CEP164-201ENST00000278935 5630 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
USF1P22415 SLC25A19-202ENST00000375261 1486 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
USF1P22415 LINC00593-202ENST00000560853 1483 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
USF1P22415 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
USF1P22415 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
USF1P22415 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
USF1P22415 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
USF1P22415 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
USF1P22415 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
USF1P22415 PLIN4-202ENST00000633942 6484 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
USF1P22415 TMEM106C-201ENST00000256686 1394 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
USF1P22415 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
USF1P22415 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
USF1P22415 CUX2-201ENST00000261726 6844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
USF1P22415 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
USF1P22415 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
USF1P22415 SEC16A-202ENST00000290037 8982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
USF1P22415 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
USF1P22415 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
USF1P22415 AGRP-201ENST00000290953 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
USF1P22415 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
USF1P22415 MOGAT3-202ENST00000379423 933 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
USF1P22415 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
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