Protein–RNA interactions for Protein: P18031

PTPN1, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN1P18031 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTPN1P18031 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTPN1P18031 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
PTPN1P18031 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTPN1P18031 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTPN1P18031 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTPN1P18031 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTPN1P18031 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTPN1P18031 DMAC2-204ENST00000438807 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTPN1P18031 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTPN1P18031 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTPN1P18031 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTPN1P18031 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTPN1P18031 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTPN1P18031 TPM3P8-201ENST00000330554 643 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
PTPN1P18031 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTPN1P18031 STX1A-203ENST00000395155 783 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTPN1P18031 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTPN1P18031 RFPL4A-201ENST00000434937 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTPN1P18031 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTPN1P18031 AC136475.5-202ENST00000524824 587 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTPN1P18031 AC078819.1-201ENST00000547454 765 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
PTPN1P18031 AC012085.1-201ENST00000548270 765 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
PTPN1P18031 AC090502.1-201ENST00000549905 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTPN1P18031 AC090502.1-204ENST00000551210 469 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTPN1P18031 ENPP7P14-201ENST00000621765 1040 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
PTPN1P18031 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTPN1P18031 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTPN1P18031 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTPN1P18031 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTPN1P18031 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTPN1P18031 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTPN1P18031 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTPN1P18031 CHST10-203ENST00000409701 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTPN1P18031 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTPN1P18031 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTPN1P18031 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTPN1P18031 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTPN1P18031 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTPN1P18031 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTPN1P18031 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTPN1P18031 CLDND1-215ENST00000507874 1380 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTPN1P18031 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTPN1P18031 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTPN1P18031 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTPN1P18031 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTPN1P18031 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTPN1P18031 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTPN1P18031 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTPN1P18031 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTPN1P18031 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTPN1P18031 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTPN1P18031 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTPN1P18031 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTPN1P18031 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTPN1P18031 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTPN1P18031 AC006001.1-201ENST00000325130 474 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
PTPN1P18031 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTPN1P18031 AC233976.1-201ENST00000425150 451 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTPN1P18031 AC026954.1-201ENST00000429771 1293 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
PTPN1P18031 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTPN1P18031 DICER1-AS1-202ENST00000439819 810 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTPN1P18031 CSF2RBP1-201ENST00000447905 391 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
PTPN1P18031 AL590640.2-201ENST00000457038 527 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
PTPN1P18031 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTPN1P18031 LINC02449-203ENST00000536034 451 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTPN1P18031 PAFAH1B3-202ENST00000538771 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTPN1P18031 ACAP1-208ENST00000574499 412 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTPN1P18031 AC005597.1-201ENST00000588092 420 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTPN1P18031 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
PTPN1P18031 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTPN1P18031 GTF2A1L-203ENST00000430487 1575 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTPN1P18031 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTPN1P18031 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTPN1P18031 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTPN1P18031 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
PTPN1P18031 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTPN1P18031 ZSCAN30-212ENST00000639929 1305 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTPN1P18031 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTPN1P18031 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTPN1P18031 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTPN1P18031 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTPN1P18031 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTPN1P18031 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTPN1P18031 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTPN1P18031 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
PTPN1P18031 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTPN1P18031 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTPN1P18031 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTPN1P18031 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTPN1P18031 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTPN1P18031 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTPN1P18031 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTPN1P18031 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTPN1P18031 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTPN1P18031 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTPN1P18031 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTPN1P18031 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTPN1P18031 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTPN1P18031 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.2 ms