Protein–RNA interactions for Protein: O95352

ATG7, Ubiquitin-like modifier-activating enzyme ATG7, humanhuman

Predictions only

Length 703 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG7O95352 CDC23-208ENST00000505120 455 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ATG7O95352 PAX5-211ENST00000522003 1019 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ATG7O95352 AC138123.2-203ENST00000552451 653 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ATG7O95352 AC126696.1-201ENST00000561567 756 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ATG7O95352 AP005329.1-201ENST00000578800 1035 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ATG7O95352 AC129510.1-201ENST00000579979 555 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ATG7O95352 MIR3615-201ENST00000581999 87 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
ATG7O95352 AC021594.1-201ENST00000587174 636 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ATG7O95352 AL121944.1-201ENST00000605945 686 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ATG7O95352 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
ATG7O95352 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
ATG7O95352 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
ATG7O95352 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
ATG7O95352 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
ATG7O95352 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
ATG7O95352 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
ATG7O95352 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
ATG7O95352 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
ATG7O95352 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ATG7O95352 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ATG7O95352 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ATG7O95352 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ATG7O95352 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ATG7O95352 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ATG7O95352 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ATG7O95352 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ATG7O95352 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ATG7O95352 TMEM184C-204ENST00000508208 1528 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ATG7O95352 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ATG7O95352 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ATG7O95352 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ATG7O95352 RGS6-218ENST00000556437 1689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ATG7O95352 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ATG7O95352 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ATG7O95352 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ATG7O95352 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ATG7O95352 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ATG7O95352 FZR1-201ENST00000313639 1215 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ATG7O95352 ATP5J-205ENST00000400094 589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ATG7O95352 SUMO1-204ENST00000409181 784 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ATG7O95352 SUMO1-207ENST00000409498 779 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ATG7O95352 AC053503.1-201ENST00000429882 519 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ATG7O95352 USE1-202ENST00000445667 795 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ATG7O95352 ZNF789-204ENST00000448667 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ATG7O95352 MAATS1-203ENST00000463700 939 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ATG7O95352 TUBB8-202ENST00000562809 820 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ATG7O95352 TXNDC17-202ENST00000570330 459 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ATG7O95352 MIR4783-201ENST00000580343 82 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
ATG7O95352 AL358473.2-201ENST00000610411 556 ntTSL 4 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ATG7O95352 AC002472.3-201ENST00000640124 621 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
ATG7O95352 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ATG7O95352 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ATG7O95352 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ATG7O95352 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ATG7O95352 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ATG7O95352 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ATG7O95352 STYXL1-201ENST00000248600 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ATG7O95352 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ATG7O95352 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ATG7O95352 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ATG7O95352 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ATG7O95352 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ATG7O95352 C11orf16-201ENST00000326053 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ATG7O95352 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ATG7O95352 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ATG7O95352 AC245123.1-202ENST00000612422 1719 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ATG7O95352 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ATG7O95352 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ATG7O95352 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ATG7O95352 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ATG7O95352 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ATG7O95352 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ATG7O95352 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ATG7O95352 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ATG7O95352 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ATG7O95352 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ATG7O95352 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ATG7O95352 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ATG7O95352 EXOC7-213ENST00000467929 2260 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ATG7O95352 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ATG7O95352 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ATG7O95352 GTSF1-201ENST00000305879 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ATG7O95352 C3orf22-201ENST00000318225 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ATG7O95352 CLRN1-203ENST00000328863 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ATG7O95352 PAX4-201ENST00000338516 1085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ATG7O95352 RBM8A-201ENST00000369307 796 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ATG7O95352 AGER-203ENST00000375065 665 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ATG7O95352 PPP1R14B-202ENST00000392210 600 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ATG7O95352 AL021707.3-201ENST00000418803 527 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ATG7O95352 ALG3P1-201ENST00000508806 1114 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
ATG7O95352 GNG2-209ENST00000555472 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ATG7O95352 AC243960.2-201ENST00000600996 747 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
ATG7O95352 AP000229.1-202ENST00000609365 559 ntTSL 4 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ATG7O95352 LINC01667-202ENST00000623919 1422 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ATG7O95352 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ATG7O95352 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ATG7O95352 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ATG7O95352 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ATG7O95352 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ATG7O95352 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms