Protein–RNA interactions for Protein: A6XGL0

YJEFN3, YjeF N-terminal domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YJEFN3A6XGL0 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
YJEFN3A6XGL0 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
YJEFN3A6XGL0 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
YJEFN3A6XGL0 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
YJEFN3A6XGL0 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
YJEFN3A6XGL0 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
YJEFN3A6XGL0 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
YJEFN3A6XGL0 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
YJEFN3A6XGL0 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
YJEFN3A6XGL0 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
YJEFN3A6XGL0 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
YJEFN3A6XGL0 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
YJEFN3A6XGL0 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
YJEFN3A6XGL0 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
YJEFN3A6XGL0 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
YJEFN3A6XGL0 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
YJEFN3A6XGL0 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
YJEFN3A6XGL0 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
YJEFN3A6XGL0 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
YJEFN3A6XGL0 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
YJEFN3A6XGL0 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
YJEFN3A6XGL0 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
YJEFN3A6XGL0 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
YJEFN3A6XGL0 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
YJEFN3A6XGL0 DYNLRB2-201ENST00000305904 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
YJEFN3A6XGL0 PLAC9-201ENST00000372263 785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
YJEFN3A6XGL0 THEMIS2-204ENST00000373927 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
YJEFN3A6XGL0 MIR658-201ENST00000385210 100 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
YJEFN3A6XGL0 LINC01939-201ENST00000445279 694 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
YJEFN3A6XGL0 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
YJEFN3A6XGL0 AC104989.1-201ENST00000519711 778 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
YJEFN3A6XGL0 AC021054.1-202ENST00000543884 599 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
YJEFN3A6XGL0 AC078819.1-201ENST00000547454 765 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
YJEFN3A6XGL0 AC012085.1-201ENST00000548270 765 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
YJEFN3A6XGL0 AL132711.1-201ENST00000557546 722 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
YJEFN3A6XGL0 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
YJEFN3A6XGL0 CMTM3-212ENST00000566121 572 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
YJEFN3A6XGL0 AC005597.1-201ENST00000588092 420 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
YJEFN3A6XGL0 ECM1P1-201ENST00000604092 1279 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
YJEFN3A6XGL0 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
YJEFN3A6XGL0 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
YJEFN3A6XGL0 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
YJEFN3A6XGL0 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
YJEFN3A6XGL0 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
YJEFN3A6XGL0 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
YJEFN3A6XGL0 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
YJEFN3A6XGL0 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
YJEFN3A6XGL0 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
YJEFN3A6XGL0 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
YJEFN3A6XGL0 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
YJEFN3A6XGL0 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
YJEFN3A6XGL0 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
YJEFN3A6XGL0 SLC12A8-207ENST00000469902 2989 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
YJEFN3A6XGL0 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
YJEFN3A6XGL0 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
YJEFN3A6XGL0 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
YJEFN3A6XGL0 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
YJEFN3A6XGL0 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
YJEFN3A6XGL0 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
YJEFN3A6XGL0 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
YJEFN3A6XGL0 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
YJEFN3A6XGL0 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
YJEFN3A6XGL0 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
YJEFN3A6XGL0 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
YJEFN3A6XGL0 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
YJEFN3A6XGL0 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
YJEFN3A6XGL0 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
YJEFN3A6XGL0 GZMB-202ENST00000382540 816 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
YJEFN3A6XGL0 AC018467.1-201ENST00000421581 717 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
YJEFN3A6XGL0 AL355483.2-201ENST00000421637 675 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
YJEFN3A6XGL0 MDM2-215ENST00000428863 1037 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
YJEFN3A6XGL0 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
YJEFN3A6XGL0 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
YJEFN3A6XGL0 RNA5SP486-201ENST00000515961 83 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
YJEFN3A6XGL0 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
YJEFN3A6XGL0 ATXN2-AS-201ENST00000547021 485 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
YJEFN3A6XGL0 AC027601.2-201ENST00000571085 805 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
YJEFN3A6XGL0 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
YJEFN3A6XGL0 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
YJEFN3A6XGL0 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
YJEFN3A6XGL0 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
YJEFN3A6XGL0 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
YJEFN3A6XGL0 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
YJEFN3A6XGL0 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
YJEFN3A6XGL0 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
YJEFN3A6XGL0 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
YJEFN3A6XGL0 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
YJEFN3A6XGL0 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
YJEFN3A6XGL0 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
YJEFN3A6XGL0 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
YJEFN3A6XGL0 CLDND1-215ENST00000507874 1380 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
YJEFN3A6XGL0 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
YJEFN3A6XGL0 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
YJEFN3A6XGL0 SMPDL3A-201ENST00000368440 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
YJEFN3A6XGL0 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
YJEFN3A6XGL0 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
YJEFN3A6XGL0 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
YJEFN3A6XGL0 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
YJEFN3A6XGL0 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
YJEFN3A6XGL0 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms