Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBT7

CTNNAL1, Alpha-catulin, humanhuman

Predictions only

Length 734 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNAL1Q9UBT7 SLC41A1-201ENST00000367137 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTNNAL1Q9UBT7 CAMKK2-209ENST00000446440 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTNNAL1Q9UBT7 TJP2-208ENST00000535702 3984 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTNNAL1Q9UBT7 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTNNAL1Q9UBT7 PHF3-209ENST00000509330 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTNNAL1Q9UBT7 RNASEH2B-202ENST00000422660 4830 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTNNAL1Q9UBT7 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTNNAL1Q9UBT7 MAP2K1-201ENST00000307102 3410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTNNAL1Q9UBT7 IKBKB-217ENST00000520810 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTNNAL1Q9UBT7 UNC13B-203ENST00000396787 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTNNAL1Q9UBT7 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTNNAL1Q9UBT7 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTNNAL1Q9UBT7 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTNNAL1Q9UBT7 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTNNAL1Q9UBT7 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTNNAL1Q9UBT7 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTNNAL1Q9UBT7 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTNNAL1Q9UBT7 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTNNAL1Q9UBT7 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTNNAL1Q9UBT7 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTNNAL1Q9UBT7 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CTNNAL1Q9UBT7 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTNNAL1Q9UBT7 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTNNAL1Q9UBT7 INHBA-205ENST00000638023 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTNNAL1Q9UBT7 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTNNAL1Q9UBT7 AC005899.8-201ENST00000625127 3153 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTNNAL1Q9UBT7 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTNNAL1Q9UBT7 ADAM15-202ENST00000355956 2877 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTNNAL1Q9UBT7 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTNNAL1Q9UBT7 DNER-201ENST00000341772 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTNNAL1Q9UBT7 UBTF-201ENST00000302904 4997 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTNNAL1Q9UBT7 TRIM65-201ENST00000269383 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTNNAL1Q9UBT7 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTNNAL1Q9UBT7 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTNNAL1Q9UBT7 C17orf53-201ENST00000245382 2272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTNNAL1Q9UBT7 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTNNAL1Q9UBT7 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTNNAL1Q9UBT7 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTNNAL1Q9UBT7 ATXN2L-202ENST00000336783 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTNNAL1Q9UBT7 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTNNAL1Q9UBT7 HNRNPH3-201ENST00000265866 2339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTNNAL1Q9UBT7 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTNNAL1Q9UBT7 LRRFIP1-203ENST00000308482 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CTNNAL1Q9UBT7 DLGAP1-213ENST00000534970 2365 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CTNNAL1Q9UBT7 SLC19A2-201ENST00000236137 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CTNNAL1Q9UBT7 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CTNNAL1Q9UBT7 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CTNNAL1Q9UBT7 MFAP3-201ENST00000322602 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CTNNAL1Q9UBT7 RCAN2-203ENST00000371374 3327 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CTNNAL1Q9UBT7 DRC3-203ENST00000399187 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CTNNAL1Q9UBT7 NDRG4-217ENST00000562999 2931 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CTNNAL1Q9UBT7 ATP6V0A1-203ENST00000393829 3028 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CTNNAL1Q9UBT7 CYP1A1-207ENST00000567032 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CTNNAL1Q9UBT7 ERLIN2-205ENST00000518586 2623 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CTNNAL1Q9UBT7 PNPLA5-204ENST00000593866 2197 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CTNNAL1Q9UBT7 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CTNNAL1Q9UBT7 CHDH-201ENST00000315251 7665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CTNNAL1Q9UBT7 MINDY4-201ENST00000265299 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CTNNAL1Q9UBT7 CHL1-202ENST00000397491 5235 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CTNNAL1Q9UBT7 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CTNNAL1Q9UBT7 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CTNNAL1Q9UBT7 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CTNNAL1Q9UBT7 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CTNNAL1Q9UBT7 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CTNNAL1Q9UBT7 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CTNNAL1Q9UBT7 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CTNNAL1Q9UBT7 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CTNNAL1Q9UBT7 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CTNNAL1Q9UBT7 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CTNNAL1Q9UBT7 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CTNNAL1Q9UBT7 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CTNNAL1Q9UBT7 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CTNNAL1Q9UBT7 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CTNNAL1Q9UBT7 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CTNNAL1Q9UBT7 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CTNNAL1Q9UBT7 OR10AC1-201ENST00000439431 2898 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CTNNAL1Q9UBT7 RUSC1-204ENST00000368352 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CTNNAL1Q9UBT7 SUOX-201ENST00000266971 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CTNNAL1Q9UBT7 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CTNNAL1Q9UBT7 RRP1B-201ENST00000340648 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CTNNAL1Q9UBT7 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CTNNAL1Q9UBT7 CBX3-202ENST00000396386 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CTNNAL1Q9UBT7 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CTNNAL1Q9UBT7 SUCO-204ENST00000608151 5790 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CTNNAL1Q9UBT7 C4A-259ENST00000498271 5269 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CTNNAL1Q9UBT7 SFXN3-201ENST00000224807 3089 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CTNNAL1Q9UBT7 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CTNNAL1Q9UBT7 AC152010.1-201ENST00000415779 2006 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CTNNAL1Q9UBT7 MPP6-201ENST00000222644 8452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CTNNAL1Q9UBT7 CASC2-202ENST00000426021 3232 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CTNNAL1Q9UBT7 USP19-205ENST00000398898 4474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CTNNAL1Q9UBT7 CDKL3-206ENST00000521118 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CTNNAL1Q9UBT7 SETD6-203ENST00000394266 3423 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CTNNAL1Q9UBT7 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CTNNAL1Q9UBT7 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CTNNAL1Q9UBT7 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CTNNAL1Q9UBT7 AC004754.1-201ENST00000600536 2242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CTNNAL1Q9UBT7 CDH20-202ENST00000536675 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CTNNAL1Q9UBT7 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTNNAL1Q9UBT7 MFSD11-211ENST00000588460 3612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.2 ms