Protein–RNA interactions for Protein: Q9P267

MBD5, Methyl-CpG-binding domain protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MBD5Q9P267 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
MBD5Q9P267 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
MBD5Q9P267 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MBD5Q9P267 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MBD5Q9P267 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MBD5Q9P267 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MBD5Q9P267 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MBD5Q9P267 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MBD5Q9P267 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MBD5Q9P267 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MBD5Q9P267 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MBD5Q9P267 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MBD5Q9P267 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MBD5Q9P267 SGCE-204ENST00000428696 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MBD5Q9P267 HDDC2-202ENST00000398153 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MBD5Q9P267 PIK3IP1-202ENST00000402249 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MBD5Q9P267 SNHG14-206ENST00000450809 677 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MBD5Q9P267 APOC1P1-201ENST00000507983 630 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MBD5Q9P267 IKBKB-212ENST00000519735 1166 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MBD5Q9P267 PPFIBP1-204ENST00000535047 875 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MBD5Q9P267 NDUFC1-209ENST00000539002 1198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MBD5Q9P267 NDUFC1-211ENST00000544855 1257 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MBD5Q9P267 MIR4649-201ENST00000582839 64 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
MBD5Q9P267 ZNF772-207ENST00000601768 482 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MBD5Q9P267 ITGA9-AS1-213ENST00000614028 913 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MBD5Q9P267 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MBD5Q9P267 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MBD5Q9P267 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MBD5Q9P267 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MBD5Q9P267 ELOVL1-201ENST00000372458 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MBD5Q9P267 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MBD5Q9P267 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MBD5Q9P267 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MBD5Q9P267 ZFAND2B-205ENST00000409319 771 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MBD5Q9P267 AL109767.1-201ENST00000429450 564 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MBD5Q9P267 LAMA4-208ENST00000431543 1080 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MBD5Q9P267 RPL18AP3-201ENST00000462885 528 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
MBD5Q9P267 AC011773.1-201ENST00000520129 468 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MBD5Q9P267 PLEKHA8P1-203ENST00000545609 277 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MBD5Q9P267 FAM227B-210ENST00000560246 911 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MBD5Q9P267 MIR4522-201ENST00000584932 87 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
MBD5Q9P267 BX537318.1-201ENST00000608290 1207 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MBD5Q9P267 CUTA-215ENST00000611509 1199 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MBD5Q9P267 AC084781.1-201ENST00000613737 656 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
MBD5Q9P267 FXYD6-FXYD2-202ENST00000614497 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MBD5Q9P267 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MBD5Q9P267 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MBD5Q9P267 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MBD5Q9P267 THUMPD3-AS1-212ENST00000520447 1809 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MBD5Q9P267 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MBD5Q9P267 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MBD5Q9P267 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MBD5Q9P267 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MBD5Q9P267 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MBD5Q9P267 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MBD5Q9P267 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MBD5Q9P267 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MBD5Q9P267 LAIR2-201ENST00000301202 699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MBD5Q9P267 CNR1-201ENST00000362094 1252 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MBD5Q9P267 RPP25L-202ENST00000378959 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MBD5Q9P267 AL512430.1-201ENST00000392575 860 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
MBD5Q9P267 AL080250.1-201ENST00000438676 445 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MBD5Q9P267 KRT18P66-201ENST00000452970 1269 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
MBD5Q9P267 IGHV3-37-201ENST00000518544 340 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
MBD5Q9P267 PGAM1P5-201ENST00000548011 764 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
MBD5Q9P267 AC125603.3-201ENST00000550742 486 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MBD5Q9P267 TPGS2-209ENST00000589049 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MBD5Q9P267 MIR6769A-201ENST00000617340 73 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
MBD5Q9P267 HIST1H4A-201ENST00000617569 312 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MBD5Q9P267 AC025262.2-201ENST00000623975 1056 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
MBD5Q9P267 CYP1B1-AS1-221ENST00000627172 995 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MBD5Q9P267 MVK-217ENST00000639206 367 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MBD5Q9P267 AAMP-202ENST00000420660 1761 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MBD5Q9P267 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MBD5Q9P267 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MBD5Q9P267 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MBD5Q9P267 RBM4B-206ENST00000531036 1646 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MBD5Q9P267 OSER1-201ENST00000255174 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MBD5Q9P267 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
MBD5Q9P267 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MBD5Q9P267 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MBD5Q9P267 SLC25A19-205ENST00000442286 1496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MBD5Q9P267 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MBD5Q9P267 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MBD5Q9P267 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MBD5Q9P267 TPM1-202ENST00000288398 1295 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MBD5Q9P267 PRIMA1-201ENST00000316227 1080 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MBD5Q9P267 MBP-201ENST00000354542 575 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MBD5Q9P267 PPDPF-202ENST00000370179 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MBD5Q9P267 SMIM29-202ENST00000394990 792 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MBD5Q9P267 COPS7B-205ENST00000409295 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MBD5Q9P267 RPS9P1-201ENST00000419943 583 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
MBD5Q9P267 TSPY25P-201ENST00000429463 745 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
MBD5Q9P267 UBXN7-AS1-201ENST00000442941 386 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MBD5Q9P267 AP000358.1-201ENST00000456260 156 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
MBD5Q9P267 AP002803.1-201ENST00000528836 498 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
MBD5Q9P267 FANCA-204ENST00000534992 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MBD5Q9P267 BCL2L12-204ENST00000594157 620 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MBD5Q9P267 AC022001.2-201ENST00000607849 580 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MBD5Q9P267 C15orf59-AS1-202ENST00000615095 1224 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.8 ms