Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX08

COMMD8, COMM domain-containing protein 8, humanhuman

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Length 183 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COMMD8Q9NX08 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
COMMD8Q9NX08 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
COMMD8Q9NX08 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
COMMD8Q9NX08 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
COMMD8Q9NX08 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
COMMD8Q9NX08 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
COMMD8Q9NX08 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
COMMD8Q9NX08 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
COMMD8Q9NX08 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
COMMD8Q9NX08 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
COMMD8Q9NX08 HBP1-201ENST00000222574 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
COMMD8Q9NX08 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
COMMD8Q9NX08 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
COMMD8Q9NX08 SPDYE7P-201ENST00000355920 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
COMMD8Q9NX08 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
COMMD8Q9NX08 RPF1-202ENST00000370656 724 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
COMMD8Q9NX08 APOC3-202ENST00000375345 604 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
COMMD8Q9NX08 AC007274.1-201ENST00000439805 662 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
COMMD8Q9NX08 MESTP3-201ENST00000503460 968 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
COMMD8Q9NX08 LYRM9-204ENST00000503642 432 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
COMMD8Q9NX08 MUTYH-237ENST00000531105 501 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
COMMD8Q9NX08 AL391650.2-201ENST00000640097 941 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
COMMD8Q9NX08 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
COMMD8Q9NX08 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
COMMD8Q9NX08 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
COMMD8Q9NX08 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
COMMD8Q9NX08 HTR4-209ENST00000521530 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
COMMD8Q9NX08 ANKRD30BP2-201ENST00000435744 1610 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
COMMD8Q9NX08 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
COMMD8Q9NX08 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
COMMD8Q9NX08 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
COMMD8Q9NX08 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
COMMD8Q9NX08 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
COMMD8Q9NX08 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
COMMD8Q9NX08 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
COMMD8Q9NX08 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
COMMD8Q9NX08 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
COMMD8Q9NX08 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
COMMD8Q9NX08 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
COMMD8Q9NX08 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
COMMD8Q9NX08 ANXA8L1-208ENST00000622769 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
COMMD8Q9NX08 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
COMMD8Q9NX08 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
COMMD8Q9NX08 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
COMMD8Q9NX08 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
COMMD8Q9NX08 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
COMMD8Q9NX08 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
COMMD8Q9NX08 GAL-201ENST00000265643 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
COMMD8Q9NX08 ROPN1-202ENST00000405845 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
COMMD8Q9NX08 MIR1202-201ENST00000408529 83 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
COMMD8Q9NX08 AC113608.2-201ENST00000448379 487 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
COMMD8Q9NX08 XRCC3-210ENST00000554974 575 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
COMMD8Q9NX08 TECR-207ENST00000596073 1170 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
COMMD8Q9NX08 TECR-220ENST00000600083 1204 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
COMMD8Q9NX08 ECM1P1-201ENST00000604092 1279 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
COMMD8Q9NX08 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
COMMD8Q9NX08 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
COMMD8Q9NX08 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
COMMD8Q9NX08 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
COMMD8Q9NX08 POMP-201ENST00000380842 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
COMMD8Q9NX08 AC099850.1-201ENST00000451775 1338 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
COMMD8Q9NX08 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
COMMD8Q9NX08 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
COMMD8Q9NX08 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
COMMD8Q9NX08 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
COMMD8Q9NX08 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
COMMD8Q9NX08 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
COMMD8Q9NX08 MPP1-204ENST00000393531 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
COMMD8Q9NX08 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
COMMD8Q9NX08 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
COMMD8Q9NX08 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
COMMD8Q9NX08 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
COMMD8Q9NX08 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
COMMD8Q9NX08 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
COMMD8Q9NX08 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
COMMD8Q9NX08 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
COMMD8Q9NX08 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
COMMD8Q9NX08 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
COMMD8Q9NX08 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
COMMD8Q9NX08 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
COMMD8Q9NX08 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
COMMD8Q9NX08 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
COMMD8Q9NX08 EDN2-201ENST00000372587 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
COMMD8Q9NX08 TCEAL1-203ENST00000372626 721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
COMMD8Q9NX08 C15orf48-202ENST00000396650 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
COMMD8Q9NX08 IFITM3-201ENST00000399808 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
COMMD8Q9NX08 AL592464.1-201ENST00000429389 429 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
COMMD8Q9NX08 FAM8A4P-201ENST00000435433 1213 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
COMMD8Q9NX08 AL355994.2-201ENST00000447882 704 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
COMMD8Q9NX08 AL590640.2-201ENST00000457038 527 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
COMMD8Q9NX08 FAM162A-202ENST00000469967 1015 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
COMMD8Q9NX08 ROPN1-207ENST00000484329 566 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
COMMD8Q9NX08 PFN2-215ENST00000497148 743 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
COMMD8Q9NX08 FTLP10-202ENST00000505798 471 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
COMMD8Q9NX08 AC106772.2-201ENST00000515085 442 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
COMMD8Q9NX08 MAP1LC3B2-202ENST00000556529 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
COMMD8Q9NX08 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
COMMD8Q9NX08 AC010328.2-201ENST00000597698 1111 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
COMMD8Q9NX08 AC044839.1-204ENST00000634777 1058 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
COMMD8Q9NX08 AL033527.4-201ENST00000641026 673 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
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